More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1083 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1083  protein of unknown function DUF214  100 
 
 		 407 aa  796    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1955  protein of unknown function DUF214  50.12 
 
 		 406 aa  323  4e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.173314  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2493  protein of unknown function DUF214  46.86 
 
 		 401 aa  318  2e-85  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2509  protein of unknown function DUF214  47.33 
 
 		 399 aa  274  2.0000000000000002e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.913373  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3792  protein of unknown function DUF214  31.24 
 
 		 418 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.707734  normal  0.102033 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0469  protein of unknown function DUF214  23.33 
 
 		 405 aa  97.1  5e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2926  hypothetical protein  26.29 
 
 		 394 aa  91.3  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.019889  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0652  hypothetical protein  24.22 
 
 		 393 aa  86.7  6e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0813  hypothetical protein  24.42 
 
 		 402 aa  83.6  0.000000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1552  protein of unknown function DUF214  24 
 
 		 397 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00448084  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1060  protein of unknown function DUF214  26.11 
 
 		 410 aa  82  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1460  hypothetical protein  22.77 
 
 		 415 aa  81.3  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4653  protein of unknown function DUF214  25.36 
 
 		 413 aa  81.3  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4631  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.3 
 
 		 419 aa  80.5  0.00000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2281  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  26.11 
 
 		 648 aa  80.5  0.00000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000297537  normal  0.0300629 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00884  fused macrolide transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding component/membrane component  26.11 
 
 		 648 aa  79.7  0.00000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.75257  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2763  ABC transporter related protein  26.11 
 
 		 648 aa  79.7  0.00000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0279159  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2717  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  26.11 
 
 		 648 aa  79.7  0.00000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1040  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  26.11 
 
 		 648 aa  79.7  0.00000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00510496  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00890  hypothetical protein  26.11 
 
 		 648 aa  79.7  0.00000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.646648  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0983  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  26.11 
 
 		 648 aa  79.7  0.00000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0183983  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2283  permease, putative  23.56 
 
 		 412 aa  78.6  0.0000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.14949  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2450  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  26.11 
 
 		 648 aa  79  0.0000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0569677  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1009  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  27.27 
 
 		 648 aa  77.8  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.351129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0977  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  27.27 
 
 		 648 aa  77.4  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0943  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  27.27 
 
 		 648 aa  77.8  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.483741  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2618  ABC transporter  24.88 
 
 		 653 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.094569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1060  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  27.03 
 
 		 648 aa  76.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.964805  normal  0.854638 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0456  protein of unknown function DUF214  35.29 
 
 		 412 aa  75.9  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1040  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  27.03 
 
 		 648 aa  75.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.38089  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2588  protein of unknown function DUF214  22.33 
 
 		 400 aa  75.1  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000760178  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0457  protein of unknown function DUF214  25.68 
 
 		 407 aa  75.1  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2971  hypothetical protein  26.28 
 
 		 412 aa  75.1  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2215  protein of unknown function DUF214  25.71 
 
 		 402 aa  74.3  0.000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.556165  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1669  hypothetical protein  23.98 
 
 		 421 aa  74.7  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1396  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  24.94 
 
 		 646 aa  74.3  0.000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0900334 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02560  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  34.39 
 
 		 406 aa  74.7  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000006972  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1359  permease, putative  25.25 
 
 		 415 aa  73.9  0.000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00178118  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0693  ABC transporter, permease  32.07 
 
 		 391 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1555  protein of unknown function DUF214  23.58 
 
 		 415 aa  73.9  0.000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.386006  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3519  protein of unknown function DUF214  25.46 
 
 		 416 aa  73.6  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.225235  normal  0.132299 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0888  ABC transporter, permease protein, putative  32.07 
 
 		 391 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0758  ABC transporter permease  32.6 
 
 		 391 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0707  ABC transporter, permease  32.6 
 
 		 391 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0960  putative ABC transporter, permease protein  32.07 
 
 		 383 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0797  ABC transporter permease  32.6 
 
 		 391 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2610  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  24.59 
 
 		 649 aa  73.6  0.000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4486  putative ABC transporter, permease protein  32.6 
 
 		 391 aa  73.6  0.000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000433037 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0850  putative ABC transporter, permease protein  32.6 
 
 		 384 aa  73.2  0.000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0892  putative ABC transporter, permease protein  31.64 
 
 		 383 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.93003e-35 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2695  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  24.59 
 
 		 649 aa  73.2  0.000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2832  syringolide efflux protein SyfD  24.12 
 
 		 668 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.237626  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01125  ABC transporter, permease protein, putative  35.16 
 
 		 419 aa  72.4  0.00000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0476  ABC transporter, permease protein  23.78 
 
 		 399 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  35.16 
 
 		 405 aa  72.8  0.00000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0622  ABC transporter related  23 
 
 		 657 aa  72.8  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00774379  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4210  efflux ABC transporter ATP-binding protein  24.23 
 
 		 654 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.875938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1627  ABC transporter-related protein  25.86 
 
 		 658 aa  71.6  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4376  ABC efflux pump, inner membrane subunit  22.56 
 
 		 437 aa  71.6  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3283  ABC transporter related  26.22 
 
 		 666 aa  72  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.477638  normal  0.90811 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0682  ABC transporter, permease protein  34.65 
 
 		 404 aa  71.2  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.834808  normal  0.683549 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5048  hypothetical protein  24.31 
 
 		 399 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2458  hypothetical protein  24.08 
 
 		 394 aa  71.2  0.00000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1025  protein of unknown function DUF214  26.02 
 
 		 397 aa  71.2  0.00000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.347391 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2316  ABC transporter related  24.57 
 
 		 648 aa  71.2  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.999861  normal  0.49584 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1006  ABC transporter related protein  22.07 
 
 		 649 aa  70.5  0.00000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1604  hypothetical protein  22.2 
 
 		 443 aa  70.5  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1792  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  24.82 
 
 		 653 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.855927  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0708  hypothetical protein  33.13 
 
 		 383 aa  69.7  0.00000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1721  protein of unknown function DUF214  24.18 
 
 		 406 aa  68.9  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1791  ABC transporter, permease protein  23.71 
 
 		 394 aa  68.9  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1534  protein of unknown function DUF214  26.82 
 
 		 421 aa  68.9  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5104  ABC transporter permease  25.17 
 
 		 399 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00555  ABC transporter efflux protein  21.59 
 
 		 417 aa  68.6  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.29728  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5495  ABC transporter permease  25.17 
 
 		 399 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1761  hypothetical protein  21.81 
 
 		 402 aa  68.6  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000119528  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1081  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  31.25 
 
 		 640 aa  68.6  0.0000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4377  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23.96 
 
 		 411 aa  68.6  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2570  protein of unknown function DUF214  21.26 
 
 		 413 aa  68.2  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.355238 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0306  ABC transporter related  27.13 
 
 		 707 aa  68.2  0.0000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.114507  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3782  ABC transporter related  24.7 
 
 		 654 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.972642  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0769  ABC transporter related  21.99 
 
 		 650 aa  67.8  0.0000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.419692  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3455  ABC transporter related  24.34 
 
 		 656 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.016844  normal  0.0104011 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0999  protein of unknown function DUF214  27.37 
 
 		 417 aa  68.2  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000110671 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3939  protein of unknown function DUF214  29.38 
 
 		 414 aa  67.8  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1668  hypothetical protein  31.65 
 
 		 421 aa  67.4  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0016  ABC transporter, permease protein  22.89 
 
 		 398 aa  67  0.0000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2074  protein of unknown function DUF214  34.4 
 
 		 405 aa  67.4  0.0000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02570  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  37.24 
 
 		 417 aa  67.4  0.0000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000358315  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1668  hypothetical protein  22.76 
 
 		 414 aa  67  0.0000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1671  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  36.8 
 
 		 648 aa  67.4  0.0000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.942094 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0584  hypothetical protein  37.5 
 
 		 404 aa  67  0.0000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.585945  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0569  hypothetical protein  37.5 
 
 		 404 aa  67  0.0000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.883342  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0903  protein of unknown function DUF214  27.58 
 
 		 416 aa  67  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.166899  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01130  putative ABC transporter  32.06 
 
 		 414 aa  66.6  0.0000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.95272  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  22.2 
 
 		 391 aa  66.6  0.0000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5345  ABC transporter, permease  30.9 
 
 		 400 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2159  macrolide ABC efflux protein  24.88 
 
 		 656 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.103755  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1969  ABC transporter  24.38 
 
 		 657 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.598112  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4954  ABC transporter related  26.34 
 
 		 681 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0415826  normal  0.0801144 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>