31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1100 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1100  hypothetical protein  100 
 
 		 1049 aa  2071    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1346  hypothetical protein  31.59 
 
 		 991 aa  209  2e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4235  glycoside hydrolase family protein  22.71 
 
 		 931 aa  198  3e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3297  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  28.11 
 
 		 941 aa  172  2e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000222307 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3492  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.25 
 
 		 987 aa  172  2e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1578  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  22.27 
 
 		 954 aa  167  9e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.579068  normal  0.0815371 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2269  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.29 
 
 		 961 aa  162  3e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1224  hypothetical protein  25.25 
 
 		 879 aa  155  2.9999999999999998e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0550391  normal  0.309414 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3886  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.3 
 
 		 986 aa  155  4e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.754835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3973  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.85 
 
 		 1088 aa  136  1.9999999999999998e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.4327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0942  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.21 
 
 		 960 aa  134  6e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000970619 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2304  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.09 
 
 		 1070 aa  133  2.0000000000000002e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0500689 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2290  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.86 
 
 		 1056 aa  132  4.0000000000000003e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29680  hypothetical protein  30.43 
 
 		 899 aa  130  1.0000000000000001e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2278  glycoside hydrolase family protein  25.09 
 
 		 1564 aa  127  1e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.467525 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3461  hypothetical protein  24.21 
 
 		 840 aa  123  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00828066 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0358  coagulation factor 5/8 type domain protein  24.69 
 
 		 1114 aa  122  3.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2749  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.26 
 
 		 1139 aa  119  3e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0806564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1809  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.56 
 
 		 1456 aa  115  4.0000000000000004e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.440547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4101  glycoside hydrolase family protein  22.37 
 
 		 1129 aa  113  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1727  glycoside hydrolase family protein  26.04 
 
 		 1137 aa  99.4  3e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0544172  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1521  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.45 
 
 		 1101 aa  93.6  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.285241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4096  hypothetical protein  25.86 
 
 		 1221 aa  72.4  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3535  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.33 
 
 		 1100 aa  70.1  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1257  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  21.37 
 
 		 1347 aa  66.2  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.618189 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2076  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.03 
 
 		 1039 aa  58.9  0.0000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0503  hypothetical protein  37.07 
 
 		 610 aa  52.8  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0165  hypothetical protein  22.94 
 
 		 1006 aa  52.8  0.00004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0915  hypothetical protein  22.58 
 
 		 994 aa  48.5  0.0006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1743  glycoside hydrolase family protein  23.9 
 
 		 986 aa  48.1  0.0009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1670  glycoside hydrolase family protein  23.9 
 
 		 986 aa  48.1  0.0009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>