19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6038 on replicon NC_012852
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012852  Rleg_6038  conserved hypothetical protein, putative carbohydrate binding domain protein  100 
 
 		 895 aa  1824    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.686786  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2076  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  20.76 
 
 		 1039 aa  95.1  5e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0915  hypothetical protein  21.25 
 
 		 994 aa  78.2  0.0000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2555  hypothetical protein  19.33 
 
 		 1054 aa  73.9  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.291539  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04730  conserved hypothetical protein  21.29 
 
 		 1031 aa  73.2  0.00000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0666  hypothetical protein  20.29 
 
 		 897 aa  69.7  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000236884  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2581  hypothetical protein  22.42 
 
 		 996 aa  65.1  0.000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.520562  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0165  hypothetical protein  22.27 
 
 		 1006 aa  64.3  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2094  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  20.14 
 
 		 844 aa  62.8  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000180475  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4426  hypothetical protein  22.5 
 
 		 1325 aa  60.1  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.216267 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1743  glycoside hydrolase family protein  29.52 
 
 		 986 aa  59.3  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1670  glycoside hydrolase family protein  28.57 
 
 		 986 aa  58.2  0.0000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2037  hypothetical protein  20.65 
 
 		 1319 aa  57.8  0.0000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.178109  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1224  hypothetical protein  21.63 
 
 		 879 aa  55.5  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0550391  normal  0.309414 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3281  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  23.18 
 
 		 1163 aa  52.4  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.667094 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3461  hypothetical protein  23.18 
 
 		 840 aa  50.4  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00828066 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4235  glycoside hydrolase family protein  19.94 
 
 		 931 aa  50.4  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4096  hypothetical protein  20 
 
 		 1221 aa  47  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1727  glycoside hydrolase family protein  31.62 
 
 		 1137 aa  46.6  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0544172  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>