36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4235 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4235  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 931 aa  1912    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3297  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  45.4 
 
 		 941 aa  812    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000222307 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1346  hypothetical protein  35.13 
 
 		 991 aa  549  1e-154  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3461  hypothetical protein  42.25 
 
 		 840 aa  540  9.999999999999999e-153  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00828066 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1224  hypothetical protein  40.9 
 
 		 879 aa  514  1e-144  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0550391  normal  0.309414 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2269  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.6 
 
 		 961 aa  244  5e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0942  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.44 
 
 		 960 aa  235  3e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000970619 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1578  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.65 
 
 		 954 aa  219  2e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.579068  normal  0.0815371 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3492  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.84 
 
 		 987 aa  217  8e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3886  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.92 
 
 		 986 aa  208  3e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.754835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0358  coagulation factor 5/8 type domain protein  27.47 
 
 		 1114 aa  200  1.0000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1100  hypothetical protein  22.81 
 
 		 1049 aa  189  3e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1521  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.61 
 
 		 1101 aa  184  8.000000000000001e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.285241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29680  hypothetical protein  24 
 
 		 899 aa  182  2e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2278  glycoside hydrolase family protein  26.74 
 
 		 1564 aa  182  2e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.467525 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1727  glycoside hydrolase family protein  26.65 
 
 		 1137 aa  181  4.999999999999999e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0544172  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3973  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.55 
 
 		 1088 aa  173  1e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.4327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2290  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.16 
 
 		 1056 aa  160  1e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1809  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.96 
 
 		 1456 aa  157  1e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.440547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2304  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.59 
 
 		 1070 aa  156  2e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0500689 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2749  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.97 
 
 		 1139 aa  155  2.9999999999999998e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0806564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4101  glycoside hydrolase family protein  25.22 
 
 		 1129 aa  150  1.0000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3535  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.94 
 
 		 1100 aa  134  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1257  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  22.17 
 
 		 1347 aa  107  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.618189 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2094  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  22.66 
 
 		 844 aa  103  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000180475  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0666  hypothetical protein  20.2 
 
 		 897 aa  78.6  0.0000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000236884  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0165  hypothetical protein  22.59 
 
 		 1006 aa  77.4  0.000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2076  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  21.39 
 
 		 1039 aa  77  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2555  hypothetical protein  21.98 
 
 		 1054 aa  70.5  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.291539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4096  hypothetical protein  21.73 
 
 		 1221 aa  69.3  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2037  hypothetical protein  20.12 
 
 		 1319 aa  68.6  0.0000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.178109  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3617  hypothetical protein  21.15 
 
 		 1354 aa  60.1  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.10482  normal  0.364448 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6038  conserved hypothetical protein, putative carbohydrate binding domain protein  19.94 
 
 		 895 aa  50.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.686786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1743  glycoside hydrolase family protein  22.97 
 
 		 986 aa  50.1  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1670  glycoside hydrolase family protein  22.97 
 
 		 986 aa  49.7  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0915  hypothetical protein  20.68 
 
 		 994 aa  47  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>