31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3617 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_4426  hypothetical protein  37.99 
 
 
1325 aa  692    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.216267 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2037  hypothetical protein  36.68 
 
 
1319 aa  712    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.178109  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3617  hypothetical protein  100 
 
 
1354 aa  2630    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.10482  normal  0.364448 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3281  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  34.86 
 
 
1163 aa  612  1e-173  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.667094 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8233  hypothetical protein  36.32 
 
 
1208 aa  609  9.999999999999999e-173  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4096  hypothetical protein  26.16 
 
 
1221 aa  214  1e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2076  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  21.33 
 
 
1039 aa  113  3e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2555  hypothetical protein  22.09 
 
 
1054 aa  113  3e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.291539  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0915  hypothetical protein  22.71 
 
 
994 aa  102  5e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1743  glycoside hydrolase family protein  21.8 
 
 
986 aa  99.4  4e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1670  glycoside hydrolase family protein  21.8 
 
 
986 aa  98.6  7e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1224  hypothetical protein  23.66 
 
 
879 aa  91.3  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0550391  normal  0.309414 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0165  hypothetical protein  20.29 
 
 
1006 aa  90.9  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2581  hypothetical protein  20.94 
 
 
996 aa  84.7  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.520562  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE04730  conserved hypothetical protein  22.47 
 
 
1031 aa  80.5  0.0000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3297  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  20.12 
 
 
941 aa  80.9  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000222307 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1346  hypothetical protein  25.26 
 
 
991 aa  79.7  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2094  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  19.28 
 
 
844 aa  67  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000180475  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4235  glycoside hydrolase family protein  21.15 
 
 
931 aa  66.6  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1809  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.6 
 
 
1456 aa  59.3  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.440547  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1578  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  28.57 
 
 
954 aa  59.3  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.579068  normal  0.0815371 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2749  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.01 
 
 
1139 aa  58.2  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0806564  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29680  hypothetical protein  29.3 
 
 
899 aa  57  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2290  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  22.59 
 
 
1056 aa  57  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3461  hypothetical protein  24.61 
 
 
840 aa  57  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00828066 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3492  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  31.91 
 
 
987 aa  55.5  0.000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3886  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  21.29 
 
 
986 aa  48.1  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.754835  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1727  glycoside hydrolase family protein  26 
 
 
1137 aa  47.8  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0544172  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1257  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  23.6 
 
 
1347 aa  47.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.618189 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4101  glycoside hydrolase family protein  24.43 
 
 
1129 aa  47  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2304  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  20.04 
 
 
1070 aa  45.8  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0500689 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>