21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3126 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_3126  putative acetyl xylan esterase  100 
 
 
430 aa  886    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.635403  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2278  glycoside hydrolase family protein  50.99 
 
 
1564 aa  462  1e-129  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.467525 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6546  hypothetical protein  40.35 
 
 
421 aa  290  3e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.769373  normal  0.950041 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1505  hypothetical protein  37.68 
 
 
429 aa  288  1e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.738785  normal  0.270473 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3033  putative acetyl xylan esterase  36.68 
 
 
399 aa  275  1.0000000000000001e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0116  putative acetyl xylan esterase  35.96 
 
 
437 aa  265  8.999999999999999e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.278656 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6195  hypothetical protein  37.25 
 
 
478 aa  251  2e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5714  putative acetyl xylan esterase  35.7 
 
 
415 aa  243  6e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.785673  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4328  hypothetical protein  36.41 
 
 
495 aa  233  6e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2642  GDSL family lipase  34.32 
 
 
449 aa  228  2e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.268239  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0219  putative acetyl xylan esterase  33.33 
 
 
398 aa  193  6e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1716  hypothetical protein  32.21 
 
 
514 aa  176  9e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.722896  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2279  putative acetyl xylan esterase  29.98 
 
 
376 aa  167  2.9999999999999998e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3314  hypothetical protein  31.36 
 
 
450 aa  162  2e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2090  putative acetyl xylan esterase  37.75 
 
 
397 aa  147  3e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.913278  normal  0.98056 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2268  hypothetical protein  25.92 
 
 
615 aa  79.7  0.00000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.457427  normal  0.399123 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1238  beta-xylosidase/endoglucanase  35.26 
 
 
1275 aa  79.3  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2773  putative topoisomerase  23.31 
 
 
449 aa  70.5  0.00000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.243531 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4134  cellulose-binding family II  31.17 
 
 
536 aa  69.7  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.16612  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3862  endo-1,4-beta-xylanase  27.37 
 
 
2457 aa  53.1  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0342  Dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase  22.16 
 
 
381 aa  44.3  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>