30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8233 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_3281  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  40.03 
 
 		 1163 aa  745    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.667094 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2037  hypothetical protein  44.4 
 
 		 1319 aa  962    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.178109  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8233  hypothetical protein  100 
 
 		 1208 aa  2375    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4426  hypothetical protein  43.41 
 
 		 1325 aa  878    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.216267 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3617  hypothetical protein  36.32 
 
 		 1354 aa  583  1.0000000000000001e-165  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.10482  normal  0.364448 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4096  hypothetical protein  31.06 
 
 		 1221 aa  215  4.9999999999999996e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2076  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  22.6 
 
 		 1039 aa  122  3.9999999999999996e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2581  hypothetical protein  21.6 
 
 		 996 aa  114  1.0000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.520562  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0915  hypothetical protein  24.81 
 
 		 994 aa  112  6e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1743  glycoside hydrolase family protein  23.95 
 
 		 986 aa  103  2e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1670  glycoside hydrolase family protein  23.77 
 
 		 986 aa  99.8  3e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0165  hypothetical protein  23.54 
 
 		 1006 aa  92.8  3e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2555  hypothetical protein  21.21 
 
 		 1054 aa  78.6  0.0000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.291539  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04730  conserved hypothetical protein  24.87 
 
 		 1031 aa  72.4  0.00000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1224  hypothetical protein  23.01 
 
 		 879 aa  71.2  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0550391  normal  0.309414 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0666  hypothetical protein  23.15 
 
 		 897 aa  68.2  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000236884  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3461  hypothetical protein  22.62 
 
 		 840 aa  63.2  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00828066 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29680  hypothetical protein  29.4 
 
 		 899 aa  62.4  0.00000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1809  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.45 
 
 		 1456 aa  62  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.440547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1346  hypothetical protein  24 
 
 		 991 aa  58.9  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1578  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  22.02 
 
 		 954 aa  56.2  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.579068  normal  0.0815371 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2749  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.11 
 
 		 1139 aa  55.8  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0806564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3886  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  22.3 
 
 		 986 aa  55.5  0.000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.754835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2290  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  21.85 
 
 		 1056 aa  53.1  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3297  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  20.97 
 
 		 941 aa  50.8  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000222307 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6038  conserved hypothetical protein, putative carbohydrate binding domain protein  25.79 
 
 		 895 aa  50.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.686786  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2094  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  19.9 
 
 		 844 aa  50.8  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000180475  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0942  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  19.44 
 
 		 960 aa  49.3  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000970619 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4101  glycoside hydrolase family protein  20.6 
 
 		 1129 aa  47  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2269  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  20 
 
 		 961 aa  45.4  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>