54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4575 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_4575  hypothetical protein  100 
 
 
326 aa  641    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.116237 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0890  protein of unknown function DUF1100, hydrolase family protein  31.75 
 
 
357 aa  124  2e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.712139  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4476  protein of unknown function DUF1100, hydrolase family protein  35.99 
 
 
376 aa  121  9.999999999999999e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0613  protein of unknown function DUF1100, hydrolase family protein  31.47 
 
 
383 aa  90.9  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0736  hypothetical protein  25.94 
 
 
396 aa  78.2  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0716  hypothetical protein  28.57 
 
 
396 aa  76.3  0.0000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2563  hypothetical protein  40.35 
 
 
148 aa  75.1  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6210  Acetyl xylan esterase  23.72 
 
 
402 aa  75.1  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5460  protein of unknown function DUF1100 hydrolase family protein  25.11 
 
 
424 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.528765  normal  0.198358 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4482  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like  27.84 
 
 
358 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1547  hypothetical protein  26.5 
 
 
384 aa  63.5  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.26317  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0967  alpha/beta fold family hydrolase  25.13 
 
 
388 aa  62.8  0.000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1005  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase related protein  27.88 
 
 
434 aa  60.8  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0478  protein of unknown function DUF1100, hydrolase family protein  27.76 
 
 
388 aa  60.5  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2113  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase related protein  35.58 
 
 
474 aa  59.7  0.00000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3195  hypothetical protein  30.99 
 
 
420 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.304739  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1933  hypothetical protein  29.55 
 
 
385 aa  58.2  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1544  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase related protein  28.3 
 
 
448 aa  58.2  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000180144  normal  0.131474 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1530  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase related protein  32.69 
 
 
463 aa  57.4  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1275  alpha/beta fold family hydrolase  28.57 
 
 
378 aa  55.8  0.0000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4695  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase related protein  37.39 
 
 
406 aa  55.5  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1109  alpha/beta hydrolase fold  30.23 
 
 
248 aa  54.7  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00126644  hitchhiker  0.00394602 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2308  hypothetical protein  40.7 
 
 
399 aa  51.6  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.14665  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5486  hypothetical protein  30.7 
 
 
390 aa  51.6  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.416451  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1853  hypothetical protein  36.47 
 
 
417 aa  51.2  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2193  hypothetical protein  22.77 
 
 
402 aa  51.6  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2165  hypothetical protein  22.77 
 
 
402 aa  50.8  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0856  hypothetical protein  33.08 
 
 
386 aa  50.1  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3150  hypothetical protein  27.92 
 
 
386 aa  50.1  0.00006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.202569  normal  0.775857 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2118  protein of unknown function DUF1100 hydrolase family protein  26.81 
 
 
383 aa  49.7  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17930  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  26.99 
 
 
330 aa  48.9  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.659857  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2389  hypothetical protein  28.24 
 
 
390 aa  49.3  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1811  hypothetical protein  32.1 
 
 
399 aa  48.5  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.369907  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0906  hypothetical protein  35.51 
 
 
385 aa  48.5  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.60282  normal  0.197591 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0886  alpha/beta fold family hydrolase  24.76 
 
 
373 aa  48.9  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1228  hypothetical protein  28.04 
 
 
403 aa  48.1  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.395886  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0714  hypothetical protein  28.78 
 
 
385 aa  47.8  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4831  hypothetical protein  30.81 
 
 
386 aa  48.5  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.857401  normal  0.718277 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2957  hypothetical protein  31.61 
 
 
418 aa  47.4  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.85194  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2344  alpha/beta fold family hydrolase  24.12 
 
 
374 aa  47.4  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.946949  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1006  protein of unknown function DUF1100, hydrolase family protein  28.81 
 
 
438 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.342716 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3412  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  30.48 
 
 
381 aa  47  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0456561 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4716  hypothetical protein  27.92 
 
 
406 aa  46.2  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2765  peptidase S15  28.91 
 
 
254 aa  45.4  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.835133 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5609  hypothetical protein  27.35 
 
 
400 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.675144  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5973  hypothetical protein  27.35 
 
 
400 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0578676  hitchhiker  0.00100227 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04550  lysophospholipase  28.38 
 
 
290 aa  44.7  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35370  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  24.16 
 
 
261 aa  44.3  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1273  Alpha/beta hydrolase fold  28.86 
 
 
258 aa  44.3  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.879726  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5182  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl peptidase  33.68 
 
 
423 aa  43.5  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1006  alpha/beta hydrolase fold protein  30.51 
 
 
324 aa  43.1  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0513  putative hydrolase  36.47 
 
 
290 aa  43.1  0.006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.36689  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0003  2-acetyl-1-alkylglycerophosph ocholine esterase  28.08 
 
 
295 aa  42.7  0.008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.643253  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3159  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl peptidase  33.63 
 
 
420 aa  42.7  0.009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>