21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5714 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_5714  putative acetyl xylan esterase  100 
 
 
415 aa  860    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.785673  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0116  putative acetyl xylan esterase  45.2 
 
 
437 aa  334  2e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.278656 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1505  hypothetical protein  41.08 
 
 
429 aa  329  5.0000000000000004e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.738785  normal  0.270473 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6546  hypothetical protein  43.64 
 
 
421 aa  328  7e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.769373  normal  0.950041 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2278  glycoside hydrolase family protein  37.22 
 
 
1564 aa  254  1.0000000000000001e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.467525 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3033  putative acetyl xylan esterase  33.85 
 
 
399 aa  251  1e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3126  putative acetyl xylan esterase  35.7 
 
 
430 aa  243  6e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.635403  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4328  hypothetical protein  35.4 
 
 
495 aa  217  4e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0219  putative acetyl xylan esterase  34.01 
 
 
398 aa  207  4e-52  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3314  hypothetical protein  32.5 
 
 
450 aa  195  1e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2279  putative acetyl xylan esterase  34.22 
 
 
376 aa  195  1e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2642  GDSL family lipase  33 
 
 
449 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.268239  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6195  hypothetical protein  29.95 
 
 
478 aa  170  3e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2090  putative acetyl xylan esterase  31.17 
 
 
397 aa  157  4e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.913278  normal  0.98056 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1716  hypothetical protein  30.39 
 
 
514 aa  146  6e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.722896  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4134  cellulose-binding family II  28.07 
 
 
536 aa  117  5e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.16612  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2773  putative topoisomerase  28.14 
 
 
449 aa  110  3e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.243531 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2268  hypothetical protein  24.88 
 
 
615 aa  109  7.000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.457427  normal  0.399123 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1238  beta-xylosidase/endoglucanase  25.32 
 
 
1275 aa  107  3e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3862  endo-1,4-beta-xylanase  28.12 
 
 
2457 aa  58.2  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0342  Dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase  21.96 
 
 
381 aa  55.5  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>