36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3886 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0942  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  38.76 
 
 		 960 aa  637    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000970619 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3492  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  58.34 
 
 		 987 aa  1177    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3886  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  100 
 
 		 986 aa  2041    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.754835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2269  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  37.86 
 
 		 961 aa  619  1e-176  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2278  glycoside hydrolase family protein  38.34 
 
 		 1564 aa  490  1e-137  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.467525 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3973  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  38.2 
 
 		 1088 aa  466  9.999999999999999e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.4327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2304  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  37.18 
 
 		 1070 aa  464  1e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0500689 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0358  coagulation factor 5/8 type domain protein  35.71 
 
 		 1114 aa  426  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1521  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  35.31 
 
 		 1101 aa  422  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.285241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1809  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  33.67 
 
 		 1456 aa  419  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.440547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1727  glycoside hydrolase family protein  35.67 
 
 		 1137 aa  418  9.999999999999999e-116  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0544172  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2290  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  35.61 
 
 		 1056 aa  413  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2749  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  33.22 
 
 		 1139 aa  409  1.0000000000000001e-112  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0806564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4101  glycoside hydrolase family protein  30.24 
 
 		 1129 aa  366  1e-99  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3535  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  32.26 
 
 		 1100 aa  335  3e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1257  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  32.52 
 
 		 1347 aa  323  9.999999999999999e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.618189 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1346  hypothetical protein  27.63 
 
 		 991 aa  255  3e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3297  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.09 
 
 		 941 aa  214  9e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000222307 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4235  glycoside hydrolase family protein  24.92 
 
 		 931 aa  208  3e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1224  hypothetical protein  26.8 
 
 		 879 aa  196  2e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0550391  normal  0.309414 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3461  hypothetical protein  27.12 
 
 		 840 aa  186  2.0000000000000003e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00828066 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1100  hypothetical protein  23.13 
 
 		 1049 aa  150  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1578  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  21.36 
 
 		 954 aa  140  1e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.579068  normal  0.0815371 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4096  hypothetical protein  24.62 
 
 		 1221 aa  102  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2094  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  22.19 
 
 		 844 aa  100  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000180475  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0666  hypothetical protein  22.43 
 
 		 897 aa  92  4e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000236884  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29680  hypothetical protein  19.7 
 
 		 899 aa  72.4  0.00000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2037  hypothetical protein  23.12 
 
 		 1319 aa  67.4  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.178109  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2076  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  21.08 
 
 		 1039 aa  57  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8233  hypothetical protein  22.06 
 
 		 1208 aa  52.4  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2581  hypothetical protein  22.45 
 
 		 996 aa  51.6  0.00006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.520562  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0915  hypothetical protein  20.97 
 
 		 994 aa  50.8  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3281  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  21.98 
 
 		 1163 aa  49.7  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.667094 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0165  hypothetical protein  20.64 
 
 		 1006 aa  49.3  0.0004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1667  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  36.78 
 
 		 858 aa  48.1  0.0007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.611357  normal  0.331093 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0503  hypothetical protein  33.33 
 
 		 610 aa  46.2  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>