More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2493 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_2493  protein of unknown function DUF214  100 
 
 
401 aa  785    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2509  protein of unknown function DUF214  55.17 
 
 
399 aa  358  9.999999999999999e-98  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.913373  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1083  protein of unknown function DUF214  47.12 
 
 
407 aa  333  2e-90  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1955  protein of unknown function DUF214  43.27 
 
 
406 aa  288  1e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.173314  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3792  protein of unknown function DUF214  30.21 
 
 
418 aa  98.6  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.707734  normal  0.102033 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0469  protein of unknown function DUF214  22.76 
 
 
405 aa  97.1  5e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0457  protein of unknown function DUF214  29.04 
 
 
407 aa  96.7  7e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00555  ABC transporter efflux protein  24.64 
 
 
417 aa  90.9  4e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.29728  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4309  protein of unknown function DUF214  28.2 
 
 
420 aa  90.5  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.965223  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4376  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.94 
 
 
437 aa  90.1  5e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4156  ABC transporter, inner membrane subunit  28.38 
 
 
420 aa  90.1  6e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4287  protein of unknown function DUF214  27.83 
 
 
420 aa  89.4  9e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1460  hypothetical protein  22.99 
 
 
415 aa  89  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0813  hypothetical protein  24.88 
 
 
402 aa  88.6  2e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2283  permease, putative  24.51 
 
 
412 aa  87.8  3e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.14949  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1336  ABC transporter efflux protein  24.82 
 
 
421 aa  87  5e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0682  ABC transporter, permease protein  24.04 
 
 
404 aa  86.7  8e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.834808  normal  0.683549 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1555  protein of unknown function DUF214  23.15 
 
 
415 aa  86.3  8e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.386006  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3939  protein of unknown function DUF214  24.42 
 
 
414 aa  85.5  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0652  hypothetical protein  24.32 
 
 
393 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2570  protein of unknown function DUF214  25.29 
 
 
413 aa  85.1  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.355238 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2316  ABC transporter related  26.23 
 
 
648 aa  85.1  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.999861  normal  0.49584 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4653  protein of unknown function DUF214  23.21 
 
 
413 aa  84.7  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01125  ABC transporter, permease protein, putative  37.14 
 
 
419 aa  84.3  0.000000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1721  protein of unknown function DUF214  25.47 
 
 
406 aa  84  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1668  hypothetical protein  23.58 
 
 
414 aa  84.3  0.000000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1180  hypothetical protein  24.59 
 
 
412 aa  84  0.000000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4377  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23.76 
 
 
411 aa  82.8  0.000000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0826  ABC transporter related  24.59 
 
 
682 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.018784  hitchhiker  0.00000000432999 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0801  ABC transporter related  24.76 
 
 
667 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00129194  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3535  ABC transporter related  24.59 
 
 
682 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000291917  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3455  ABC transporter related  24.66 
 
 
656 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.016844  normal  0.0104011 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1669  hypothetical protein  24.83 
 
 
421 aa  82.8  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0833  ABC transporter related  24.76 
 
 
667 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.337791  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02570  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  23.19 
 
 
417 aa  81.6  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000358315  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1627  ABC transporter-related protein  26.48 
 
 
658 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2971  hypothetical protein  26.1 
 
 
412 aa  80.9  0.00000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1534  protein of unknown function DUF214  23.82 
 
 
421 aa  80.9  0.00000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0456  protein of unknown function DUF214  23.72 
 
 
412 aa  80.5  0.00000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1636  protein of unknown function DUF214  23.22 
 
 
421 aa  80.5  0.00000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2937  ABC transporter related  25.3 
 
 
668 aa  80.1  0.00000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.697708  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3444  ABC transporter related  25.3 
 
 
668 aa  80.1  0.00000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.625414  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01130  putative ABC transporter  22.14 
 
 
414 aa  79.3  0.0000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.95272  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0394  ABC transporter related  25.37 
 
 
652 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0759  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  21.73 
 
 
641 aa  78.6  0.0000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.043367  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0888  ABC transporter, permease protein, putative  24.56 
 
 
391 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0821  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  24.1 
 
 
656 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0693  ABC transporter, permease  24.63 
 
 
391 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1412  hypothetical protein  28.67 
 
 
400 aa  77.8  0.0000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  22.33 
 
 
405 aa  77.8  0.0000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2926  hypothetical protein  25.15 
 
 
394 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.019889  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1060  protein of unknown function DUF214  26.5 
 
 
410 aa  78.2  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4848  hypothetical protein  23.92 
 
 
413 aa  77.4  0.0000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0956312  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0708  hypothetical protein  24.44 
 
 
383 aa  77  0.0000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4631  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23.56 
 
 
419 aa  76.6  0.0000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2147  hypothetical protein  27.63 
 
 
419 aa  76.3  0.0000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0010107  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0892  putative ABC transporter, permease protein  24.5 
 
 
383 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.93003e-35 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2832  syringolide efflux protein SyfD  24.27 
 
 
668 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.237626  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0758  ABC transporter permease  24.5 
 
 
391 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0707  ABC transporter, permease  24.5 
 
 
391 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1081  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  21.9 
 
 
640 aa  75.9  0.000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0797  ABC transporter permease  24.5 
 
 
391 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1792  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  26.57 
 
 
653 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.855927  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1668  hypothetical protein  23.28 
 
 
421 aa  75.5  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1724  protein of unknown function DUF214  22.74 
 
 
406 aa  75.9  0.000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000472644  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1671  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  24.49 
 
 
648 aa  76.3  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.942094 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3520  protein of unknown function DUF214  25.42 
 
 
416 aa  75.5  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0642417  normal  0.207368 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0835  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  25.06 
 
 
653 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.077145  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0850  putative ABC transporter, permease protein  27.34 
 
 
384 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4297  hypothetical protein  26.63 
 
 
420 aa  75.5  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105525  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  26.81 
 
 
653 aa  75.1  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4414  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.57 
 
 
413 aa  75.1  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4486  putative ABC transporter, permease protein  27.02 
 
 
391 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000433037 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4500  protein of unknown function DUF214  24.16 
 
 
403 aa  74.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0926  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  25.74 
 
 
653 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2185  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  25.74 
 
 
653 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2215  hypothetical protein  22.41 
 
 
651 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000167589  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4939  protein of unknown function DUF214  23.89 
 
 
406 aa  74.7  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.485903  normal  0.767822 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0037  export ABC transporter permease protein  24.47 
 
 
397 aa  74.7  0.000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3782  ABC transporter related  41.27 
 
 
654 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.972642  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0989  ABC transporter efflux protein  23.75 
 
 
404 aa  74.3  0.000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.150458  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0080  ABC transporter permease  25.24 
 
 
407 aa  73.9  0.000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1359  permease, putative  22.97 
 
 
415 aa  73.6  0.000000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00178118  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1780  protein of unknown function DUF214  22.49 
 
 
413 aa  73.6  0.000000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1640  hypothetical protein  38.57 
 
 
408 aa  73.6  0.000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0960  putative ABC transporter, permease protein  24.32 
 
 
383 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1604  hypothetical protein  22.43 
 
 
443 aa  73.6  0.000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3129  protein of unknown function DUF214  23.17 
 
 
406 aa  73.2  0.000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02560  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  37.21 
 
 
406 aa  72.8  0.000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000006972  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04780  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  30.91 
 
 
427 aa  72.8  0.000000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.531977  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2588  protein of unknown function DUF214  25.33 
 
 
400 aa  72.4  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000760178  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3187  hypothetical protein  27.46 
 
 
400 aa  72.4  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2148  hypothetical protein  24.6 
 
 
408 aa  72.8  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0327906 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1812  hypothetical protein  23.42 
 
 
401 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08461  putative ABC transporter  20.86 
 
 
409 aa  72.4  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.825972  hitchhiker  0.00227994 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1870  protein of unknown function DUF214  29.64 
 
 
398 aa  72.4  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15441  putative ABC transporter  21.33 
 
 
409 aa  72.4  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1834  ABC transporter related  22.59 
 
 
696 aa  72.4  0.00000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000402561  unclonable  0.00000000113397 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2870  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  34.44 
 
 
663 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.876991  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1862  ABC transporter-related protein  24.57 
 
 
646 aa  72  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>