267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0513 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0513  putative hydrolase  100 
 
 		 290 aa  574  1.0000000000000001e-163  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.36689  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2997  alpha/beta hydrolase fold protein  58.42 
 
 		 292 aa  297  2e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.670306 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1199  alpha/beta hydrolase fold protein  55.1 
 
 		 294 aa  288  8e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00792158  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8394  putative hydrolase  51.2 
 
 		 290 aa  275  6e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3833  alpha/beta hydrolase fold protein  51.34 
 
 		 302 aa  270  2.9999999999999997e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.549204 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7821  alpha/beta hydrolase fold protein  44.67 
 
 		 290 aa  199  3.9999999999999996e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4256  alpha/beta hydrolase fold protein  46.99 
 
 		 310 aa  192  5e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.598911  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06630  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  43.36 
 
 		 297 aa  169  4e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0822  alpha/beta hydrolase fold protein  42.24 
 
 		 278 aa  157  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000139933  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0473  hypothetical protein  30.24 
 
 		 307 aa  84.3  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.225161  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2225  alpha/beta hydrolase fold  32.16 
 
 		 273 aa  76.3  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3492  alpha/beta hydrolase fold  25.7 
 
 		 270 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1778  alpha/beta hydrolase fold  31.36 
 
 		 366 aa  72.4  0.000000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0401666  normal  0.253947 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0253  hydrolase, alpha/beta fold family  25.7 
 
 		 270 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000360358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4985  SHCHC synthase  24.9 
 
 		 270 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.30423  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4696  alpha/beta hydrolase fold  25.4 
 
 		 270 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1970  alpha/beta hydrolase fold  24.19 
 
 		 311 aa  67  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000319634  normal  0.0578642 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1232  alpha/beta hydrolase fold protein  24.08 
 
 		 277 aa  66.6  0.0000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  29.46 
 
 		 273 aa  66.2  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5014  alpha/beta fold family hydrolase  23.89 
 
 		 270 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4996  hydrolase, alpha/beta fold family  23.89 
 
 		 270 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.556402  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4043  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.72 
 
 		 372 aa  63.2  0.000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.140528  normal  0.0217743 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2696  alpha/beta hydrolase fold protein  29.84 
 
 		 268 aa  60.5  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.094894  normal  0.233594 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4587  hydrolase; menaquinone biosynthesis related protein; prolyl aminopeptidase  23.48 
 
 		 270 aa  60.5  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2137  alpha/beta hydrolase fold protein  30.38 
 
 		 363 aa  60.5  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0198184  normal  0.0171478 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8642  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  30.52 
 
 		 321 aa  60.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4967  hydrolase, alpha/beta fold family  23.48 
 
 		 270 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  26.36 
 
 		 309 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1674  alpha/beta hydrolase fold protein  31.35 
 
 		 300 aa  59.7  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0555007  normal  0.342209 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4749  alpha/beta fold family hydrolase  23.08 
 
 		 270 aa  57.4  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5110  alpha/beta fold family hydrolase  23.08 
 
 		 270 aa  57.4  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.98697  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3355  alpha/beta hydrolase fold  24.78 
 
 		 313 aa  57  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000102808  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4069  alpha/beta hydrolase fold  22.9 
 
 		 285 aa  57  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000534337 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1465  alpha/beta hydrolase fold protein  27.68 
 
 		 289 aa  56.2  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.647363  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1037  alpha/beta hydrolase fold  28.14 
 
 		 226 aa  56.6  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4115  alpha/beta hydrolase fold  27.91 
 
 		 280 aa  56.6  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0751  alpha/beta hydrolase fold  27.63 
 
 		 270 aa  56.2  0.0000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.158146 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1087  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.12 
 
 		 389 aa  55.8  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.607916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2212  putative lipase  25.77 
 
 		 315 aa  55.8  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.799877  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25910  putative lipase  25.77 
 
 		 315 aa  55.8  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0600573 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3496  alpha/beta hydrolase fold  28.32 
 
 		 289 aa  55.5  0.0000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.340747  normal  0.70145 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2496  alpha/beta hydrolase fold  26.97 
 
 		 431 aa  55.8  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98231  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  29.01 
 
 		 292 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4609  hydrolase; menaquinone biosynthesis related protein; prolyl aminopeptidase  23.08 
 
 		 270 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36070  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  29.11 
 
 		 313 aa  55.1  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.338915  normal  0.660761 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0198  alpha/beta hydrolase fold  26.64 
 
 		 311 aa  55.1  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.593906 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1310  alpha/beta hydrolase fold  26.95 
 
 		 269 aa  55.1  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.557665  normal  0.708974 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4590  alpha/beta hydrolase fold protein  27.84 
 
 		 327 aa  55.5  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.775489  normal  0.0737458 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2975  alpha/beta hydrolase fold protein  27.95 
 
 		 307 aa  55.1  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  29.01 
 
 		 277 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0934  alpha/beta hydrolase fold  26.27 
 
 		 266 aa  54.3  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.570173  hitchhiker  0.00160688 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6643  putative triacylglycerol lipase  25.75 
 
 		 275 aa  54.3  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192902  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4983  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.86 
 
 		 367 aa  54.3  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.40688 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3452  alpha/beta hydrolase fold  25.3 
 
 		 311 aa  54.7  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.156566  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1435  alpha/beta hydrolase fold protein  30.12 
 
 		 256 aa  53.5  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.426403  normal  0.727578 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0111  alpha/beta hydrolase fold protein  27.51 
 
 		 263 aa  53.5  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2481  alpha/beta hydrolase fold protein  28.09 
 
 		 275 aa  53.1  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4169  alpha/beta hydrolase fold  28.1 
 
 		 265 aa  52.4  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3731  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.46 
 
 		 372 aa  52.4  0.000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1103  alpha/beta hydrolase fold  22.57 
 
 		 267 aa  52.4  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0274  Alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 289 aa  51.6  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.642233  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4171  Alpha/beta hydrolase  32.48 
 
 		 306 aa  52  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.753522 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1126  alpha/beta hydrolase fold  22.57 
 
 		 267 aa  52.4  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0193485  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2890  alpha/beta hydrolase fold protein  27.73 
 
 		 308 aa  52  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0135  alpha/beta hydrolase fold  29.02 
 
 		 265 aa  51.6  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0316  alpha/beta hydrolase fold  27.24 
 
 		 316 aa  52  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00247828  hitchhiker  0.00660595 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1033  alpha/beta hydrolase fold  28.07 
 
 		 275 aa  52  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.127131  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0780  alpha/beta hydrolase fold  24.09 
 
 		 276 aa  52  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0600224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  26.07 
 
 		 264 aa  51.6  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2983  alpha/beta hydrolase fold protein  27.64 
 
 		 303 aa  52  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.283426 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4841  alpha/beta hydrolase fold protein  30.33 
 
 		 266 aa  52  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1253  alpha/beta hydrolase fold  24.82 
 
 		 336 aa  51.6  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.264331  normal  0.195785 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4319  Alpha/beta hydrolase fold  23.75 
 
 		 277 aa  51.2  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0531  alpha/beta hydrolase fold  28.29 
 
 		 264 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0176995 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2089  alpha/beta hydrolase  26.44 
 
 		 236 aa  51.2  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.500476  normal  0.419915 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1312  putative hydrolase  25.19 
 
 		 267 aa  51.2  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0718757  normal  0.106288 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3719  alpha/beta hydrolase fold  27.19 
 
 		 260 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.815141  hitchhiker  0.00169195 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3988  alpha/beta hydrolase fold protein  38.46 
 
 		 263 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3910  alpha/beta hydrolase fold  38.46 
 
 		 263 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.399825  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8386  hydrolase, alpha  42.68 
 
 		 304 aa  51.6  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.139718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0413  alpha/beta hydrolase fold  28.33 
 
 		 257 aa  50.8  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.732531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07460  lysophospholipase  30.6 
 
 		 300 aa  50.4  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0863462 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2743  alpha/beta hydrolase fold  36.62 
 
 		 331 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.529791  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0475  alpha/beta hydrolase fold protein  27.04 
 
 		 290 aa  50.4  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1827  alpha/beta hydrolase fold  19.72 
 
 		 260 aa  50.4  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.518334  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  25.31 
 
 		 270 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3606  3-oxoadipate enol-lactonase  31.75 
 
 		 265 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0197721  hitchhiker  0.000894779 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1259  alpha/beta hydrolase fold  27.07 
 
 		 284 aa  50.4  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1720  thioesterase, menaquinone synthesis protein  25.19 
 
 		 265 aa  50.1  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5961  alpha/beta hydrolase fold protein  37.86 
 
 		 345 aa  50.1  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.576377  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2263  alpha/beta hydrolase fold  28.63 
 
 		 277 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0683  putative hydrolase  25.2 
 
 		 271 aa  50.1  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.225532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3642  alpha/beta fold family hydrolase  26.51 
 
 		 262 aa  50.1  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2258  alpha/beta hydrolase fold  27.91 
 
 		 277 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  29.7 
 
 		 295 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1477  proline iminopeptidase like protein  26.33 
 
 		 297 aa  50.4  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.140845 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1204  alpha/beta fold family hydrolase  25.58 
 
 		 281 aa  49.7  0.00006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.106082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3415  alpha/beta hydrolase fold  28.11 
 
 		 256 aa  49.7  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0419  alpha/beta hydrolase fold  35.05 
 
 		 270 aa  49.7  0.00006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1230  alpha/beta hydrolase fold  26.1 
 
 		 261 aa  49.3  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>