53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0886 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_0886  alpha/beta fold family hydrolase  100 
 
 
373 aa  766    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2344  alpha/beta fold family hydrolase  60.48 
 
 
374 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.946949  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1275  alpha/beta fold family hydrolase  42.25 
 
 
378 aa  315  9.999999999999999e-85  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25070  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  29.1 
 
 
406 aa  151  2e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.351879  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1005  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase related protein  30.14 
 
 
434 aa  147  3e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2113  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase related protein  25.81 
 
 
474 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1544  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase related protein  25.12 
 
 
448 aa  119  6e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000180144  normal  0.131474 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1530  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase related protein  26.85 
 
 
463 aa  119  7e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1853  hypothetical protein  27.55 
 
 
417 aa  113  6e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0716  hypothetical protein  28.46 
 
 
396 aa  112  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4695  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase related protein  26.13 
 
 
406 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0736  hypothetical protein  28.49 
 
 
396 aa  107  4e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1228  hypothetical protein  22.79 
 
 
403 aa  94  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.395886  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2676  hypothetical protein  25.42 
 
 
401 aa  87  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0967  alpha/beta fold family hydrolase  24.1 
 
 
388 aa  85.9  9e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2308  hypothetical protein  23.47 
 
 
399 aa  86.3  9e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.14665  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2118  protein of unknown function DUF1100 hydrolase family protein  23.25 
 
 
383 aa  85.1  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3159  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl peptidase  25.13 
 
 
420 aa  83.6  0.000000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1547  hypothetical protein  23.47 
 
 
384 aa  82.8  0.000000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.26317  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6210  Acetyl xylan esterase  26.49 
 
 
402 aa  77  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2957  hypothetical protein  25.14 
 
 
418 aa  74.7  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.85194  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0478  protein of unknown function DUF1100, hydrolase family protein  23.82 
 
 
388 aa  74.3  0.000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2193  hypothetical protein  22.82 
 
 
402 aa  70.9  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1933  hypothetical protein  23.77 
 
 
385 aa  69.7  0.00000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3195  hypothetical protein  23.61 
 
 
420 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.304739  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2165  hypothetical protein  23.42 
 
 
402 aa  67.8  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5182  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl peptidase  27.76 
 
 
423 aa  67.8  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1811  hypothetical protein  23.61 
 
 
399 aa  67  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.369907  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5486  hypothetical protein  23.68 
 
 
390 aa  65.1  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.416451  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4831  hypothetical protein  21.98 
 
 
386 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.857401  normal  0.718277 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0714  hypothetical protein  21.49 
 
 
385 aa  63.2  0.000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0219  hypothetical protein  22.14 
 
 
400 aa  62  0.00000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.431687  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2389  hypothetical protein  22.74 
 
 
390 aa  61.2  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0906  hypothetical protein  21.71 
 
 
385 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.60282  normal  0.197591 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4716  hypothetical protein  22.68 
 
 
406 aa  58.5  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3412  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  21.57 
 
 
381 aa  58.9  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0456561 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4305  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  22.18 
 
 
413 aa  57.4  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0350755  normal  0.767198 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5609  hypothetical protein  20.87 
 
 
400 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.675144  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5973  hypothetical protein  20.87 
 
 
400 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0578676  hitchhiker  0.00100227 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0890  protein of unknown function DUF1100, hydrolase family protein  24.66 
 
 
357 aa  56.2  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.712139  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0856  hypothetical protein  24.04 
 
 
386 aa  53.1  0.000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5460  protein of unknown function DUF1100 hydrolase family protein  27.68 
 
 
424 aa  50.8  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.528765  normal  0.198358 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3150  hypothetical protein  21.05 
 
 
386 aa  50.8  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.202569  normal  0.775857 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0613  protein of unknown function DUF1100, hydrolase family protein  23.99 
 
 
383 aa  50.4  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3425  hypothetical protein  21.79 
 
 
387 aa  48.5  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.4734  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2334  alpha/beta hydrolase fold  20.67 
 
 
258 aa  47.4  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000909068  hitchhiker  0.0000846948 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2333  alpha/beta fold family hydrolase  24.84 
 
 
280 aa  46.2  0.0008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4575  hypothetical protein  31 
 
 
326 aa  45.8  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.116237 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3402  esterase/lipase  27 
 
 
235 aa  45.1  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1942  alpha/beta hydrolase fold  24.68 
 
 
266 aa  43.9  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000178977  hitchhiker  0.00172948 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2136  alpha/beta hydrolase fold  24.68 
 
 
266 aa  43.1  0.008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000406984  decreased coverage  0.00000741326 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2033  alpha/beta hydrolase fold  26.5 
 
 
266 aa  43.1  0.008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000295645  hitchhiker  0.000143979 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  24.78 
 
 
309 aa  42.7  0.01  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>