40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1578 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1578  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  100 
 
 		 954 aa  1979    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.579068  normal  0.0815371 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3297  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.21 
 
 		 941 aa  261  3e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000222307 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4235  glycoside hydrolase family protein  23.65 
 
 		 931 aa  219  2e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1346  hypothetical protein  28.01 
 
 		 991 aa  195  4e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1224  hypothetical protein  24.45 
 
 		 879 aa  179  3e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0550391  normal  0.309414 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3492  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.37 
 
 		 987 aa  179  3e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3461  hypothetical protein  25.14 
 
 		 840 aa  176  1.9999999999999998e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00828066 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1100  hypothetical protein  22.02 
 
 		 1049 aa  160  8e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0942  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.24 
 
 		 960 aa  149  3e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000970619 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29680  hypothetical protein  24 
 
 		 899 aa  147  1e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2269  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  22.47 
 
 		 961 aa  146  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2278  glycoside hydrolase family protein  21.96 
 
 		 1564 aa  143  9.999999999999999e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.467525 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3886  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  21.36 
 
 		 986 aa  140  1e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.754835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2290  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.23 
 
 		 1056 aa  136  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3973  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  22.47 
 
 		 1088 aa  125  3e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.4327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2304  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  22.28 
 
 		 1070 aa  124  6e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0500689 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1521  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  21.08 
 
 		 1101 aa  117  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.285241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4101  glycoside hydrolase family protein  23.24 
 
 		 1129 aa  116  2.0000000000000002e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2037  hypothetical protein  22.91 
 
 		 1319 aa  115  4.0000000000000004e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.178109  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1809  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  22.61 
 
 		 1456 aa  114  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.440547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4096  hypothetical protein  22.8 
 
 		 1221 aa  113  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2749  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  22.2 
 
 		 1139 aa  107  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0806564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0358  coagulation factor 5/8 type domain protein  20.61 
 
 		 1114 aa  102  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1727  glycoside hydrolase family protein  21.31 
 
 		 1137 aa  99.4  3e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0544172  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2581  hypothetical protein  23.99 
 
 		 996 aa  98.2  7e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.520562  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0915  hypothetical protein  22.38 
 
 		 994 aa  90.1  2e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1257  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  21.04 
 
 		 1347 aa  87.4  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.618189 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1670  glycoside hydrolase family protein  23.68 
 
 		 986 aa  73.2  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1743  glycoside hydrolase family protein  23.68 
 
 		 986 aa  72.8  0.00000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2076  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  22.33 
 
 		 1039 aa  72.4  0.00000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0165  hypothetical protein  21.86 
 
 		 1006 aa  71.2  0.00000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3535  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.32 
 
 		 1100 aa  67  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2555  hypothetical protein  21.89 
 
 		 1054 aa  64.7  0.000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.291539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4426  hypothetical protein  19.3 
 
 		 1325 aa  60.1  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.216267 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3617  hypothetical protein  28.57 
 
 		 1354 aa  59.3  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.10482  normal  0.364448 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8233  hypothetical protein  20.99 
 
 		 1208 aa  51.2  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04730  conserved hypothetical protein  23.96 
 
 		 1031 aa  50.1  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0666  hypothetical protein  19.68 
 
 		 897 aa  45.8  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000236884  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0503  hypothetical protein  23.85 
 
 		 610 aa  45.4  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2094  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  18.03 
 
 		 844 aa  44.3  0.01  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000180475  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>