38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3492 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3886  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  58.34 
 
 		 986 aa  1177    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.754835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3492  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  100 
 
 		 987 aa  2036    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2269  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  38.77 
 
 		 961 aa  644    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0942  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  37.51 
 
 		 960 aa  616  1e-175  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000970619 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2278  glycoside hydrolase family protein  37.45 
 
 		 1564 aa  479  1e-133  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.467525 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3973  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  37.74 
 
 		 1088 aa  473  1e-132  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.4327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2304  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  37.69 
 
 		 1070 aa  469  9.999999999999999e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0500689 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0358  coagulation factor 5/8 type domain protein  36.78 
 
 		 1114 aa  437  1e-121  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2749  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  34.55 
 
 		 1139 aa  436  1e-121  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0806564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1521  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  36.18 
 
 		 1101 aa  434  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.285241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1809  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  33.49 
 
 		 1456 aa  412  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.440547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2290  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  35.6 
 
 		 1056 aa  412  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1727  glycoside hydrolase family protein  34.81 
 
 		 1137 aa  400  9.999999999999999e-111  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0544172  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4101  glycoside hydrolase family protein  33.33 
 
 		 1129 aa  393  1e-108  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3535  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  32.8 
 
 		 1100 aa  362  2e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1257  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  35.13 
 
 		 1347 aa  360  8e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.618189 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1346  hypothetical protein  27.04 
 
 		 991 aa  228  5.0000000000000005e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4235  glycoside hydrolase family protein  25.84 
 
 		 931 aa  217  9e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3297  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.23 
 
 		 941 aa  214  9e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000222307 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3461  hypothetical protein  26.79 
 
 		 840 aa  191  5e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00828066 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1224  hypothetical protein  25.78 
 
 		 879 aa  187  8e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0550391  normal  0.309414 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1578  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.37 
 
 		 954 aa  179  3e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.579068  normal  0.0815371 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1100  hypothetical protein  23.51 
 
 		 1049 aa  164  9e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2094  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.87 
 
 		 844 aa  118  5e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000180475  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0666  hypothetical protein  22.8 
 
 		 897 aa  101  9e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000236884  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4096  hypothetical protein  23.03 
 
 		 1221 aa  97.4  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29680  hypothetical protein  20.79 
 
 		 899 aa  72  0.00000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2076  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  22.74 
 
 		 1039 aa  69.7  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2037  hypothetical protein  25.69 
 
 		 1319 aa  65.5  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.178109  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0915  hypothetical protein  26.22 
 
 		 994 aa  63.9  0.00000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0165  hypothetical protein  20.21 
 
 		 1006 aa  56.6  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3617  hypothetical protein  31.91 
 
 		 1354 aa  55.1  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.10482  normal  0.364448 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2581  hypothetical protein  20.98 
 
 		 996 aa  53.1  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.520562  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3352  Beta-glucuronidase  38.1 
 
 		 625 aa  53.1  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0530012  normal  0.948257 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2555  hypothetical protein  20.87 
 
 		 1054 aa  52.8  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.291539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4198  glycoside hydrolase family protein  34.78 
 
 		 598 aa  46.6  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.161808  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1667  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  37.35 
 
 		 858 aa  45.4  0.005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.611357  normal  0.331093 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4426  hypothetical protein  28.91 
 
 		 1325 aa  45.1  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.216267 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>