20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNE04730 on replicon NC_006687
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006687  CNE04730  conserved hypothetical protein  100 
 
 
1031 aa  2146    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0165  hypothetical protein  29.16 
 
 
1006 aa  415  1e-114  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0915  hypothetical protein  28.82 
 
 
994 aa  353  1e-95  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2581  hypothetical protein  26.82 
 
 
996 aa  317  9e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.520562  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1743  glycoside hydrolase family protein  36.17 
 
 
986 aa  304  7.000000000000001e-81  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1670  glycoside hydrolase family protein  35.99 
 
 
986 aa  303  8.000000000000001e-81  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2555  hypothetical protein  24.44 
 
 
1054 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.291539  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2076  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  28.03 
 
 
1039 aa  211  7e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2094  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  21.89 
 
 
844 aa  116  3e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000180475  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2037  hypothetical protein  21.04 
 
 
1319 aa  83.2  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.178109  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6038  conserved hypothetical protein, putative carbohydrate binding domain protein  21.29 
 
 
895 aa  73.2  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.686786  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0666  hypothetical protein  19.86 
 
 
897 aa  71.6  0.00000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000236884  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3617  hypothetical protein  22.28 
 
 
1354 aa  71.6  0.00000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.10482  normal  0.364448 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4426  hypothetical protein  21.78 
 
 
1325 aa  69.3  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.216267 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3281  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  22.39 
 
 
1163 aa  68.2  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.667094 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8233  hypothetical protein  23.78 
 
 
1208 aa  67.4  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1224  hypothetical protein  28.38 
 
 
879 aa  66.2  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0550391  normal  0.309414 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4096  hypothetical protein  23.55 
 
 
1221 aa  63.5  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3461  hypothetical protein  21.57 
 
 
840 aa  52.4  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00828066 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1578  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.96 
 
 
954 aa  50.1  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.579068  normal  0.0815371 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>