More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2997 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_2997  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
292 aa  586  1e-166  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.670306 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8394  putative hydrolase  70.93 
 
 
290 aa  434  1e-121  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1199  alpha/beta hydrolase fold protein  64.75 
 
 
294 aa  370  1e-101  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00792158  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0513  putative hydrolase  58.42 
 
 
290 aa  302  4.0000000000000003e-81  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.36689  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3833  alpha/beta hydrolase fold protein  51.34 
 
 
302 aa  265  8.999999999999999e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.549204 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7821  alpha/beta hydrolase fold protein  44.25 
 
 
290 aa  212  7e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4256  alpha/beta hydrolase fold protein  47.04 
 
 
310 aa  209  3e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.598911  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06630  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  42.91 
 
 
297 aa  164  1.0000000000000001e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0822  alpha/beta hydrolase fold protein  41.61 
 
 
278 aa  153  4e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000139933  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0473  hypothetical protein  30.96 
 
 
307 aa  87  4e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.225161  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2798  alpha/beta hydrolase fold protein  28.09 
 
 
270 aa  71.6  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  27.03 
 
 
273 aa  69.3  0.00000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4115  alpha/beta hydrolase fold  27.86 
 
 
280 aa  68.9  0.00000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4985  SHCHC synthase  25.98 
 
 
270 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.30423  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3492  alpha/beta hydrolase fold  28 
 
 
270 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0569  alpha/beta hydrolase fold protein  27.64 
 
 
270 aa  65.1  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3232  3-oxoadipate enol-lactonase  30.15 
 
 
277 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2225  alpha/beta hydrolase fold  27.8 
 
 
273 aa  63.5  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4996  hydrolase, alpha/beta fold family  25.49 
 
 
270 aa  62.8  0.000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.556402  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  28.63 
 
 
265 aa  62.8  0.000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5014  alpha/beta fold family hydrolase  25.49 
 
 
270 aa  62.4  0.000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0253  hydrolase, alpha/beta fold family  25.59 
 
 
270 aa  62.4  0.000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000360358  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1149  alpha/beta hydrolase fold protein  26.06 
 
 
265 aa  62  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4321  alpha/beta hydrolase fold  28.9 
 
 
280 aa  62  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0798376 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2349  alpha/beta hydrolase fold protein  35.71 
 
 
288 aa  61.6  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.21563  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0369  alpha/beta hydrolase fold protein  29.55 
 
 
262 aa  60.8  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.598497 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  29.33 
 
 
279 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3415  alpha/beta hydrolase fold  27.67 
 
 
256 aa  61.2  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2975  alpha/beta hydrolase fold protein  27.92 
 
 
307 aa  60.8  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0531  alpha/beta hydrolase fold  29.2 
 
 
264 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0176995 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1968  putative alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 
259 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0153168  normal  0.143128 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  28.69 
 
 
261 aa  59.7  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0152  alpha/beta hydrolase fold  30.19 
 
 
279 aa  60.1  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.632153 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1310  alpha/beta hydrolase fold  26.72 
 
 
269 aa  59.3  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.557665  normal  0.708974 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3988  alpha/beta hydrolase fold protein  28.9 
 
 
263 aa  58.9  0.00000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0712  alpha/beta hydrolase fold protein  27.1 
 
 
260 aa  58.5  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0413  alpha/beta hydrolase fold  29.86 
 
 
257 aa  58.5  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.732531  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1989  alpha/beta hydrolase fold  29.48 
 
 
235 aa  58.5  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.512291  normal  0.434462 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  28.4 
 
 
265 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3910  alpha/beta hydrolase fold  29.36 
 
 
263 aa  58.9  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.399825  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1142  Alpha/beta hydrolase  36.75 
 
 
307 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.627946  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2355  alpha/beta fold family hydrolase  37.38 
 
 
345 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.110523  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2163  proline-specific peptidase  25.37 
 
 
295 aa  57.8  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2526  alpha/beta hydrolase fold  26.29 
 
 
275 aa  57.8  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4749  alpha/beta fold family hydrolase  25.49 
 
 
270 aa  57.4  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5110  alpha/beta fold family hydrolase  25.49 
 
 
270 aa  57.4  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.98697  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5623  alpha/beta hydrolase fold  36.97 
 
 
312 aa  57  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1681  alpha/beta hydrolase fold  28.2 
 
 
273 aa  57.4  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0641945  normal  0.147127 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1914  proline-specific peptidase  27.41 
 
 
305 aa  57.4  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.094773 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4878  alpha/beta hydrolase fold  27.07 
 
 
281 aa  57.4  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.345435  normal  0.558043 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2101  alpha/beta hydrolase fold  35 
 
 
285 aa  57  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.715377  normal  0.912757 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3691  alpha/beta hydrolase fold  36.97 
 
 
312 aa  57  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1112  alpha/beta hydrolase fold  33.04 
 
 
261 aa  57  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.64134 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4677  alpha/beta hydrolase fold  36.97 
 
 
312 aa  57  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.246976  normal  0.206505 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  26.69 
 
 
267 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4967  hydrolase, alpha/beta fold family  25.49 
 
 
270 aa  56.2  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4518  alpha/beta hydrolase fold  36.79 
 
 
342 aa  56.2  0.0000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0590754  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4650  alpha/beta hydrolase fold protein  36.79 
 
 
342 aa  56.2  0.0000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0286073 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22460  alpha/beta family hydrolase  29.64 
 
 
275 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.241397  hitchhiker  0.0000000538784 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4696  alpha/beta hydrolase fold  24.71 
 
 
270 aa  56.2  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0619  alpha/beta hydrolase fold  30.28 
 
 
291 aa  56.2  0.0000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4529  alpha/beta hydrolase fold  35.9 
 
 
311 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.190868 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3015  alpha/beta hydrolase fold  33.66 
 
 
287 aa  56.2  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4587  hydrolase; menaquinone biosynthesis related protein; prolyl aminopeptidase  25.49 
 
 
270 aa  55.8  0.0000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2292  alpha/beta hydrolase fold  27.48 
 
 
275 aa  55.8  0.0000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.288944 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2496  alpha/beta hydrolase fold  29.22 
 
 
431 aa  55.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98231  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4609  hydrolase; menaquinone biosynthesis related protein; prolyl aminopeptidase  24.02 
 
 
270 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3496  alpha/beta hydrolase fold  24.81 
 
 
289 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.340747  normal  0.70145 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1917  alpha/beta hydrolase fold protein  25.78 
 
 
278 aa  54.3  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  26.25 
 
 
272 aa  54.7  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.343862 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1900  putative hydrolase  28.74 
 
 
275 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.118605  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0088  alpha/beta hydrolase fold protein  30.68 
 
 
260 aa  53.9  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4933  alpha/beta hydrolase fold  28.11 
 
 
362 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4655  3-oxoadipate enol-lactonase  27.24 
 
 
393 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.32763  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2522  alpha/beta fold family hydrolase  34.91 
 
 
317 aa  53.5  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1796  short chain dehydrogenase  36.28 
 
 
590 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.425571  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  24.22 
 
 
270 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1006  alpha/beta fold family hydrolase  34.91 
 
 
317 aa  53.5  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.36915  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0337  alpha/beta hydrolase fold  29.33 
 
 
261 aa  53.5  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0245494  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21050  short chain dehydrogenase  36.19 
 
 
592 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0561  EphD  34.91 
 
 
317 aa  53.5  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.284331  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1344  alpha/beta fold family hydrolase  34.91 
 
 
317 aa  53.5  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3331  alpha/beta hydrolase fold  34.65 
 
 
340 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0127235  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2679  alpha/beta hydrolase fold  33.66 
 
 
288 aa  53.1  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.113925  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4071  alpha/beta hydrolase fold  34.91 
 
 
310 aa  53.1  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1267  alpha/beta fold family hydrolase  34.91 
 
 
317 aa  53.1  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4186  alpha/beta hydrolase fold protein  26.44 
 
 
297 aa  53.1  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3847  Alpha/beta hydrolase fold-1  28.44 
 
 
263 aa  52.8  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0772  alpha/beta fold family hydrolase  24.24 
 
 
271 aa  53.1  0.000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4016  alpha/beta hydrolase fold  35.77 
 
 
303 aa  53.1  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.459613  normal  0.722956 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1179  alpha/beta hydrolase fold protein  28.34 
 
 
278 aa  52.8  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0798469  normal  0.0102944 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1477  proline iminopeptidase like protein  24.51 
 
 
297 aa  52.8  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.140845 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2058  alpha/beta hydrolase fold  32 
 
 
292 aa  52.4  0.000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3910  alpha/beta hydrolase fold  28.73 
 
 
300 aa  52.8  0.000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.838844  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1520  alpha/beta hydrolase fold  25.09 
 
 
273 aa  52.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.495724  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2122  alpha/beta hydrolase fold  26.09 
 
 
249 aa  52.4  0.000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.237751 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3803  alpha/beta hydrolase fold  28.22 
 
 
252 aa  52.4  0.000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2572  alpha/beta hydrolase fold protein  29.37 
 
 
263 aa  52  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4841  alpha/beta hydrolase fold protein  34.55 
 
 
266 aa  52.4  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3289  alpha/beta hydrolase fold  33.04 
 
 
250 aa  52  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.931458  normal  0.0266601 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>