26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_4426 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_3281  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  36.68 
 
 
1163 aa  665    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.667094 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4426  hypothetical protein  100 
 
 
1325 aa  2634    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.216267 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8233  hypothetical protein  42.98 
 
 
1208 aa  865    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2037  hypothetical protein  44.92 
 
 
1319 aa  1053    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.178109  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3617  hypothetical protein  38.26 
 
 
1354 aa  646    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.10482  normal  0.364448 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4096  hypothetical protein  23.71 
 
 
1221 aa  231  6e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0915  hypothetical protein  24.51 
 
 
994 aa  147  1e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2076  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  22.07 
 
 
1039 aa  134  1.0000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2581  hypothetical protein  22.46 
 
 
996 aa  112  6e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.520562  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1743  glycoside hydrolase family protein  22.99 
 
 
986 aa  98.2  1e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1670  glycoside hydrolase family protein  22.83 
 
 
986 aa  95.9  5e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3461  hypothetical protein  22.85 
 
 
840 aa  87  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00828066 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0165  hypothetical protein  20.71 
 
 
1006 aa  81.6  0.0000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2555  hypothetical protein  20 
 
 
1054 aa  79  0.0000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.291539  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1224  hypothetical protein  22.32 
 
 
879 aa  76.3  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0550391  normal  0.309414 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04730  conserved hypothetical protein  21.68 
 
 
1031 aa  70.5  0.0000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1346  hypothetical protein  26.22 
 
 
991 aa  69.7  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0666  hypothetical protein  22.84 
 
 
897 aa  68.9  0.0000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000236884  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1578  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  19.53 
 
 
954 aa  63.2  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.579068  normal  0.0815371 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6038  conserved hypothetical protein, putative carbohydrate binding domain protein  22.5 
 
 
895 aa  60.1  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.686786  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29680  hypothetical protein  26.69 
 
 
899 aa  56.2  0.000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2290  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  20.84 
 
 
1056 aa  55.1  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3297  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  21.15 
 
 
941 aa  53.9  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000222307 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0942  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  20.88 
 
 
960 aa  48.1  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000970619 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2304  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  20.17 
 
 
1070 aa  47  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0500689 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3492  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  28.91 
 
 
987 aa  45.1  0.009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>