More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1643 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1643  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
298 aa  616  1e-175  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.450863 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1644  alpha/beta hydrolase fold  61.99 
 
 
318 aa  401  1e-111  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0919  alpha/beta hydrolase fold  64.16 
 
 
320 aa  400  9.999999999999999e-111  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.495242  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2097  alpha/beta hydrolase fold  61.43 
 
 
324 aa  395  1e-109  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1567  alpha/beta hydrolase fold  57.73 
 
 
325 aa  382  1e-105  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0838089  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0669  epoxide hydrolase, putative  62.37 
 
 
320 aa  379  1e-104  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.276082  normal  0.0385204 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1217  alpha/beta hydrolase fold protein  41.67 
 
 
335 aa  246  4.9999999999999997e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1587  alpha/beta hydrolase fold protein  25.09 
 
 
301 aa  82.4  0.000000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4976  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  24.5 
 
 
304 aa  82  0.00000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000041043  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3967  alpha/beta hydrolase fold  34.17 
 
 
306 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4400  alpha/beta hydrolase fold  34.17 
 
 
306 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.334375 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0572  alpha/beta hydrolase fold  25.19 
 
 
266 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0604  alpha/beta hydrolase fold  25.17 
 
 
297 aa  74.3  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.791043 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5680  alpha/beta hydrolase fold protein  24.91 
 
 
324 aa  74.3  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1179  alpha/beta hydrolase fold protein  24.37 
 
 
278 aa  74.7  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0798469  normal  0.0102944 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1513  Alpha/beta hydrolase fold  25.81 
 
 
293 aa  73.9  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2922  alpha/beta hydrolase fold protein  25.09 
 
 
282 aa  73.9  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4122  alpha/beta hydrolase fold protein  27.59 
 
 
287 aa  73.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3174  alpha/beta hydrolase fold protein  25.09 
 
 
282 aa  73.9  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0675  arylesterase  24.11 
 
 
272 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  25.51 
 
 
291 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  25.51 
 
 
291 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  25.51 
 
 
291 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  25.45 
 
 
265 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  25.61 
 
 
264 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0774  esterase  28.11 
 
 
295 aa  70.9  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.391328  normal  0.148596 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3543  alpha/beta hydrolase fold  28.26 
 
 
268 aa  70.9  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.447096  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  25.44 
 
 
291 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0413  alpha/beta hydrolase fold  26.15 
 
 
257 aa  70.9  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.732531  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1463  Alpha/beta hydrolase  25.29 
 
 
278 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.234917  normal  0.480235 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  25.36 
 
 
315 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4812  alpha/beta hydrolase fold  24.83 
 
 
317 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.744056  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1736  alpha/beta hydrolase fold  26.24 
 
 
290 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4898  alpha/beta hydrolase fold  24.83 
 
 
317 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.451029  normal  0.0740318 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5198  alpha/beta hydrolase fold protein  23.96 
 
 
290 aa  70.1  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.45411e-23 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5199  alpha/beta hydrolase fold  24.5 
 
 
317 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0800557  hitchhiker  0.000578485 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0446  3-oxoadipate enol-lactonase  23.9 
 
 
264 aa  70.1  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36070  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  36.52 
 
 
313 aa  70.5  0.00000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.338915  normal  0.660761 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3083  alpha/beta hydrolase fold  28.47 
 
 
292 aa  70.1  0.00000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000632175  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1480  Alpha/beta hydrolase fold  23.51 
 
 
304 aa  69.7  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000123975  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3798  alpha/beta hydrolase fold protein  22.26 
 
 
258 aa  69.7  0.00000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1945  alpha/beta hydrolase fold  23.55 
 
 
346 aa  69.3  0.00000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4692  hydrolase  24.49 
 
 
313 aa  68.9  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.236013  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  23.83 
 
 
277 aa  68.9  0.00000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1450  alpha/beta hydrolase fold protein  27.16 
 
 
306 aa  68.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4478  Alpha/beta hydrolase fold  23.22 
 
 
272 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.785695  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3265  Alpha/beta hydrolase fold  24.41 
 
 
272 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.279729  normal  0.0341286 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1655  alpha/beta hydrolase fold  24.21 
 
 
331 aa  68.9  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2743  alpha/beta hydrolase fold  26.73 
 
 
331 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.529791  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  23.83 
 
 
292 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5429  alpha/beta hydrolase fold  24.45 
 
 
319 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.80867 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0595  putative lactone hydrolase  25 
 
 
265 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0419  alpha/beta hydrolase fold  24.58 
 
 
270 aa  67  0.0000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2886  alpha/beta hydrolase fold  31.47 
 
 
290 aa  67.4  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1367  3-oxoadipate enol-lactonase  22.96 
 
 
256 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0806  alpha/beta hydrolase fold  22.55 
 
 
279 aa  67  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0845651 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3143  alpha/beta hydrolase fold  23.94 
 
 
309 aa  67.4  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.03403  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4321  alpha/beta hydrolase fold  23.64 
 
 
280 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0798376 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1823  alpha/beta hydrolase fold protein  24.73 
 
 
322 aa  67.4  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1385  3-oxoadipate enol-lactonase  22.96 
 
 
256 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.279159  normal  0.947236 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2225  alpha/beta hydrolase fold  21.43 
 
 
273 aa  66.6  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2964  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 
282 aa  66.6  0.0000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2696  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 
312 aa  67  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11921  Alpha/beta hydrolase fold  23.55 
 
 
310 aa  67  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29750  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  26.46 
 
 
293 aa  66.6  0.0000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2263  alpha/beta hydrolase fold  23.44 
 
 
277 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1819  alpha/beta hydrolase fold  33.06 
 
 
331 aa  66.6  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.091231  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4453  alpha/beta hydrolase fold  23.64 
 
 
279 aa  66.6  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.522171 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3910  alpha/beta hydrolase fold  23.48 
 
 
263 aa  66.6  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.399825  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1565  alpha/beta hydrolase fold  27.05 
 
 
363 aa  66.6  0.0000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.461626  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2258  alpha/beta hydrolase fold  25.19 
 
 
277 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40096  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0263  Alpha/beta hydrolase fold  23.66 
 
 
266 aa  66.2  0.0000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.191481  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11931  Alpha/beta hydrolase fold  23.55 
 
 
299 aa  66.2  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5996  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)  23.13 
 
 
260 aa  66.2  0.0000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1401  3-oxoadipate enol-lactonase  23.23 
 
 
256 aa  66.2  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2527  esterase-like  27 
 
 
280 aa  65.9  0.0000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2860  putative epoxide hydrolase  23.99 
 
 
334 aa  65.5  0.0000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.111933 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  22.56 
 
 
266 aa  65.5  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3091  Alpha/beta hydrolase  24.65 
 
 
294 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.1055 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5163  alpha/beta hydrolase fold  24.02 
 
 
272 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.365318  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3881  alpha/beta hydrolase fold protein  36.79 
 
 
300 aa  65.5  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.909678  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5377  alpha/beta hydrolase fold protein  25.86 
 
 
332 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.306055  normal  0.839367 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  25.74 
 
 
272 aa  65.1  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.343862 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6136  alpha/beta hydrolase fold protein  26.48 
 
 
294 aa  65.1  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.015637 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13701  epoxide hydrolase ephE  23.38 
 
 
327 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0688152 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  22.6 
 
 
333 aa  65.5  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3988  alpha/beta hydrolase fold protein  23.11 
 
 
263 aa  65.1  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  23.78 
 
 
295 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5253  arylesterase, putative  23.62 
 
 
272 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3858  alpha/beta hydrolase fold  22.69 
 
 
304 aa  64.7  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  31.15 
 
 
265 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2212  putative lipase  25.1 
 
 
315 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.799877  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0683  putative hydrolase  35.79 
 
 
271 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.225532  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4150  alpha/beta hydrolase fold protein  24.09 
 
 
288 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0383403  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1147  alpha/beta hydrolase fold  23.26 
 
 
369 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.255082  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3429  alpha/beta hydrolase fold protein  25.65 
 
 
270 aa  64.7  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.210707 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1002  alpha/beta hydrolase fold  24.44 
 
 
280 aa  64.7  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  23.75 
 
 
264 aa  64.7  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  32.26 
 
 
314 aa  64.7  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1164  alpha/beta hydrolase fold  23.26 
 
 
369 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.428268 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>