96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0473 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_0473  hypothetical protein  100 
 
 
307 aa  630  1e-180  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.225161  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8394  putative hydrolase  32.23 
 
 
290 aa  102  8e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06630  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  30.54 
 
 
297 aa  99  9e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3833  alpha/beta hydrolase fold protein  32.38 
 
 
302 aa  95.1  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.549204 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1199  alpha/beta hydrolase fold protein  29.86 
 
 
294 aa  87.4  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00792158  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4256  alpha/beta hydrolase fold protein  32.18 
 
 
310 aa  84.3  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.598911  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7821  alpha/beta hydrolase fold protein  27.43 
 
 
290 aa  83.6  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0513  putative hydrolase  30.24 
 
 
290 aa  84.3  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.36689  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2997  alpha/beta hydrolase fold protein  30.36 
 
 
292 aa  82.8  0.000000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.670306 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0822  alpha/beta hydrolase fold protein  30 
 
 
278 aa  72.8  0.000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000139933  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2328  alpha/beta hydrolase fold protein  27.94 
 
 
270 aa  63.5  0.000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.674989  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2250  alpha/beta hydrolase fold protein  34.21 
 
 
315 aa  57.4  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000261715  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2926  alpha/beta hydrolase fold protein  35.09 
 
 
273 aa  56.2  0.0000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.557091  normal  0.933948 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1359  short chain dehydrogenase  28.57 
 
 
602 aa  53.5  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3061  alpha/beta hydrolase fold  34.86 
 
 
280 aa  52.8  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2496  alpha/beta hydrolase fold protein  34.51 
 
 
277 aa  52.8  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4158  alpha/beta hydrolase fold  28.93 
 
 
264 aa  52  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1295  short chain dehydrogenase  27.92 
 
 
602 aa  52.4  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.101432  normal  0.699766 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5059  alpha/beta hydrolase fold  33.86 
 
 
284 aa  52.4  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0281  alpha/beta hydrolase fold  30.7 
 
 
270 aa  52  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3415  alpha/beta hydrolase fold  27.23 
 
 
256 aa  52.4  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2746  hydrolase, alpha/beta fold family  31.36 
 
 
287 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000102872 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1673  alpha/beta hydrolase fold  30.32 
 
 
296 aa  51.6  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.478799  normal  0.0522844 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2771  alpha/beta fold family hydrolase  31.36 
 
 
356 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000257271  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4289  alpha/beta hydrolase fold  28.93 
 
 
264 aa  50.1  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0263366 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2544  alpha/beta hydrolase fold  29.46 
 
 
285 aa  49.7  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0151545  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2542  hydrolase, alpha/beta fold family  31.09 
 
 
284 aa  49.7  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000110325 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  31.39 
 
 
272 aa  49.7  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.343862 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2473  carboxylesterase  26.51 
 
 
287 aa  49.3  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.283047  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0178  alpha/beta hydrolase fold protein  28.93 
 
 
264 aa  49.3  0.00008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2792  hydrolase, alpha/beta fold family  30.51 
 
 
287 aa  49.3  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00232409  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1033  alpha/beta hydrolase fold  31.58 
 
 
280 aa  49.3  0.00008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0702791 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  23.81 
 
 
265 aa  49.3  0.00008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  23.55 
 
 
262 aa  49.3  0.00009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1377  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 
279 aa  48.9  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2507  carboxylesterase  30.51 
 
 
287 aa  48.9  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00322402  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2551  alpha/beta fold family hydrolase  30.51 
 
 
287 aa  48.9  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.27575  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2195  alpha/beta hydrolase fold  33.59 
 
 
288 aa  48.9  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2738  alpha/beta fold family hydrolase  30.51 
 
 
287 aa  48.9  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.754882  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0177  Fis family transcriptional regulator  29.51 
 
 
264 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0763  alpha/beta fold family hydrolase  29.17 
 
 
323 aa  48.1  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1230  alpha/beta hydrolase fold  27.56 
 
 
261 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6602  alpha/beta hydrolase fold  27.56 
 
 
261 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.472817  normal  0.1504 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2114  alpha/beta hydrolase fold  30.15 
 
 
321 aa  47.4  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.502717  normal  0.171566 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5373  alpha/beta hydrolase fold  30.43 
 
 
337 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00480328 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3841  alpha/beta hydrolase fold  27.83 
 
 
267 aa  47.4  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.819174  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18650  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  32.14 
 
 
350 aa  47.4  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.303619  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5546  alpha/beta hydrolase fold protein  29.02 
 
 
264 aa  47  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2750  hydrolase, alpha/beta fold family  30.25 
 
 
284 aa  47  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.831392  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3768  alpha/beta hydrolase fold  27.83 
 
 
267 aa  47  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0429  alpha/beta hydrolase fold protein  31.06 
 
 
282 aa  47  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2496  alpha/beta hydrolase fold  26.78 
 
 
431 aa  46.6  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98231  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7125  putative epoxide hydrolase  33.33 
 
 
356 aa  46.6  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.675745  normal  0.932507 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3820  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
276 aa  46.2  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.787957  normal  0.0192298 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1808  short chain dehydrogenase  33.91 
 
 
596 aa  46.6  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.67175  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3243  alpha/beta hydrolase fold protein  34.86 
 
 
270 aa  46.2  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0133  streptothricin acetyltransferase Sat-1  29.69 
 
 
359 aa  46.2  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3859  alpha/beta hydrolase fold  33.02 
 
 
278 aa  46.6  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0259  alpha/beta hydrolase fold protein  29.63 
 
 
308 aa  46.2  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.951313  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0068  streptothricin acetyltransferase Sat-1  29.69 
 
 
336 aa  45.8  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.470432  normal  0.337184 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2058  alpha/beta hydrolase fold  28.03 
 
 
292 aa  45.4  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2250  alpha/beta hydrolase fold protein  25.74 
 
 
292 aa  45.4  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4800  alpha/beta hydrolase fold protein  32.2 
 
 
283 aa  45.8  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.176635  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5947  alpha/beta hydrolase fold  29.86 
 
 
390 aa  45.4  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00350915 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5931  alpha/beta hydrolase fold  26.2 
 
 
261 aa  45.8  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0123978 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1673  alpha/beta hydrolase fold protein  26.17 
 
 
267 aa  45.4  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.114563 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1384  alpha/beta hydrolase fold  31.03 
 
 
320 aa  45.4  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.276644  normal  0.809393 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4069  alpha/beta hydrolase fold  21.71 
 
 
285 aa  45.4  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  unclonable  0.0000534337 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5168  alpha/beta hydrolase fold protein  28.12 
 
 
281 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.464131 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3962  3-oxoadipate enol-lactonase  24.81 
 
 
266 aa  45.8  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.535477  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5437  alpha/beta hydrolase fold  28.35 
 
 
280 aa  45.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.204018  hitchhiker  0.00818802 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1900  putative hydrolase  23.72 
 
 
275 aa  44.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.118605  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3355  alpha/beta hydrolase fold  29.58 
 
 
313 aa  44.3  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000102808  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2174  short chain dehydrogenase  31.69 
 
 
596 aa  43.9  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.828892  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5072  alpha/beta hydrolase fold protein  27.91 
 
 
281 aa  43.9  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.157677 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0913  short chain dehydrogenase  31.69 
 
 
596 aa  43.9  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.427766  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3972  alpha/beta hydrolase fold  31.03 
 
 
261 aa  44.3  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0820  short chain dehydrogenase  31.69 
 
 
596 aa  43.9  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0719  hypothetical protein  25.45 
 
 
283 aa  43.5  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.19261  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7313  Alpha/beta hydrolase fold  26.02 
 
 
303 aa  43.5  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1028  hypothetical protein  28.92 
 
 
318 aa  43.9  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3527  alpha/beta hydrolase fold protein  28.93 
 
 
294 aa  43.1  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4574  alpha/beta fold family hydrolase  27.83 
 
 
266 aa  43.5  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1681  alpha/beta hydrolase fold  28.81 
 
 
273 aa  43.1  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0641945  normal  0.147127 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0309  alpha/beta hydrolase fold  28.33 
 
 
262 aa  43.5  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28822  predicted protein  28.57 
 
 
386 aa  43.5  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16031  putative alpha/beta hydrolase superfamily protein  27.5 
 
 
323 aa  43.5  0.005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0269  hypothetical protein  25.19 
 
 
293 aa  43.5  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2954  hydrolase  27.35 
 
 
294 aa  43.5  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000251178  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3492  alpha/beta hydrolase fold  22.22 
 
 
270 aa  43.1  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1900  alpha/beta hydrolase fold  26.29 
 
 
271 aa  42.7  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1587  alpha/beta hydrolase fold protein  30 
 
 
301 aa  42.7  0.008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4916  alpha/beta hydrolase fold  29.2 
 
 
277 aa  42.7  0.008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.503338  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0111  alpha/beta hydrolase fold protein  24.06 
 
 
263 aa  42.4  0.009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3112  alpha/beta hydrolase fold  32.46 
 
 
315 aa  42.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.137258  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2983  alpha/beta hydrolase fold protein  28.93 
 
 
303 aa  42.4  0.01  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.283426 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>