More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1048 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_1048  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 239 aa  489  1e-137  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1155  alpha/beta hydrolase fold  57.39 
 
 		 256 aa  259  3e-68  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.230861  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0810  alpha/beta hydrolase fold  54.35 
 
 		 264 aa  250  1e-65  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0122335  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0636  putative hydrolase, alpha/beta fold family  51.24 
 
 		 247 aa  239  2.9999999999999997e-62  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.208223  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1214  hypothetical protein  49.34 
 
 		 239 aa  218  6e-56  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0887  hypothetical protein  48.9 
 
 		 239 aa  217  2e-55  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0817  hypothetical protein  48.9 
 
 		 239 aa  217  2e-55  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.467529  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1207  Alpha/beta hydrolase fold  48.26 
 
 		 245 aa  214  8e-55  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0930  alpha/beta hydrolase fold  55.56 
 
 		 353 aa  214  8e-55  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.262711  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0487  alpha/beta hydrolase fold  37.39 
 
 		 240 aa  123  2e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4919  alpha/beta hydrolase fold protein  24.89 
 
 		 284 aa  80.9  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.582438  normal  0.155895 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2481  alpha/beta hydrolase fold protein  22.67 
 
 		 275 aa  70.5  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3798  alpha/beta hydrolase fold protein  26.52 
 
 		 258 aa  68.6  0.00000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1247  alpha/beta hydrolase fold protein  27.8 
 
 		 314 aa  67.4  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00163 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  25.11 
 
 		 309 aa  66.2  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3756  alpha/beta hydrolase fold  26.09 
 
 		 504 aa  64.7  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.740741  normal  0.0321393 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2793  alpha/beta hydrolase fold protein  26.01 
 
 		 281 aa  64.3  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.370056 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0892  alpha/beta hydrolase fold  24.29 
 
 		 272 aa  63.9  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0423954 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2120  alpha/beta hydrolase fold protein  24.6 
 
 		 437 aa  62.4  0.000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1108  alpha/beta hydrolase fold  18.7 
 
 		 246 aa  62  0.000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00367251  hitchhiker  0.00365287 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2212  putative lipase  25.33 
 
 		 315 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.799877  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2527  esterase-like  25.89 
 
 		 280 aa  61.6  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25910  putative lipase  25.33 
 
 		 315 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0600573 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3143  alpha/beta hydrolase fold  24.07 
 
 		 309 aa  60.5  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.03403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  25 
 
 		 287 aa  59.3  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3779  cyclic nucleotide-binding protein  22.07 
 
 		 453 aa  58.5  0.00000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0440455  normal  0.0476196 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0726  Alpha/beta hydrolase fold  24.51 
 
 		 297 aa  58.5  0.00000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.418477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6643  putative triacylglycerol lipase  24.6 
 
 		 275 aa  57.8  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192902  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0353  alpha/beta hydrolase fold  26.11 
 
 		 256 aa  58.2  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  23.31 
 
 		 275 aa  56.6  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0174  cyclic nucleotide-binding protein  23.18 
 
 		 456 aa  56.2  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000271627  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0597  alpha/beta hydrolase fold protein  25.75 
 
 		 281 aa  56.6  0.0000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.537366  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0225  alpha/beta hydrolase fold  24.08 
 
 		 272 aa  56.6  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.701432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5083  3-oxoadipate enol-lactonase  24.02 
 
 		 260 aa  55.8  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2065  cyclic nucleotide-binding protein  21.17 
 
 		 462 aa  55.1  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3235  alpha/beta hydrolase fold  21.6 
 
 		 316 aa  54.7  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.423188  normal  0.602457 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0023  alpha/beta hydrolase fold  26.34 
 
 		 315 aa  54.7  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00672386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2836  alpha/beta hydrolase fold protein  24.45 
 
 		 236 aa  54.3  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.387629  normal  0.68472 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0316  alpha/beta hydrolase fold  24.78 
 
 		 316 aa  54.3  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00247828  hitchhiker  0.00660595 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  24.5 
 
 		 290 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  23.62 
 
 		 296 aa  53.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4614  alpha/beta hydrolase fold protein  23.01 
 
 		 279 aa  53.1  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2446  alpha/beta hydrolase fold protein  32.76 
 
 		 309 aa  53.1  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.969901  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1402  alpha/beta hydrolase fold protein  24.21 
 
 		 298 aa  52.8  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0653602  normal  0.476592 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0337  alpha/beta hydrolase fold  25.89 
 
 		 261 aa  52.8  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0245494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0396  alpha/beta hydrolase fold protein  23.38 
 
 		 255 aa  52.8  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.075233 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3014  alpha/beta hydrolase fold protein  27.23 
 
 		 340 aa  52.4  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3791  alpha/beta hydrolase fold  23.7 
 
 		 287 aa  52.4  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2922  alpha/beta hydrolase fold protein  23.14 
 
 		 282 aa  52.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4082  alpha/beta hydrolase fold  23.27 
 
 		 284 aa  52  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3361  alpha/beta hydrolase fold  26.87 
 
 		 340 aa  52  0.000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.013073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3174  alpha/beta hydrolase fold protein  23.14 
 
 		 282 aa  52  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3787  alpha/beta hydrolase fold  23.7 
 
 		 287 aa  52  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265139  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3860  alpha/beta hydrolase fold  23.7 
 
 		 287 aa  52  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  24.71 
 
 		 299 aa  51.6  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37110  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  25.45 
 
 		 268 aa  51.6  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  22.97 
 
 		 315 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3133  alpha/beta hydrolase fold  25.21 
 
 		 269 aa  51.6  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2086  alpha/beta hydrolase fold protein  28.64 
 
 		 263 aa  51.6  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  24.1 
 
 		 291 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4774  alpha/beta fold family hydrolase  22.59 
 
 		 279 aa  50.8  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4636  alpha/beta hydrolase fold protein  22.59 
 
 		 279 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5136  alpha/beta fold family hydrolase  22.59 
 
 		 279 aa  50.8  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0774  esterase  32.73 
 
 		 295 aa  50.4  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.391328  normal  0.148596 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1468  alpha/beta hydrolase fold  25.64 
 
 		 340 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.890362 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5015  hydrolase, alpha/beta fold family  22.59 
 
 		 279 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  24.27 
 
 		 314 aa  50.8  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  24.79 
 
 		 295 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0993  alpha/beta hydrolase fold  23.24 
 
 		 345 aa  50.8  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.87511  unclonable  0.000000000579867 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1937  alpha/beta hydrolase fold protein  23.53 
 
 		 299 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.926814 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2290  bioH protein  33.94 
 
 		 268 aa  50.1  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  24.67 
 
 		 350 aa  50.1  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3121  hypothetical protein  26.95 
 
 		 259 aa  50.1  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000331929  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2809  alpha/beta hydrolase fold protein  30.49 
 
 		 302 aa  50.4  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5048  hydrolase, alpha/beta fold family  21.46 
 
 		 279 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4238  3-oxoadipate enol-lactonase  25.75 
 
 		 262 aa  49.7  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.368271 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0198  alpha/beta hydrolase fold  31.71 
 
 		 311 aa  49.7  0.00004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.593906 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2766  alpha/beta hydrolase fold protein  39.74 
 
 		 277 aa  49.7  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3083  alpha/beta hydrolase fold  23.83 
 
 		 292 aa  49.7  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000632175  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4507  alpha/beta hydrolase fold  29.71 
 
 		 295 aa  49.3  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5043  alpha/beta fold family hydrolase  22.59 
 
 		 279 aa  49.3  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1259  alpha/beta hydrolase fold  20.44 
 
 		 284 aa  49.3  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3779  alpha/beta fold family hydrolase  29.03 
 
 		 271 aa  49.3  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.385884  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4236  alpha/beta hydrolase fold protein  25 
 
 		 301 aa  48.9  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3504  alpha/beta fold family hydrolase  32.26 
 
 		 271 aa  49.3  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0369292  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6938  alpha/beta hydrolase fold protein  25.45 
 
 		 279 aa  48.9  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.178748 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1827  alpha/beta hydrolase fold  22.27 
 
 		 260 aa  48.9  0.00006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.518334  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3530  bioH protein  27.62 
 
 		 260 aa  48.9  0.00007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1553  alpha/beta hydrolase fold protein  25 
 
 		 286 aa  48.9  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000230075  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0198  hydrolase, alpha/beta fold family  22.18 
 
 		 279 aa  48.5  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3040  alpha/beta fold family hydrolase  34.57 
 
 		 258 aa  48.9  0.00008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1827  alpha/beta hydrolase fold  25.59 
 
 		 285 aa  48.9  0.00008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3452  alpha/beta hydrolase fold  25.96 
 
 		 311 aa  48.5  0.00008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.156566  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7062  alpha/beta hydrolase fold  28.68 
 
 		 296 aa  48.5  0.00009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3592  alpha/beta fold family hydrolase  31.18 
 
 		 271 aa  47.8  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.620275  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2405  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  23.94 
 
 		 369 aa  48.5  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0222007  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2485  alpha/beta hydrolase fold  35.44 
 
 		 353 aa  47.8  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.125677 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3952  alpha/beta hydrolase fold  23.67 
 
 		 340 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3126  alpha/beta hydrolase fold  21.46 
 
 		 303 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal  0.0127742 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3505  bioH protein  31.45 
 
 		 260 aa  48.1  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>