More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0636 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0636  putative hydrolase, alpha/beta fold family  100 
 
 		 247 aa  505  9.999999999999999e-143  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.208223  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0810  alpha/beta hydrolase fold  51.39 
 
 		 264 aa  247  1e-64  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0122335  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1155  alpha/beta hydrolase fold  51.87 
 
 		 256 aa  244  6.999999999999999e-64  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.230861  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1048  alpha/beta hydrolase fold protein  51.24 
 
 		 239 aa  239  2.9999999999999997e-62  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1214  hypothetical protein  51.04 
 
 		 239 aa  232  3e-60  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0887  hypothetical protein  50.62 
 
 		 239 aa  230  2e-59  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0817  hypothetical protein  50.62 
 
 		 239 aa  230  2e-59  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.467529  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0930  alpha/beta hydrolase fold  56.62 
 
 		 353 aa  226  2e-58  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.262711  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1207  Alpha/beta hydrolase fold  44.31 
 
 		 245 aa  212  2.9999999999999995e-54  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0487  alpha/beta hydrolase fold  35.68 
 
 		 240 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2481  alpha/beta hydrolase fold protein  23.41 
 
 		 275 aa  92.8  4e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3133  alpha/beta hydrolase fold  27.6 
 
 		 269 aa  75.9  0.0000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1247  alpha/beta hydrolase fold protein  28.06 
 
 		 314 aa  74.7  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00163 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4919  alpha/beta hydrolase fold protein  23.45 
 
 		 284 aa  73.9  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.582438  normal  0.155895 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1259  alpha/beta hydrolase fold  21.92 
 
 		 284 aa  70.1  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3779  cyclic nucleotide-binding protein  22.03 
 
 		 453 aa  69.7  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0440455  normal  0.0476196 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0597  alpha/beta hydrolase fold protein  26.63 
 
 		 281 aa  69.7  0.00000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.537366  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2212  putative lipase  26.27 
 
 		 315 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.799877  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25910  putative lipase  26.27 
 
 		 315 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0600573 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1659  alpha/beta hydrolase fold  27.21 
 
 		 270 aa  67  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00584472  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  26.07 
 
 		 309 aa  65.5  0.0000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3798  alpha/beta hydrolase fold protein  23.81 
 
 		 258 aa  63.9  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1827  alpha/beta hydrolase fold  26.32 
 
 		 260 aa  62.8  0.000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.518334  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2793  alpha/beta hydrolase fold protein  24.5 
 
 		 281 aa  60.8  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.370056 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0892  alpha/beta hydrolase fold  23.02 
 
 		 272 aa  60.1  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0423954 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1392  Poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  24 
 
 		 301 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.507189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2696  alpha/beta hydrolase fold  22.12 
 
 		 312 aa  58.2  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0198  alpha/beta hydrolase fold  26.51 
 
 		 311 aa  57.8  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.593906 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1030  alpha/beta hydrolase fold  24.76 
 
 		 280 aa  57  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.999949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3731  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.01 
 
 		 372 aa  56.6  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6643  putative triacylglycerol lipase  24.27 
 
 		 275 aa  56.6  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192902  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2437  alpha/beta hydrolase fold  22.37 
 
 		 251 aa  56.6  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1970  alpha/beta hydrolase fold  24.77 
 
 		 311 aa  56.6  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000319634  normal  0.0578642 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2253  alpha/beta hydrolase fold  24.15 
 
 		 309 aa  56.6  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.128112  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1988  alpha/beta hydrolase superfamily protein  24.38 
 
 		 321 aa  56.2  0.0000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.150126 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1459  alpha/beta hydrolase fold  24.88 
 
 		 276 aa  55.8  0.0000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2405  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  23.27 
 
 		 369 aa  55.8  0.0000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0222007  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2065  cyclic nucleotide-binding protein  22.81 
 
 		 462 aa  55.8  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2918  alpha/beta hydrolase fold  21.8 
 
 		 312 aa  55.5  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.906544 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0931  alpha/beta hydrolase fold family lipase  26.2 
 
 		 291 aa  55.5  0.0000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000302651  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0353  alpha/beta hydrolase fold  22.71 
 
 		 256 aa  55.1  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3530  bioH protein  23.73 
 
 		 260 aa  54.7  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4195  alpha/beta hydrolase fold protein  21.92 
 
 		 308 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.558809 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1100  hydrolase, alpha/beta fold family  25.76 
 
 		 291 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.59036e-57 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3200  bioH protein  23.62 
 
 		 259 aa  55.1  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.111327  normal  0.0170475 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0953  alpha/beta fold family hydrolase  25.76 
 
 		 291 aa  54.3  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1019  alpha/beta fold family hydrolase  25.76 
 
 		 291 aa  54.3  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00544898  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2741  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase-like protein  24.68 
 
 		 288 aa  53.9  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.127946  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  24.03 
 
 		 350 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0940  alpha/beta hydrolase fold  23.75 
 
 		 290 aa  53.9  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.178351  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  23.29 
 
 		 290 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0396  alpha/beta hydrolase fold protein  24.14 
 
 		 255 aa  54.3  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.075233 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3846  hydrolase, alpha/beta fold family  25.71 
 
 		 271 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0939  alpha/beta hydrolase fold family lipase  24.17 
 
 		 291 aa  53.9  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000150383  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4241  hydrolase, alpha/beta fold family  24.17 
 
 		 290 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0213697  hitchhiker  0.0000000245564 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2534  alpha/beta hydrolase fold  29.52 
 
 		 330 aa  53.9  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1057  hydrolase, alpha/beta fold family  23.75 
 
 		 290 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000161202  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4921  alpha/beta hydrolase fold  23.42 
 
 		 322 aa  53.5  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1786  cyclic nucleotide-binding protein  20.92 
 
 		 462 aa  53.5  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00355982 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4453  alpha/beta hydrolase fold  22.76 
 
 		 279 aa  53.5  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522171 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4606  alpha/beta hydrolase fold  22.22 
 
 		 269 aa  53.1  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4511  alpha/beta fold family non-heme chloroperoxidase  21.6 
 
 		 269 aa  53.1  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1513  Alpha/beta hydrolase fold  21.96 
 
 		 293 aa  53.1  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1990  alpha/beta hydrolase fold protein  23.85 
 
 		 308 aa  53.1  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000207277 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4915  hydrolase, alpha/beta fold family  22 
 
 		 269 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0225  alpha/beta hydrolase fold  20.26 
 
 		 272 aa  53.1  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.701432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1578  hypothetical protein  23.5 
 
 		 305 aa  53.1  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.289717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  21.77 
 
 		 291 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0809  alpha/beta hydrolase fold  23.29 
 
 		 283 aa  52.8  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1120  alpha/beta fold family hydrolase  23.75 
 
 		 291 aa  52.8  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00823936  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4082  alpha/beta hydrolase fold  20.96 
 
 		 284 aa  52.8  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1186  hydrolase, alpha/beta fold family  23.75 
 
 		 291 aa  52.8  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000004858  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4896  hydrolase, alpha/beta fold family  21.6 
 
 		 269 aa  52.8  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0343  hydrolase, alpha/beta fold family  23.11 
 
 		 269 aa  52.8  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1258  putative hydrolase  21.33 
 
 		 312 aa  52.8  0.000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4026  alpha/beta hydrolase fold protein  24.53 
 
 		 298 aa  52.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0176  carboxylesterase  33 
 
 		 264 aa  52.4  0.000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1509  alpha/beta hydrolase fold  24.29 
 
 		 287 aa  52.4  0.000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1664  biotin biosynthesis protein  24.49 
 
 		 266 aa  52  0.000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000138969  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0774  esterase  21.49 
 
 		 295 aa  52  0.000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.391328  normal  0.148596 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4632  bioH protein  31 
 
 		 264 aa  52  0.000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2333  alpha/beta fold family hydrolase  29.41 
 
 		 280 aa  51.6  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4670  alpha/beta fold family hydrolase  21.6 
 
 		 269 aa  51.2  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2246  alpha/beta hydrolase fold protein  22.27 
 
 		 311 aa  51.6  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.1275  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2836  alpha/beta hydrolase fold protein  19.65 
 
 		 236 aa  51.6  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.387629  normal  0.68472 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4976  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  20.74 
 
 		 304 aa  51.6  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000041043  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4530  alpha/beta fold family non-heme chloroperoxidase  21.2 
 
 		 269 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00926815  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5030  alpha/beta fold family hydrolase  21.6 
 
 		 269 aa  51.2  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2147  alpha/beta hydrolase fold  26.4 
 
 		 278 aa  51.6  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4897  hydrolase, alpha/beta fold family  22.71 
 
 		 269 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2664  alpha/beta hydrolase fold protein  21.77 
 
 		 321 aa  51.2  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2925  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  22.68 
 
 		 298 aa  50.8  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.886643  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4929  alpha/beta fold family hydrolase  21.6 
 
 		 269 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3024  alpha/beta hydrolase fold protein  20.3 
 
 		 273 aa  50.8  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  hitchhiker  0.00214769 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3592  alpha/beta fold family hydrolase  31.25 
 
 		 271 aa  50.8  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.620275  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1463  Alpha/beta hydrolase  21.9 
 
 		 278 aa  50.8  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.234917  normal  0.480235 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3877  alpha/beta fold family hydrolase  31.25 
 
 		 271 aa  50.8  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2120  alpha/beta hydrolase fold protein  22.27 
 
 		 437 aa  50.4  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1637  alpha/beta hydrolase fold  22.66 
 
 		 287 aa  51.2  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0156  bioH protein  21.52 
 
 		 256 aa  51.2  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>