More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2253 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_2253  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 309 aa  624  1e-178  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.128112  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1990  alpha/beta hydrolase fold protein  74.16 
 
 		 308 aa  441  1e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000207277 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12500  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  38.36 
 
 		 351 aa  178  9e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.621112  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  26.67 
 
 		 299 aa  80.1  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  27.65 
 
 		 309 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2792  alpha/beta hydrolase fold protein  28.91 
 
 		 260 aa  77.4  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.377437 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0504  inner-membrane translocator  26.07 
 
 		 571 aa  77  0.0000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.92013  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  30.17 
 
 		 308 aa  75.9  0.0000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5198  alpha/beta hydrolase fold protein  25.33 
 
 		 290 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.45411e-23 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  29.01 
 
 		 287 aa  75.1  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  26.05 
 
 		 339 aa  73.9  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1230  alpha/beta hydrolase fold  24.25 
 
 		 261 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6602  alpha/beta hydrolase fold  24.25 
 
 		 261 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.472817  normal  0.1504 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5072  alpha/beta hydrolase fold protein  26.74 
 
 		 281 aa  70.5  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.157677 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  28.72 
 
 		 286 aa  70.1  0.00000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  26.07 
 
 		 315 aa  69.3  0.00000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0316  alpha/beta hydrolase fold  28.68 
 
 		 316 aa  68.6  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00247828  hitchhiker  0.00660595 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2592  alpha/beta hydrolase fold protein  27.02 
 
 		 289 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1778  alpha/beta hydrolase fold  28.89 
 
 		 366 aa  68.6  0.0000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0401666  normal  0.253947 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3514  alpha/beta hydrolase fold protein  27.02 
 
 		 289 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  29.76 
 
 		 333 aa  67.4  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2047  Alpha/beta hydrolase fold  26.14 
 
 		 312 aa  66.2  0.0000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  28.22 
 
 		 291 aa  66.2  0.0000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  28.22 
 
 		 291 aa  66.2  0.0000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3000  alpha/beta hydrolase fold  26.14 
 
 		 253 aa  66.2  0.0000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  28.22 
 
 		 291 aa  66.2  0.0000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1217  alpha/beta hydrolase fold protein  26.76 
 
 		 335 aa  65.5  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3822  alpha/beta hydrolase fold  26.95 
 
 		 308 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0487  alpha/beta hydrolase fold  24.71 
 
 		 240 aa  65.1  0.000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1643  alpha/beta hydrolase fold  25.72 
 
 		 298 aa  64.7  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.450863 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2302  alpha/beta hydrolase fold  24.28 
 
 		 329 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1955  Alpha/beta hydrolase fold  25.45 
 
 		 339 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0521356  normal  0.151931 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5996  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)  23.48 
 
 		 260 aa  64.3  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3655  alpha/beta hydrolase fold  25.52 
 
 		 312 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2242  alpha/beta hydrolase fold  27.57 
 
 		 301 aa  64.3  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.545637  normal  0.560868 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6643  putative triacylglycerol lipase  26.55 
 
 		 275 aa  64.3  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192902  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0831  alpha/beta hydrolase fold  26.36 
 
 		 269 aa  64.3  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.37854  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1905  alpha/beta hydrolase fold  27.9 
 
 		 354 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3528  hypothetical protein  30.62 
 
 		 269 aa  63.9  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000191254  unclonable  0.00000397849 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8725  alpha/beta hydrolase fold protein  28.51 
 
 		 332 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1832  magnesium chelatase accessory protein  27.2 
 
 		 302 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0474032 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0102  alpha/beta hydrolase fold  28.22 
 
 		 332 aa  63.5  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4111  alpha/beta hydrolase fold protein  26.58 
 
 		 288 aa  63.9  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0346007  normal  0.0462514 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2137  alpha/beta hydrolase fold protein  25.67 
 
 		 363 aa  63.5  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0198184  normal  0.0171478 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6064  alpha/beta hydrolase fold protein  24.91 
 
 		 262 aa  63.9  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25213  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3798  alpha/beta hydrolase fold protein  24.24 
 
 		 258 aa  63.2  0.000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2696  alpha/beta hydrolase fold  26.25 
 
 		 312 aa  63.2  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1970  alpha/beta hydrolase fold  25.17 
 
 		 311 aa  63.2  0.000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000319634  normal  0.0578642 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0353  alpha/beta hydrolase fold  26.09 
 
 		 256 aa  62.8  0.000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1259  alpha/beta hydrolase fold  24.25 
 
 		 284 aa  62.8  0.000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3537  hydroxymuconic semialdehyde hydrolase  29.96 
 
 		 364 aa  62.8  0.000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0692853  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3237  alpha/beta hydrolase fold protein  27.78 
 
 		 284 aa  62.4  0.000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  26.44 
 
 		 284 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0476  Alpha/beta hydrolase  23.26 
 
 		 330 aa  62  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0831  alpha/beta hydrolase fold protein  24.42 
 
 		 344 aa  62.4  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0056  alpha/beta hydrolase fold  28.22 
 
 		 332 aa  62  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  25.58 
 
 		 290 aa  62  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0023  alpha/beta hydrolase fold  24.12 
 
 		 315 aa  61.2  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00672386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1023  alpha/beta hydrolase fold  27.41 
 
 		 284 aa  60.8  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0379  alpha/beta hydrolase fold  23.05 
 
 		 327 aa  60.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4130  alpha/beta hydrolase fold protein  27.05 
 
 		 301 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  25.19 
 
 		 314 aa  60.8  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1553  alpha/beta hydrolase fold protein  26.02 
 
 		 286 aa  60.1  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000230075  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1945  alpha/beta hydrolase fold  25.67 
 
 		 346 aa  60.1  0.00000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2918  alpha/beta hydrolase fold protein  34.48 
 
 		 310 aa  60.1  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000917268  normal  0.0712608 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3621  alpha/beta hydrolase fold protein  25 
 
 		 335 aa  60.1  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0448853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4310  alpha/beta hydrolase fold protein  25.17 
 
 		 309 aa  59.7  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.680972  normal  0.0221146 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1448  Alpha/beta hydrolase fold  24.06 
 
 		 286 aa  59.7  0.00000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2918  alpha/beta hydrolase fold  24.71 
 
 		 312 aa  59.7  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.906544 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1232  alpha/beta hydrolase fold protein  23.76 
 
 		 277 aa  59.7  0.00000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  26.57 
 
 		 562 aa  59.3  0.00000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1065  alpha/beta hydrolase fold  24.79 
 
 		 275 aa  59.3  0.00000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.289777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2626  alpha/beta hydrolase fold  21.86 
 
 		 330 aa  59.3  0.00000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0626174  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1258  putative hydrolase  25.1 
 
 		 312 aa  58.9  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06730  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  26.01 
 
 		 343 aa  58.9  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  27.15 
 
 		 291 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0919  alpha/beta hydrolase fold  24.51 
 
 		 320 aa  58.5  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.495242  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2154  alpha/beta hydrolase fold protein  26.34 
 
 		 257 aa  58.5  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0016859 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  27.03 
 
 		 295 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2582  alpha/beta fold family hydrolase  25 
 
 		 288 aa  57.8  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1799  Alpha/beta hydrolase fold  24.81 
 
 		 275 aa  57.8  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2200  alpha/beta hydrolase fold protein  25.26 
 
 		 278 aa  57.8  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0993  alpha/beta hydrolase fold  21.05 
 
 		 345 aa  57.8  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.87511  unclonable  0.000000000579867 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2178  alpha/beta hydrolase fold  31.15 
 
 		 288 aa  58.2  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.100362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2255  alpha/beta hydrolase fold  31.15 
 
 		 288 aa  58.2  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.170585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004122  putative esterase/lipase ybfF  23.28 
 
 		 255 aa  57.8  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000112375  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  28.87 
 
 		 264 aa  58.2  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1402  alpha/beta hydrolase fold protein  28.11 
 
 		 298 aa  57.8  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0653602  normal  0.476592 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  23.44 
 
 		 296 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0726  Alpha/beta hydrolase fold  25.18 
 
 		 297 aa  57.4  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.418477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0531  alpha/beta hydrolase fold  26.14 
 
 		 264 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0176995 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1681  alpha/beta hydrolase fold  26.36 
 
 		 273 aa  57.4  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0641945  normal  0.147127 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0351  alpha/beta hydrolase fold  24.23 
 
 		 275 aa  57.4  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.347807 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4676  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  26.41 
 
 		 331 aa  57.8  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.318593  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0912  alpha/beta hydrolase fold  27.06 
 
 		 264 aa  57  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2445  alpha/beta hydrolase fold  26.64 
 
 		 340 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.54824  normal  0.191947 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3194  alpha/beta hydrolase fold  28.26 
 
 		 309 aa  57  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0270844 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4692  hydrolase  24.26 
 
 		 313 aa  57  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.236013  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1412  alpha/beta fold family hydrolase  26.06 
 
 		 295 aa  57  0.0000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.405065 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1914  proline-specific peptidase  25.28 
 
 		 305 aa  57  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.094773 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>