21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6195 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_6195  hypothetical protein  100 
 
 		 478 aa  989    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4328  hypothetical protein  48.35 
 
 		 495 aa  462  1e-129  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2642  GDSL family lipase  45.14 
 
 		 449 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.268239  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1716  hypothetical protein  36.96 
 
 		 514 aa  286  4e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.722896  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2278  glycoside hydrolase family protein  38.27 
 
 		 1564 aa  261  2e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.467525 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3126  putative acetyl xylan esterase  37.25 
 
 		 430 aa  251  3e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.635403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3033  putative acetyl xylan esterase  35.47 
 
 		 399 aa  231  3e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6546  hypothetical protein  34.25 
 
 		 421 aa  221  3e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.769373  normal  0.950041 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1505  hypothetical protein  33.58 
 
 		 429 aa  216  5e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.738785  normal  0.270473 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0116  putative acetyl xylan esterase  33.92 
 
 		 437 aa  211  3e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.278656 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5714  putative acetyl xylan esterase  29.95 
 
 		 415 aa  171  4e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.785673  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3314  hypothetical protein  30.9 
 
 		 450 aa  147  6e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0219  putative acetyl xylan esterase  30.65 
 
 		 398 aa  147  6e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2090  putative acetyl xylan esterase  35.02 
 
 		 397 aa  137  3.0000000000000003e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.913278  normal  0.98056 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4134  cellulose-binding family II  30.57 
 
 		 536 aa  104  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.16612  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2279  putative acetyl xylan esterase  37.34 
 
 		 376 aa  99.4  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2773  putative topoisomerase  28.66 
 
 		 449 aa  95.9  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.243531 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2268  hypothetical protein  25.97 
 
 		 615 aa  88.2  3e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.457427  normal  0.399123 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1238  beta-xylosidase/endoglucanase  28.83 
 
 		 1275 aa  81.6  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0342  Dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase  24.86 
 
 		 381 aa  56.6  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3862  endo-1,4-beta-xylanase  26.36 
 
 		 2457 aa  52.4  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>