40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_2037 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_3281  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  36.27 
 
 
1163 aa  673    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.667094 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4426  hypothetical protein  44.77 
 
 
1325 aa  1043    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.216267 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8233  hypothetical protein  44.06 
 
 
1208 aa  954    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3617  hypothetical protein  36.61 
 
 
1354 aa  660    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.10482  normal  0.364448 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2037  hypothetical protein  100 
 
 
1319 aa  2639    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.178109  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4096  hypothetical protein  28.06 
 
 
1221 aa  295  5e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2076  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.75 
 
 
1039 aa  165  7e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0915  hypothetical protein  22.79 
 
 
994 aa  138  8e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2581  hypothetical protein  23.62 
 
 
996 aa  123  1.9999999999999998e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.520562  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0165  hypothetical protein  21.58 
 
 
1006 aa  122  3.9999999999999996e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1578  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.03 
 
 
954 aa  115  6e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.579068  normal  0.0815371 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2555  hypothetical protein  23.65 
 
 
1054 aa  113  3e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.291539  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1743  glycoside hydrolase family protein  23.1 
 
 
986 aa  105  7e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1670  glycoside hydrolase family protein  22.69 
 
 
986 aa  101  1e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2094  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  19.49 
 
 
844 aa  87  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000180475  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE04730  conserved hypothetical protein  21.04 
 
 
1031 aa  83.2  0.00000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3461  hypothetical protein  23.15 
 
 
840 aa  81.6  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00828066 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0666  hypothetical protein  20.32 
 
 
897 aa  79.7  0.0000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000236884  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1224  hypothetical protein  24.68 
 
 
879 aa  68.6  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0550391  normal  0.309414 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4235  glycoside hydrolase family protein  20.12 
 
 
931 aa  68.6  0.0000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29680  hypothetical protein  28.84 
 
 
899 aa  68.2  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3535  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  39.26 
 
 
1100 aa  67.8  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2749  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  21.84 
 
 
1139 aa  67.8  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0806564  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3886  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.12 
 
 
986 aa  67  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.754835  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3492  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.19 
 
 
987 aa  65.5  0.000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4101  glycoside hydrolase family protein  31.51 
 
 
1129 aa  62.4  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1809  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  28.8 
 
 
1456 aa  61.6  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.440547  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2269  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  36.72 
 
 
961 aa  59.3  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3297  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  20.4 
 
 
941 aa  58.2  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000222307 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6038  conserved hypothetical protein, putative carbohydrate binding domain protein  20.24 
 
 
895 aa  57.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.686786  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2290  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  21.28 
 
 
1056 aa  55.5  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1257  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  38.2 
 
 
1347 aa  55.1  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.618189 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0942  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  33.09 
 
 
960 aa  53.9  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000970619 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2278  glycoside hydrolase family protein  39.33 
 
 
1564 aa  52  0.00007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.467525 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1346  hypothetical protein  23.22 
 
 
991 aa  49.3  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1521  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  29.37 
 
 
1101 aa  48.9  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.285241  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1727  glycoside hydrolase family protein  35.2 
 
 
1137 aa  48.5  0.0007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0544172  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3973  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  37.5 
 
 
1088 aa  47.4  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.4327  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0358  coagulation factor 5/8 type domain protein  28.68 
 
 
1114 aa  46.6  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2304  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  31.4 
 
 
1070 aa  45.4  0.007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0500689 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>