33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2304 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3973  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  63.32 
 
 		 1088 aa  1425    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.4327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2304  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  100 
 
 		 1070 aa  2203    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0500689 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2290  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  54.17 
 
 		 1056 aa  1132    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2278  glycoside hydrolase family protein  32.63 
 
 		 1564 aa  569  1e-160  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.467525 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0358  coagulation factor 5/8 type domain protein  30.45 
 
 		 1114 aa  498  1e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1521  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  30.59 
 
 		 1101 aa  488  1e-136  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.285241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2749  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  31.13 
 
 		 1139 aa  481  1e-134  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0806564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1727  glycoside hydrolase family protein  31.13 
 
 		 1137 aa  483  1e-134  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0544172  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1809  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  30.45 
 
 		 1456 aa  477  1e-133  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.440547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3492  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  37.69 
 
 		 987 aa  469  9.999999999999999e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3886  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  37.18 
 
 		 986 aa  464  1e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.754835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0942  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  37.96 
 
 		 960 aa  446  1e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000970619 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1257  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  32.41 
 
 		 1347 aa  446  1e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.618189 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4101  glycoside hydrolase family protein  28.68 
 
 		 1129 aa  446  1e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3535  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  30.89 
 
 		 1100 aa  431  1e-119  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2269  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  35.92 
 
 		 961 aa  409  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1346  hypothetical protein  26.41 
 
 		 991 aa  171  7e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3297  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.1 
 
 		 941 aa  163  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000222307 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4235  glycoside hydrolase family protein  25.59 
 
 		 931 aa  156  2e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1224  hypothetical protein  24.37 
 
 		 879 aa  136  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0550391  normal  0.309414 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1100  hypothetical protein  22.62 
 
 		 1049 aa  127  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1578  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  22.28 
 
 		 954 aa  124  7e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.579068  normal  0.0815371 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3461  hypothetical protein  23.55 
 
 		 840 aa  120  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00828066 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4096  hypothetical protein  23.04 
 
 		 1221 aa  83.2  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29680  hypothetical protein  21.74 
 
 		 899 aa  81.3  0.0000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2094  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  21.41 
 
 		 844 aa  73.9  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000180475  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0666  hypothetical protein  21.46 
 
 		 897 aa  59.3  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000236884  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0165  hypothetical protein  21.93 
 
 		 1006 aa  53.5  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2581  hypothetical protein  28.47 
 
 		 996 aa  52  0.00006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.520562  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1310  Beta-glucuronidase  31.4 
 
 		 588 aa  48.1  0.0008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2037  hypothetical protein  31.4 
 
 		 1319 aa  45.4  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.178109  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2076  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  20.68 
 
 		 1039 aa  45.4  0.006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1218  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  32.64 
 
 		 1041 aa  45.1  0.007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000962199  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>