96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0822 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_0822  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
278 aa  532  1e-150  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000139933  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06630  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  54.68 
 
 
297 aa  270  2e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4256  alpha/beta hydrolase fold protein  43.46 
 
 
310 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.598911  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1199  alpha/beta hydrolase fold protein  43.01 
 
 
294 aa  157  1e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00792158  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0513  putative hydrolase  42.24 
 
 
290 aa  157  2e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.36689  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3833  alpha/beta hydrolase fold protein  43.3 
 
 
302 aa  155  6e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.549204 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2997  alpha/beta hydrolase fold protein  41.24 
 
 
292 aa  144  2e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.670306 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8394  putative hydrolase  37.41 
 
 
290 aa  135  7.000000000000001e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7821  alpha/beta hydrolase fold protein  37.05 
 
 
290 aa  130  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0473  hypothetical protein  30 
 
 
307 aa  72.8  0.000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.225161  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0531  alpha/beta hydrolase fold  32.03 
 
 
264 aa  66.2  0.0000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0176995 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4115  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 
280 aa  62.4  0.000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1226  alpha/beta hydrolase fold protein  28.33 
 
 
292 aa  55.5  0.0000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00330311  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2388  3-oxoadipate enol-lactonase  29.55 
 
 
386 aa  54.3  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1310  alpha/beta hydrolase fold  30.95 
 
 
269 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.557665  normal  0.708974 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1827  alpha/beta hydrolase fold  23.38 
 
 
260 aa  53.5  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.518334  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0644  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  30.2 
 
 
364 aa  53.5  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.283453 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1578  hypothetical protein  38.18 
 
 
305 aa  51.6  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.289717  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36070  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  30.64 
 
 
313 aa  51.6  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.338915  normal  0.660761 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0569  alpha/beta hydrolase fold protein  30.52 
 
 
270 aa  52  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4587  hydrolase; menaquinone biosynthesis related protein; prolyl aminopeptidase  25.81 
 
 
270 aa  50.8  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3018  alpha/beta hydrolase fold  26.62 
 
 
262 aa  51.2  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4967  hydrolase, alpha/beta fold family  25.81 
 
 
270 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4985  SHCHC synthase  26.64 
 
 
270 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.30423  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0758  alpha/beta hydrolase fold  30.07 
 
 
253 aa  50.4  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.294799  hitchhiker  0.00454433 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1230  alpha/beta hydrolase fold  26.36 
 
 
261 aa  50.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1030  alpha/beta hydrolase fold  23.29 
 
 
280 aa  50.1  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.999949  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4996  hydrolase, alpha/beta fold family  26.61 
 
 
270 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.556402  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6602  alpha/beta hydrolase fold  26.36 
 
 
261 aa  50.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.472817  normal  0.1504 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5996  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)  28.19 
 
 
260 aa  50.1  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5014  alpha/beta fold family hydrolase  26.61 
 
 
270 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0361  alpha/beta hydrolase fold  24.71 
 
 
290 aa  49.3  0.00006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3036  alpha/beta hydrolase fold protein  32.23 
 
 
310 aa  49.3  0.00007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4749  alpha/beta fold family hydrolase  25.4 
 
 
270 aa  48.5  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4069  alpha/beta hydrolase fold  22.83 
 
 
285 aa  48.5  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  unclonable  0.0000534337 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1509  alpha/beta hydrolase fold  24.91 
 
 
287 aa  48.5  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0309  alpha/beta hydrolase fold  24.9 
 
 
262 aa  48.5  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5110  alpha/beta fold family hydrolase  25.4 
 
 
270 aa  48.5  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.98697  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1945  alpha/beta hydrolase fold  24.22 
 
 
346 aa  48.5  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6938  alpha/beta hydrolase fold protein  25.36 
 
 
279 aa  48.1  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.178748 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3812  alpha/beta hydrolase fold  31.58 
 
 
239 aa  47.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.281797  normal  0.255747 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0177  Fis family transcriptional regulator  26.85 
 
 
264 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2798  alpha/beta hydrolase fold protein  27.24 
 
 
270 aa  47.4  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0597  alpha/beta hydrolase fold protein  30.52 
 
 
281 aa  47  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.537366  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4289  alpha/beta hydrolase fold  26.85 
 
 
264 aa  47  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0263366 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004031  2-succinyl-6-hydroxy-2, 4-cyclohexadiene-1-carboxylate synthase  23.25 
 
 
275 aa  46.6  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0369  alpha/beta hydrolase fold protein  39.39 
 
 
262 aa  46.2  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.598497 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03993  putative bioH protein  28.4 
 
 
269 aa  46.2  0.0007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.39714  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1637  alpha/beta hydrolase fold  24.24 
 
 
287 aa  45.8  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0814  alpha/beta hydrolase fold  26.18 
 
 
301 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4608  alpha/beta hydrolase fold  25.28 
 
 
301 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.692037  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3779  cyclic nucleotide-binding protein  33 
 
 
453 aa  45.8  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0440455  normal  0.0476196 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2481  alpha/beta hydrolase fold protein  29.17 
 
 
275 aa  45.1  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4624  alpha/beta fold family hydrolase  27.27 
 
 
299 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.186809  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3471  alpha/beta hydrolase  33.33 
 
 
303 aa  45.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0592  alpha/beta hydrolase fold  23.96 
 
 
294 aa  45.4  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0128  alpha/beta hydrolase fold  29.8 
 
 
262 aa  45.1  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4158  alpha/beta hydrolase fold  26.22 
 
 
264 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3492  alpha/beta hydrolase fold  26.45 
 
 
270 aa  44.7  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0088  alpha/beta hydrolase fold protein  30.59 
 
 
260 aa  44.3  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3725  3-oxoadipate enol-lactonase  25.99 
 
 
263 aa  44.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0925  3-oxoadipate enol-lactonase  27.5 
 
 
262 aa  44.3  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.407594  normal  0.195291 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0396  alpha/beta hydrolase fold protein  30.31 
 
 
255 aa  44.3  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.075233 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1232  alpha/beta hydrolase fold protein  22.26 
 
 
277 aa  44.3  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0253  hydrolase, alpha/beta fold family  25.48 
 
 
270 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000360358  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1897  alpha/beta hydrolase fold  26.03 
 
 
288 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0651937  normal  0.589442 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0178  alpha/beta hydrolase fold protein  26.77 
 
 
264 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0787  alpha/beta hydrolase fold  37.63 
 
 
264 aa  44.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8642  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  30.57 
 
 
321 aa  43.9  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0871  alpha/beta fold family hydrolase  27.71 
 
 
285 aa  43.5  0.003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0195486  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1360  alpha/beta hydrolase fold  30.46 
 
 
251 aa  43.9  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.266873  normal  0.613317 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1917  alpha/beta hydrolase fold protein  27.17 
 
 
278 aa  43.5  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0961  alpha/beta superfamily hydrolase/acyltransferase  29.29 
 
 
277 aa  43.5  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0413  alpha/beta hydrolase fold  41.27 
 
 
257 aa  43.5  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.732531  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1245  alpha/beta hydrolase fold  28.2 
 
 
290 aa  43.9  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.433154 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4126  alpha/beta hydrolase fold  40.66 
 
 
393 aa  43.9  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000164833  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1017  hypothetical protein  25.7 
 
 
234 aa  43.9  0.003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0636  putative hydrolase, alpha/beta fold family  28.24 
 
 
247 aa  43.5  0.004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.208223  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1876  hypothetical protein  26.02 
 
 
300 aa  43.5  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3049  alpha/beta hydrolase fold  23.68 
 
 
256 aa  43.5  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.652408  normal  0.351837 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1649  alpha/beta fold family hydrolase  35.29 
 
 
318 aa  43.5  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.605923  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1046  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  28.28 
 
 
256 aa  43.1  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0289895  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1587  alpha/beta hydrolase fold protein  27.6 
 
 
301 aa  43.1  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2645  Alpha/beta hydrolase  24.29 
 
 
289 aa  43.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0678318 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1890  alpha/beta hydrolase fold  26.03 
 
 
288 aa  43.1  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0538139  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2753  hypothetical protein  29.73 
 
 
293 aa  42.7  0.006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.999004  normal  0.272807 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2251  3-oxoadipate enol-lactonase  27.08 
 
 
262 aa  42.7  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04395  hydrolase, alpha/beta fold family protein  31.13 
 
 
263 aa  42.7  0.007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.681804  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5478  Alpha/beta hydrolase fold  24.02 
 
 
335 aa  42.7  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2878  alpha/beta hydrolase fold  25.68 
 
 
323 aa  42.4  0.008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1880  hydrolase, putative  37.63 
 
 
277 aa  42.4  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4696  alpha/beta hydrolase fold  23.75 
 
 
270 aa  42.4  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2429  alpha/beta hydrolase fold protein  25.57 
 
 
288 aa  42.4  0.009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0133787  normal  0.21299 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1720  thioesterase, menaquinone synthesis protein  23.41 
 
 
265 aa  42  0.01  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2731  hypothetical protein  38.55 
 
 
279 aa  42  0.01  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0069  alpha/beta hydrolase fold  30.59 
 
 
260 aa  42  0.01  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>