33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1257 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1257  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  100 
 
 		 1347 aa  2771    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.618189 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2278  glycoside hydrolase family protein  37.04 
 
 		 1564 aa  529  1e-148  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.467525 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1521  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  31.79 
 
 		 1101 aa  471  1.0000000000000001e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.285241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0358  coagulation factor 5/8 type domain protein  31.9 
 
 		 1114 aa  459  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3973  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  32.51 
 
 		 1088 aa  458  1e-127  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.4327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1727  glycoside hydrolase family protein  33.33 
 
 		 1137 aa  452  1e-125  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0544172  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2749  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  31.15 
 
 		 1139 aa  444  1e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0806564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2304  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  32.41 
 
 		 1070 aa  446  1e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0500689 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2290  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  31.53 
 
 		 1056 aa  431  1e-119  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1809  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  31.3 
 
 		 1456 aa  427  1e-118  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.440547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3535  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  31.48 
 
 		 1100 aa  400  1e-109  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4101  glycoside hydrolase family protein  28.65 
 
 		 1129 aa  391  1e-107  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3492  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  35.13 
 
 		 987 aa  360  9.999999999999999e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0942  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  33.5 
 
 		 960 aa  325  4e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000970619 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2269  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  34.13 
 
 		 961 aa  323  9.999999999999999e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3886  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  32.52 
 
 		 986 aa  323  1.9999999999999998e-86  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.754835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3297  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.43 
 
 		 941 aa  114  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000222307 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4235  glycoside hydrolase family protein  22.17 
 
 		 931 aa  107  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1346  hypothetical protein  23.52 
 
 		 991 aa  105  6e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4096  hypothetical protein  24.74 
 
 		 1221 aa  103  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1578  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  21.04 
 
 		 954 aa  87.4  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.579068  normal  0.0815371 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3461  hypothetical protein  37.09 
 
 		 840 aa  82  0.00000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00828066 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1224  hypothetical protein  23.06 
 
 		 879 aa  79  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0550391  normal  0.309414 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0915  hypothetical protein  22.02 
 
 		 994 aa  70.1  0.0000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1100  hypothetical protein  23.29 
 
 		 1049 aa  64.3  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2037  hypothetical protein  38.2 
 
 		 1319 aa  55.1  0.000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.178109  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29680  hypothetical protein  23.32 
 
 		 899 aa  53.9  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1743  glycoside hydrolase family protein  35.48 
 
 		 986 aa  52.4  0.00005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1670  glycoside hydrolase family protein  35.48 
 
 		 986 aa  52.4  0.00007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1667  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  31.65 
 
 		 858 aa  51.2  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.611357  normal  0.331093 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2094  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  28.17 
 
 		 844 aa  50.8  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000180475  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2581  hypothetical protein  35.71 
 
 		 996 aa  49.3  0.0006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.520562  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1310  Beta-glucuronidase  31.4 
 
 		 588 aa  45.1  0.009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>