27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3281 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_3281  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  100 
 
 		 1163 aa  2334    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.667094 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4426  hypothetical protein  36.72 
 
 		 1325 aa  657    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.216267 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8233  hypothetical protein  40.34 
 
 		 1208 aa  734    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2037  hypothetical protein  36.27 
 
 		 1319 aa  670    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.178109  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3617  hypothetical protein  34.59 
 
 		 1354 aa  587  1e-166  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.10482  normal  0.364448 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4096  hypothetical protein  28.04 
 
 		 1221 aa  203  1.9999999999999998e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1743  glycoside hydrolase family protein  23.19 
 
 		 986 aa  110  1e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2076  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.65 
 
 		 1039 aa  109  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1670  glycoside hydrolase family protein  23.06 
 
 		 986 aa  108  5e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0915  hypothetical protein  23.41 
 
 		 994 aa  108  9e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2581  hypothetical protein  22.22 
 
 		 996 aa  107  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.520562  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2555  hypothetical protein  21.99 
 
 		 1054 aa  96.3  3e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.291539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3461  hypothetical protein  24.27 
 
 		 840 aa  89  5e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00828066 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0165  hypothetical protein  24.21 
 
 		 1006 aa  84.3  0.00000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1224  hypothetical protein  22.86 
 
 		 879 aa  83.2  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0550391  normal  0.309414 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04730  conserved hypothetical protein  22.39 
 
 		 1031 aa  68.6  0.0000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0666  hypothetical protein  21.69 
 
 		 897 aa  64.7  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000236884  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1346  hypothetical protein  23.53 
 
 		 991 aa  59.7  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2094  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  19.7 
 
 		 844 aa  57.4  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000180475  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29680  hypothetical protein  36.03 
 
 		 899 aa  54.7  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1809  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  29.78 
 
 		 1456 aa  53.9  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.440547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2749  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25 
 
 		 1139 aa  52.4  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0806564  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6038  conserved hypothetical protein, putative carbohydrate binding domain protein  23.18 
 
 		 895 aa  52.4  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.686786  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3297  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  20.69 
 
 		 941 aa  51.2  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000222307 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3886  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  21.98 
 
 		 986 aa  49.7  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.754835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2278  glycoside hydrolase family protein  25.3 
 
 		 1564 aa  48.1  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.467525 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1521  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  32.33 
 
 		 1101 aa  47.8  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.285241  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>