35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2290 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3973  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  51.61 
 
 		 1088 aa  1086    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.4327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2304  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  54.17 
 
 		 1070 aa  1132    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0500689 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2290  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  100 
 
 		 1056 aa  2187    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2278  glycoside hydrolase family protein  32.21 
 
 		 1564 aa  501  1e-140  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.467525 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0358  coagulation factor 5/8 type domain protein  30.26 
 
 		 1114 aa  486  1e-135  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1727  glycoside hydrolase family protein  31.43 
 
 		 1137 aa  462  9.999999999999999e-129  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0544172  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1521  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  29.72 
 
 		 1101 aa  452  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.285241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1809  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  30.37 
 
 		 1456 aa  443  1e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.440547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0942  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  37.3 
 
 		 960 aa  434  1e-120  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000970619 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1257  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  31.53 
 
 		 1347 aa  431  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.618189 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4101  glycoside hydrolase family protein  27.84 
 
 		 1129 aa  425  1e-117  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2269  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  33.87 
 
 		 961 aa  417  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3492  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  35.6 
 
 		 987 aa  412  1e-113  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3886  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  35.61 
 
 		 986 aa  413  1e-113  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.754835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2749  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  29.29 
 
 		 1139 aa  396  1e-108  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0806564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3535  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  29.72 
 
 		 1100 aa  383  1e-105  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1224  hypothetical protein  26.5 
 
 		 879 aa  162  4e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0550391  normal  0.309414 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4235  glycoside hydrolase family protein  25.16 
 
 		 931 aa  160  1e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3297  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.74 
 
 		 941 aa  147  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000222307 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1346  hypothetical protein  26.78 
 
 		 991 aa  141  4.999999999999999e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1578  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.23 
 
 		 954 aa  136  1.9999999999999998e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.579068  normal  0.0815371 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1100  hypothetical protein  23.21 
 
 		 1049 aa  124  6e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3461  hypothetical protein  24.87 
 
 		 840 aa  119  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00828066 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4096  hypothetical protein  23.43 
 
 		 1221 aa  96.7  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29680  hypothetical protein  23.03 
 
 		 899 aa  93.2  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0666  hypothetical protein  21.31 
 
 		 897 aa  85.5  0.000000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000236884  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2094  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  22.06 
 
 		 844 aa  74.3  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000180475  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0165  hypothetical protein  22.05 
 
 		 1006 aa  62.4  0.00000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2037  hypothetical protein  21.17 
 
 		 1319 aa  55.1  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.178109  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2076  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  21.71 
 
 		 1039 aa  50.4  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4426  hypothetical protein  20.99 
 
 		 1325 aa  50.1  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.216267 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0503  hypothetical protein  28.87 
 
 		 610 aa  48.5  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3617  hypothetical protein  27.51 
 
 		 1354 aa  47.4  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.10482  normal  0.364448 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2082  Beta-glucuronidase  33.68 
 
 		 600 aa  44.7  0.009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.177163  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2581  hypothetical protein  26.6 
 
 		 996 aa  44.7  0.01  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.520562  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>