More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2097 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2097  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 324 aa  678    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0919  alpha/beta hydrolase fold  82.96 
 
 		 320 aa  550  1e-156  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.495242  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1644  alpha/beta hydrolase fold  73.55 
 
 		 318 aa  493  9.999999999999999e-139  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0669  epoxide hydrolase, putative  69.13 
 
 		 320 aa  450  1e-125  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.276082  normal  0.0385204 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1643  alpha/beta hydrolase fold  61.43 
 
 		 298 aa  395  1e-109  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.450863 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1567  alpha/beta hydrolase fold  54.14 
 
 		 325 aa  383  1e-105  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0838089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1217  alpha/beta hydrolase fold protein  42.43 
 
 		 335 aa  250  3e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3265  Alpha/beta hydrolase fold  26.77 
 
 		 272 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.279729  normal  0.0341286 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3841  alpha/beta hydrolase fold  26.13 
 
 		 288 aa  84  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4150  alpha/beta hydrolase fold protein  26.57 
 
 		 288 aa  84  0.000000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0383403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1565  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 		 363 aa  80.9  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.461626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4478  Alpha/beta hydrolase fold  25.55 
 
 		 272 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.785695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0572  alpha/beta hydrolase fold  23.97 
 
 		 266 aa  77  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2922  alpha/beta hydrolase fold protein  24.91 
 
 		 282 aa  76.6  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4186  alpha/beta hydrolase fold protein  22.44 
 
 		 297 aa  75.9  0.0000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3174  alpha/beta hydrolase fold protein  24.91 
 
 		 282 aa  75.9  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4298  alpha/beta hydrolase fold  23.88 
 
 		 288 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0263  Alpha/beta hydrolase fold  25.28 
 
 		 266 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.191481  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  24.72 
 
 		 264 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3543  alpha/beta hydrolase fold  26.67 
 
 		 268 aa  74.7  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.447096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3143  alpha/beta hydrolase fold  23.13 
 
 		 309 aa  75.1  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.03403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1819  alpha/beta hydrolase fold  37.19 
 
 		 331 aa  74.3  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.091231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4449  alpha/beta hydrolase fold  25.55 
 
 		 293 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.178174  normal  0.73876 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1002  alpha/beta hydrolase fold  24.72 
 
 		 280 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1655  alpha/beta hydrolase fold  32.54 
 
 		 331 aa  73.6  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0595  putative lactone hydrolase  24.43 
 
 		 265 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0604  alpha/beta hydrolase fold  23.75 
 
 		 297 aa  73.2  0.000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.791043 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1450  alpha/beta hydrolase fold protein  22.98 
 
 		 306 aa  72.8  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  23.92 
 
 		 266 aa  72  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  24.15 
 
 		 264 aa  72  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1587  alpha/beta hydrolase fold protein  24.82 
 
 		 301 aa  72  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0675  arylesterase  25.19 
 
 		 272 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3091  Alpha/beta hydrolase  25.44 
 
 		 294 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.1055 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0135  alpha/beta hydrolase fold  21.56 
 
 		 265 aa  71.2  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  23.62 
 
 		 265 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4122  alpha/beta hydrolase fold protein  25.36 
 
 		 287 aa  70.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0220  alpha/beta hydrolase fold  26.38 
 
 		 272 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.723702 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3967  alpha/beta hydrolase fold  24.72 
 
 		 306 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3910  alpha/beta hydrolase fold  25.29 
 
 		 263 aa  70.5  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.399825  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4400  alpha/beta hydrolase fold  24.72 
 
 		 306 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.334375 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2860  putative epoxide hydrolase  32.81 
 
 		 334 aa  70.1  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.111933 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5253  arylesterase, putative  25.68 
 
 		 272 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  22.99 
 
 		 315 aa  69.7  0.00000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5163  alpha/beta hydrolase fold  25.68 
 
 		 272 aa  69.7  0.00000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.365318  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3429  alpha/beta hydrolase fold protein  26.35 
 
 		 270 aa  69.7  0.00000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.210707 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3988  alpha/beta hydrolase fold protein  25.19 
 
 		 263 aa  69.7  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3847  Alpha/beta hydrolase fold-1  25.48 
 
 		 263 aa  69.7  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2381  putative non-heme chloroperoxidase  27.09 
 
 		 273 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.228721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0107  Alpha/beta hydrolase fold  27.04 
 
 		 286 aa  68.6  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4976  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  23.62 
 
 		 304 aa  68.9  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000041043  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2126  alpha/beta hydrolase fold protein  37.39 
 
 		 263 aa  68.2  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3881  alpha/beta hydrolase fold protein  36.45 
 
 		 300 aa  68.2  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.909678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2901  alpha/beta hydrolase fold  24.31 
 
 		 272 aa  67.4  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0641701  normal  0.105734 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2497  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 323 aa  67.8  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0402748  hitchhiker  0.0077142 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0413  alpha/beta hydrolase fold  25.6 
 
 		 257 aa  67.8  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.732531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1179  alpha/beta hydrolase fold protein  21.72 
 
 		 278 aa  67  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0798469  normal  0.0102944 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0704  alpha/beta hydrolase fold  26.28 
 
 		 276 aa  67  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.166516  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5467  alpha/beta hydrolase fold protein  26.02 
 
 		 273 aa  67  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0420  alpha/beta hydrolase  26.79 
 
 		 319 aa  66.6  0.0000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0764  alpha/beta hydrolase  27.9 
 
 		 277 aa  66.6  0.0000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29320  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  24.17 
 
 		 248 aa  67  0.0000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2696  alpha/beta hydrolase fold  24.03 
 
 		 312 aa  66.6  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3042  Alpha/beta hydrolase  34.82 
 
 		 380 aa  66.2  0.0000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.440112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3981  alpha/beta hydrolase fold  22.05 
 
 		 268 aa  66.2  0.0000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3091  alpha/beta hydrolase fold protein  21.75 
 
 		 305 aa  66.2  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3029  alpha/beta hydrolase fold protein  21.75 
 
 		 305 aa  66.2  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1480  Alpha/beta hydrolase fold  24.18 
 
 		 304 aa  66.2  0.0000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000123975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0619  alpha/beta hydrolase fold  30.83 
 
 		 291 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4165  3-oxoadipate enol-lactonase  24.02 
 
 		 256 aa  65.1  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0832  alpha/beta hydrolase fold  25.65 
 
 		 266 aa  65.9  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0299  alpha/beta hydrolase fold  26.53 
 
 		 343 aa  65.5  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29750  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  25.89 
 
 		 293 aa  64.7  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3130  alpha/beta hydrolase fold protein  25.44 
 
 		 286 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1770  alpha/beta hydrolase fold  24.68 
 
 		 323 aa  64.7  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00973065  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  21.54 
 
 		 277 aa  64.7  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4321  alpha/beta hydrolase fold  29.03 
 
 		 280 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0798376 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  22.93 
 
 		 339 aa  64.7  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  27.67 
 
 		 292 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2216  alpha/beta fold family hydrolase  36.79 
 
 		 294 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.111084  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  27.67 
 
 		 277 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0086  alpha/beta hydrolase fold  39.64 
 
 		 279 aa  63.9  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  26.15 
 
 		 314 aa  64.3  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  31.97 
 
 		 2762 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0774  esterase  24.83 
 
 		 295 aa  63.5  0.000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.391328  normal  0.148596 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  22.43 
 
 		 273 aa  63.9  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2263  alpha/beta hydrolase fold  28.06 
 
 		 277 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0891  alpha/beta hydrolase fold  35.45 
 
 		 271 aa  63.9  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.020907 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3655  alpha/beta hydrolase fold  23.65 
 
 		 312 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3826  3-oxoadipate enol-lactonase  24.3 
 
 		 265 aa  63.2  0.000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0256  alpha/beta hydrolase fold protein  27.65 
 
 		 292 aa  63.5  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.022774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4933  alpha/beta hydrolase fold  23.1 
 
 		 362 aa  63.5  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2732  alpha/beta hydrolase fold  24.63 
 
 		 271 aa  63.5  0.000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1736  alpha/beta hydrolase fold  27.4 
 
 		 290 aa  63.2  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2696  alpha/beta hydrolase fold  24.57 
 
 		 291 aa  63.2  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  decreased coverage  0.00208278 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0069  alpha/beta hydrolase fold protein  38.74 
 
 		 279 aa  63.2  0.000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.55127e-28 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3725  3-oxoadipate enol-lactonase  23.66 
 
 		 263 aa  63.2  0.000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4002  alpha/beta hydrolase fold protein  25.1 
 
 		 266 aa  63.2  0.000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3245  alpha/beta hydrolase fold  25.58 
 
 		 271 aa  62.8  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0448  alpha/beta hydrolase fold  23.63 
 
 		 292 aa  62.8  0.000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.122113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1463  alpha/beta hydrolase fold  35.9 
 
 		 273 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.879851  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>