34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_1670 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_2581  hypothetical protein  60.34 
 
 
996 aa  1278    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.520562  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1670  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 
986 aa  2028    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1743  glycoside hydrolase family protein  99.59 
 
 
986 aa  2020    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0915  hypothetical protein  33.53 
 
 
994 aa  528  1e-148  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0165  hypothetical protein  32.15 
 
 
1006 aa  478  1e-133  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2555  hypothetical protein  26.71 
 
 
1054 aa  345  2.9999999999999997e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.291539  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04730  conserved hypothetical protein  35.99 
 
 
1031 aa  303  8.000000000000001e-81  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2076  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  30.13 
 
 
1039 aa  180  1e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2094  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  22.52 
 
 
844 aa  155  4e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000180475  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3281  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  23.06 
 
 
1163 aa  109  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.667094 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2037  hypothetical protein  22.69 
 
 
1319 aa  102  4e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.178109  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8233  hypothetical protein  23.4 
 
 
1208 aa  94.4  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4426  hypothetical protein  22.82 
 
 
1325 aa  93.6  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.216267 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3617  hypothetical protein  21.8 
 
 
1354 aa  91.7  7e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.10482  normal  0.364448 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3461  hypothetical protein  22.94 
 
 
840 aa  89.4  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00828066 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1224  hypothetical protein  20.88 
 
 
879 aa  83.2  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0550391  normal  0.309414 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0666  hypothetical protein  19.71 
 
 
897 aa  79.7  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000236884  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1578  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.68 
 
 
954 aa  73.2  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.579068  normal  0.0815371 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4096  hypothetical protein  23.66 
 
 
1221 aa  73.9  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3535  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  37 
 
 
1100 aa  67.4  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1346  hypothetical protein  25.11 
 
 
991 aa  65.9  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0942  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  36.43 
 
 
960 aa  63.5  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000970619 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3297  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  21.06 
 
 
941 aa  62.4  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000222307 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2278  glycoside hydrolase family protein  23.39 
 
 
1564 aa  60.5  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.467525 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2749  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  38.55 
 
 
1139 aa  58.9  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0806564  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6038  conserved hypothetical protein, putative carbohydrate binding domain protein  28.57 
 
 
895 aa  58.2  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.686786  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1521  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  37.5 
 
 
1101 aa  55.8  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.285241  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0358  coagulation factor 5/8 type domain protein  29.46 
 
 
1114 aa  54.3  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1257  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  35.48 
 
 
1347 aa  52.4  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.618189 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4101  glycoside hydrolase family protein  31.37 
 
 
1129 aa  50.1  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4235  glycoside hydrolase family protein  22.97 
 
 
931 aa  49.7  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1809  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  37.97 
 
 
1456 aa  48.9  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.440547  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1100  hypothetical protein  23.9 
 
 
1049 aa  48.1  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3871  Beta-glucuronidase  30.53 
 
 
603 aa  46.6  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.311387 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>