More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1567 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1567  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
325 aa  681    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0838089  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0919  alpha/beta hydrolase fold  54.21 
 
 
320 aa  388  1e-107  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.495242  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1644  alpha/beta hydrolase fold  56.21 
 
 
318 aa  387  1e-106  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2097  alpha/beta hydrolase fold  54.14 
 
 
324 aa  383  1e-105  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1643  alpha/beta hydrolase fold  57.73 
 
 
298 aa  382  1e-105  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.450863 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0669  epoxide hydrolase, putative  55.81 
 
 
320 aa  374  1e-102  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.276082  normal  0.0385204 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1217  alpha/beta hydrolase fold protein  40.62 
 
 
335 aa  247  2e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4976  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  25.08 
 
 
304 aa  89.4  8e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000041043  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4122  alpha/beta hydrolase fold protein  22.22 
 
 
287 aa  84  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1480  Alpha/beta hydrolase fold  23.2 
 
 
304 aa  80.5  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000123975  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0263  Alpha/beta hydrolase fold  23.55 
 
 
266 aa  77  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.191481  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1587  alpha/beta hydrolase fold protein  22.79 
 
 
301 aa  75.9  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1450  alpha/beta hydrolase fold protein  22.48 
 
 
306 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3143  alpha/beta hydrolase fold  24.24 
 
 
309 aa  75.1  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.03403  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  24.46 
 
 
259 aa  74.7  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3174  alpha/beta hydrolase fold protein  22.35 
 
 
282 aa  73.2  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2922  alpha/beta hydrolase fold protein  22.35 
 
 
282 aa  73.2  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1179  alpha/beta hydrolase fold protein  24.36 
 
 
278 aa  72.8  0.000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0798469  normal  0.0102944 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3881  alpha/beta hydrolase fold protein  34.26 
 
 
300 aa  72.4  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.909678  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13040  3-oxoadipate enol-lactonase  25 
 
 
261 aa  71.2  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2860  putative epoxide hydrolase  30.53 
 
 
334 aa  71.2  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.111933 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1819  alpha/beta hydrolase fold  27.56 
 
 
331 aa  70.1  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.091231  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3265  Alpha/beta hydrolase fold  26.47 
 
 
272 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.279729  normal  0.0341286 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1655  alpha/beta hydrolase fold  29.38 
 
 
331 aa  70.1  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2696  alpha/beta hydrolase fold  23.24 
 
 
312 aa  69.7  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  22.38 
 
 
315 aa  70.1  0.00000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3029  alpha/beta hydrolase fold protein  23.49 
 
 
305 aa  69.3  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3091  alpha/beta hydrolase fold protein  23.49 
 
 
305 aa  69.3  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3967  alpha/beta hydrolase fold  35.34 
 
 
306 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4400  alpha/beta hydrolase fold  35.34 
 
 
306 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.334375 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  20.21 
 
 
266 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4165  3-oxoadipate enol-lactonase  23.68 
 
 
256 aa  68.6  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0420  alpha/beta hydrolase  26.62 
 
 
319 aa  67.8  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0419  alpha/beta hydrolase fold  23.89 
 
 
270 aa  67.4  0.0000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0446  3-oxoadipate enol-lactonase  21.95 
 
 
264 aa  67.4  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1002  alpha/beta hydrolase fold  23.24 
 
 
280 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0316  alpha/beta hydrolase fold  24.28 
 
 
316 aa  67.4  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00247828  hitchhiker  0.00660595 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0572  alpha/beta hydrolase fold  21.03 
 
 
266 aa  67  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1367  3-oxoadipate enol-lactonase  22.63 
 
 
256 aa  67  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1385  3-oxoadipate enol-lactonase  22.63 
 
 
256 aa  67  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.279159  normal  0.947236 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  23.62 
 
 
277 aa  66.2  0.0000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1401  3-oxoadipate enol-lactonase  22.63 
 
 
256 aa  66.2  0.0000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  23.62 
 
 
292 aa  65.9  0.0000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  23.76 
 
 
309 aa  65.9  0.0000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0806  alpha/beta hydrolase fold  23.62 
 
 
279 aa  65.9  0.0000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0845651 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1565  alpha/beta hydrolase fold  25.17 
 
 
363 aa  65.5  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.461626  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  30.85 
 
 
265 aa  64.7  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4478  Alpha/beta hydrolase fold  23.83 
 
 
272 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.785695  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0604  alpha/beta hydrolase fold  20.21 
 
 
297 aa  64.7  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.791043 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1699  putative hydrolase  23.21 
 
 
312 aa  64.3  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.272116  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2186  alpha/beta hydrolase fold  26 
 
 
276 aa  64.3  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000605842  normal  0.0104455 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  30.85 
 
 
264 aa  63.9  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2527  esterase-like  22.8 
 
 
280 aa  63.9  0.000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3092  alpha/beta hydrolase fold protein  42 
 
 
309 aa  63.5  0.000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000150861 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0671  alpha/beta hydrolase fold protein  22.5 
 
 
291 aa  63.5  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.437446  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1703  alpha/beta hydrolase fold  29.93 
 
 
284 aa  63.2  0.000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.198775  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2263  alpha/beta hydrolase fold  22.87 
 
 
277 aa  63.2  0.000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2964  alpha/beta hydrolase fold  21.92 
 
 
282 aa  63.2  0.000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3736  alpha/beta hydrolase fold  29.93 
 
 
284 aa  62.8  0.000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4164  alpha/beta fold family hydrolase  29.93 
 
 
284 aa  62.8  0.000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3606  3-oxoadipate enol-lactonase  21.32 
 
 
265 aa  62.4  0.000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0197721  hitchhiker  0.000894779 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2732  alpha/beta hydrolase fold  23.08 
 
 
271 aa  62.4  0.000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5467  alpha/beta hydrolase fold protein  24.18 
 
 
273 aa  62  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3111  putative hydrolase  23.9 
 
 
258 aa  62  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.995394  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2370  proline iminopeptidase  29.46 
 
 
296 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2592  alpha/beta hydrolase fold protein  21.99 
 
 
289 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  24.91 
 
 
261 aa  62  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3489  alpha/beta hydrolase fold  30.66 
 
 
284 aa  62  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2335  alpha/beta hydrolase fold  24.92 
 
 
315 aa  62.4  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1464  alpha/beta hydrolase fold protein  25 
 
 
279 aa  61.2  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2886  alpha/beta hydrolase fold  28.35 
 
 
290 aa  61.2  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3514  alpha/beta hydrolase fold protein  21.99 
 
 
289 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3042  Alpha/beta hydrolase  29.82 
 
 
380 aa  61.2  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.440112  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2962  proline iminopeptidase  29.46 
 
 
296 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.305011  normal  0.0401306 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0220  alpha/beta hydrolase fold  23.95 
 
 
272 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.723702 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3543  alpha/beta hydrolase fold  32.76 
 
 
268 aa  61.6  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.447096  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2714  alpha/beta hydrolase fold  25.58 
 
 
320 aa  61.2  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8642  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  25.86 
 
 
321 aa  61.6  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11921  Alpha/beta hydrolase fold  24.3 
 
 
310 aa  61.6  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4827  alpha/beta hydrolase fold protein  24.53 
 
 
352 aa  61.6  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.692638  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5163  alpha/beta hydrolase fold  23.57 
 
 
272 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.365318  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5253  arylesterase, putative  23.74 
 
 
272 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0774  esterase  21.77 
 
 
295 aa  60.8  0.00000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.391328  normal  0.148596 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2901  alpha/beta hydrolase fold  25.22 
 
 
272 aa  61.2  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0641701  normal  0.105734 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2878  alpha/beta hydrolase fold  32.03 
 
 
323 aa  61.2  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1637  alpha/beta hydrolase fold  24.39 
 
 
287 aa  60.8  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3240  alpha/beta hydrolase fold protein  34.19 
 
 
243 aa  60.5  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0962986  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2258  alpha/beta hydrolase fold  22.9 
 
 
277 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40096  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2496  alpha/beta hydrolase fold  23.17 
 
 
431 aa  60.5  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98231  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1743  alpha/beta fold family hydrolase  25.58 
 
 
318 aa  60.1  0.00000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3429  alpha/beta hydrolase fold protein  23.27 
 
 
270 aa  60.1  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.210707 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3736  alpha/beta hydrolase fold  23.18 
 
 
305 aa  60.1  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.265867  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2547  alpha/beta hydrolase fold  25.5 
 
 
339 aa  60.1  0.00000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1598  alpha/beta hydrolase fold protein  22.79 
 
 
328 aa  59.7  0.00000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  decreased coverage  0.00288726 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2497  alpha/beta hydrolase fold  29.1 
 
 
323 aa  59.7  0.00000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0402748  hitchhiker  0.0077142 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3858  alpha/beta hydrolase fold  27.86 
 
 
304 aa  60.1  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4841  alpha/beta hydrolase fold protein  32.56 
 
 
266 aa  60.1  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2614  alpha/beta hydrolase fold  25.59 
 
 
339 aa  59.7  0.00000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3546  alpha/beta hydrolase fold protein  21.51 
 
 
308 aa  59.3  0.00000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.375362  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  22.18 
 
 
277 aa  59.3  0.00000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.974393 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>