More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0503 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0503  hypothetical protein  100 
 
 		 610 aa  1193    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1083  protein of unknown function DUF214  27.23 
 
 		 407 aa  74.3  0.000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4614  protein of unknown function DUF214  25.21 
 
 		 801 aa  74.3  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.122129 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3792  protein of unknown function DUF214  27.98 
 
 		 418 aa  72  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.707734  normal  0.102033 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2247  protein of unknown function DUF214  29.46 
 
 		 805 aa  72  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2278  glycoside hydrolase family protein  37.39 
 
 		 1564 aa  65.9  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.467525 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2178  protein of unknown function DUF214  28.33 
 
 		 790 aa  61.6  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.424889 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4595  protein of unknown function DUF214  25.76 
 
 		 800 aa  60.5  0.00000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0584  hypothetical protein  34.65 
 
 		 404 aa  60.5  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.585945  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2493  protein of unknown function DUF214  24.94 
 
 		 401 aa  58.9  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0569  hypothetical protein  34.65 
 
 		 404 aa  59.7  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.883342  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5372  ABC transporter, permease protein  37.84 
 
 		 400 aa  58.5  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4935  ABC transporter, permease  37.84 
 
 		 399 aa  58.5  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4950  ABC transporter, permease  37.84 
 
 		 400 aa  58.5  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0219  protein of unknown function DUF214  35.67 
 
 		 397 aa  58.9  0.0000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.405148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0947  protein of unknown function DUF214  23.65 
 
 		 805 aa  58.5  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.163703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5578  ABC transporter, permease  39.19 
 
 		 400 aa  58.9  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.707712 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5426  ABC transporter, permease  37.84 
 
 		 400 aa  58.5  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5345  ABC transporter, permease  37.84 
 
 		 400 aa  58.5  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1040  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  24.54 
 
 		 648 aa  58.2  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00510496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0943  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  25.95 
 
 		 648 aa  58.2  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.483741  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1060  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  25.95 
 
 		 648 aa  58.2  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.964805  normal  0.854638 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1009  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  25.95 
 
 		 648 aa  58.2  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.351129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0977  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  25.95 
 
 		 648 aa  58.2  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00884  fused macrolide transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding component/membrane component  24.54 
 
 		 648 aa  58.2  0.0000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.75257  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2763  ABC transporter related protein  24.54 
 
 		 648 aa  58.2  0.0000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0279159  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2281  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  24.54 
 
 		 648 aa  58.2  0.0000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000297537  normal  0.0300629 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2717  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  24.54 
 
 		 648 aa  58.2  0.0000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3785  hypothetical protein  37.84 
 
 		 398 aa  57.8  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0983  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  24.54 
 
 		 648 aa  58.2  0.0000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0183983  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00890  hypothetical protein  24.54 
 
 		 648 aa  58.2  0.0000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.646648  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2450  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  24.54 
 
 		 648 aa  58.2  0.0000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0569677  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1040  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  25.95 
 
 		 648 aa  58.2  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.38089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1534  protein of unknown function DUF214  31.4 
 
 		 421 aa  57.8  0.0000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5378  ABC transporter permease protein  37.84 
 
 		 400 aa  57.8  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0697  protein of unknown function DUF214  27 
 
 		 401 aa  57.8  0.0000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2588  protein of unknown function DUF214  26.32 
 
 		 400 aa  57.4  0.0000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000760178  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0999  protein of unknown function DUF214  36.56 
 
 		 417 aa  57.4  0.0000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000110671 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1636  protein of unknown function DUF214  33.88 
 
 		 421 aa  57.4  0.0000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2283  permease, putative  21.79 
 
 		 412 aa  56.6  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.14949  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0710  macrolide-specific efflux protein macB  37.68 
 
 		 641 aa  56.6  0.000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5104  ABC transporter permease  37.84 
 
 		 399 aa  57  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5048  hypothetical protein  37.84 
 
 		 399 aa  56.6  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5495  ABC transporter permease  37.84 
 
 		 399 aa  57  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0636  macrolide-specific efflux protein macB  37.68 
 
 		 641 aa  56.6  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00901082  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1063  macrolide-specific efflux protein macB  37.68 
 
 		 641 aa  55.8  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.00606621  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2832  syringolide efflux protein SyfD  25 
 
 		 668 aa  56.2  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.237626  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0476  ABC transporter, permease protein  36.49 
 
 		 399 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0918  ABC transporter, ATP-binding protein  31.18 
 
 		 643 aa  56.2  0.000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1727  glycoside hydrolase family protein  35.96 
 
 		 1137 aa  55.8  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0544172  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0738  protein of unknown function DUF214  27.52 
 
 		 408 aa  55.8  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1671  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  27.18 
 
 		 648 aa  55.8  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.942094 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1396  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  37.84 
 
 		 646 aa  55.8  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0900334 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  24.9 
 
 		 391 aa  55.5  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2215  hypothetical protein  33.33 
 
 		 651 aa  55.1  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000167589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3455  ABC transporter related  41.79 
 
 		 656 aa  55.1  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.016844  normal  0.0104011 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3170  ABC transporter related  26.42 
 
 		 647 aa  54.7  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.018636  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4623  protein of unknown function DUF214  26.34 
 
 		 808 aa  54.7  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.417059 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0821  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  41.79 
 
 		 656 aa  54.7  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2618  ABC transporter  32.14 
 
 		 653 aa  54.7  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.094569  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4617  protein of unknown function DUF214  25 
 
 		 792 aa  54.3  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.214222 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4156  ABC transporter, inner membrane subunit  35.65 
 
 		 420 aa  54.3  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0813  hypothetical protein  21.15 
 
 		 402 aa  54.3  0.000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2458  hypothetical protein  32.58 
 
 		 394 aa  53.9  0.000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4309  protein of unknown function DUF214  35.65 
 
 		 420 aa  53.9  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.965223  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1359  permease, putative  42.86 
 
 		 415 aa  53.1  0.00001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00178118  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0724  hypothetical protein  24.52 
 
 		 687 aa  53.5  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.798634  normal  0.150655 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1792  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  24.08 
 
 		 653 aa  53.5  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.855927  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4631  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.23 
 
 		 419 aa  53.1  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4954  ABC transporter related  25 
 
 		 681 aa  53.5  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0415826  normal  0.0801144 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5332  ABC transporter related  25 
 
 		 681 aa  53.5  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0305255 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2074  protein of unknown function DUF214  25.53 
 
 		 405 aa  53.5  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1834  ABC transporter related  30.93 
 
 		 696 aa  53.5  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000402561  unclonable  0.00000000113397 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4287  protein of unknown function DUF214  35.65 
 
 		 420 aa  53.5  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0758  ABC transporter permease  26.27 
 
 		 391 aa  52.4  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0707  ABC transporter, permease  26.27 
 
 		 391 aa  52.4  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2971  hypothetical protein  36.78 
 
 		 412 aa  53.1  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0797  ABC transporter permease  26.27 
 
 		 391 aa  52.4  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2316  ABC transporter related  40.62 
 
 		 648 aa  52.8  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.999861  normal  0.49584 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0801  ABC transporter related  37.31 
 
 		 667 aa  52.8  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00129194  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0608  ABC transporter related  35.82 
 
 		 648 aa  52.4  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0652  hypothetical protein  40.28 
 
 		 393 aa  52.8  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3535  ABC transporter related  37.31 
 
 		 682 aa  52.8  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000291917  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0826  ABC transporter related  37.31 
 
 		 682 aa  52.8  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.018784  hitchhiker  0.00000000432999 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0636  ABC transporter related  35.82 
 
 		 648 aa  52.4  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0833  ABC transporter related  37.31 
 
 		 667 aa  52.8  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.337791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1100  hypothetical protein  37.07 
 
 		 1049 aa  52.4  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4297  hypothetical protein  34.78 
 
 		 420 aa  52  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105525  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0693  ABC transporter, permease  36 
 
 		 391 aa  52  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0496  ATPase  37.88 
 
 		 670 aa  52  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0210  protein of unknown function DUF214  42.86 
 
 		 409 aa  52  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0892  putative ABC transporter, permease protein  26.73 
 
 		 383 aa  52  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.93003e-35 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0928  protein of unknown function DUF214  24.23 
 
 		 800 aa  52  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4486  putative ABC transporter, permease protein  26.22 
 
 		 391 aa  52  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000433037 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3535  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  36.29 
 
 		 1100 aa  52  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5431  protein of unknown function DUF214  28.57 
 
 		 800 aa  52  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.109998 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2610  protein of unknown function DUF214  36.84 
 
 		 395 aa  52.4  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.899676  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1552  protein of unknown function DUF214  36.49 
 
 		 397 aa  52  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00448084  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0850  putative ABC transporter, permease protein  36 
 
 		 384 aa  52  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  30.99 
 
 		 642 aa  51.6  0.00004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>