36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_29680 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_29680  hypothetical protein  100 
 
 		 899 aa  1729    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4235  glycoside hydrolase family protein  24.22 
 
 		 931 aa  214  7.999999999999999e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3297  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  28.57 
 
 		 941 aa  212  3e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000222307 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1224  hypothetical protein  28.9 
 
 		 879 aa  208  3e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0550391  normal  0.309414 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3461  hypothetical protein  24.1 
 
 		 840 aa  187  6e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00828066 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1578  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.55 
 
 		 954 aa  170  1e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.579068  normal  0.0815371 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1346  hypothetical protein  32.59 
 
 		 991 aa  155  2.9999999999999998e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1100  hypothetical protein  29.91 
 
 		 1049 aa  143  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2290  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.74 
 
 		 1056 aa  106  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3973  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.7 
 
 		 1088 aa  98.6  5e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.4327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2304  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  22.11 
 
 		 1070 aa  96.7  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0500689 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2037  hypothetical protein  26.64 
 
 		 1319 aa  90.1  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.178109  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2269  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  21.69 
 
 		 961 aa  90.1  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0358  coagulation factor 5/8 type domain protein  21.57 
 
 		 1114 aa  89  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0942  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  21.94 
 
 		 960 aa  85.1  0.000000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000970619 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2749  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  21.78 
 
 		 1139 aa  82.4  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0806564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3492  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  21.55 
 
 		 987 aa  80.5  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3886  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  20.36 
 
 		 986 aa  80.5  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.754835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4096  hypothetical protein  23.79 
 
 		 1221 aa  80.1  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8233  hypothetical protein  29.4 
 
 		 1208 aa  72.4  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1727  glycoside hydrolase family protein  24.34 
 
 		 1137 aa  72  0.00000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0544172  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1809  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  28.53 
 
 		 1456 aa  70.9  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.440547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4426  hypothetical protein  25.34 
 
 		 1325 aa  70.9  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.216267 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1521  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  21.26 
 
 		 1101 aa  69.7  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.285241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2278  glycoside hydrolase family protein  24.9 
 
 		 1564 aa  68.2  0.0000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.467525 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4101  glycoside hydrolase family protein  25.57 
 
 		 1129 aa  63.9  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0165  hypothetical protein  21.59 
 
 		 1006 aa  62.8  0.00000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1257  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  23.39 
 
 		 1347 aa  62  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.618189 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2094  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  17.62 
 
 		 844 aa  61.6  0.00000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000180475  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3535  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.49 
 
 		 1100 aa  61.6  0.00000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3281  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  28.35 
 
 		 1163 aa  61.2  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.667094 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3617  hypothetical protein  25.34 
 
 		 1354 aa  54.7  0.000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.10482  normal  0.364448 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1743  glycoside hydrolase family protein  24.27 
 
 		 986 aa  48.5  0.0005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2581  hypothetical protein  20.08 
 
 		 996 aa  48.1  0.0008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.520562  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1670  glycoside hydrolase family protein  24.27 
 
 		 986 aa  47.8  0.0008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0915  hypothetical protein  23.23 
 
 		 994 aa  45.1  0.006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>