More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3018 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_3018  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 262 aa  533  1e-150  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0775  alpha/beta hydrolase fold  49.4 
 
 		 264 aa  228  6e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1976  alpha/beta fold family hydrolase  44.18 
 
 		 292 aa  215  5.9999999999999996e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1743  alpha/beta hydrolase fold protein  46.12 
 
 		 318 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.168912  hitchhiker  0.00128876 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2717  alpha/beta hydrolase fold  45.31 
 
 		 318 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.572547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2603  alpha/beta hydrolase fold  43.4 
 
 		 313 aa  210  2e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2642  alpha/beta hydrolase fold  45.31 
 
 		 309 aa  210  2e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2353  alpha/beta hydrolase fold  43.13 
 
 		 278 aa  208  9e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.111033  normal  0.169914 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2471  alpha/beta fold family hydrolase  43.68 
 
 		 289 aa  206  2e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.351444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2281  alpha/beta hydrolase fold  42.91 
 
 		 278 aa  204  2e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1880  alpha/beta hydrolase fold  38.27 
 
 		 279 aa  184  9e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0052  hydrolase or acyltransferase-like protein  36.59 
 
 		 263 aa  128  9.000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.357757  normal  0.185343 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2902  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 261 aa  112  8.000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0369  alpha/beta fold family hydrolase  35.02 
 
 		 263 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3296  alpha/beta fold family hydrolase  30.92 
 
 		 247 aa  111  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.26426 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1284  alpha/beta hydrolase fold  32.28 
 
 		 272 aa  109  4.0000000000000004e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.802903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3438  alpha/beta hydrolase fold  34.92 
 
 		 246 aa  108  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.410588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4625  alpha/beta hydrolase fold protein  33.59 
 
 		 278 aa  95.9  6e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.178751 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4290  alpha/beta fold family hydrolase  32.93 
 
 		 250 aa  94  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3537  alpha/beta fold family hydrolase  32.81 
 
 		 245 aa  93.6  3e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0841  alpha/beta family hydrolase  32.02 
 
 		 266 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0266055 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2186  hydrolase  28.1 
 
 		 200 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.549707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4526  alpha/beta hydrolase fold  32.41 
 
 		 266 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.580548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3629  alpha/beta hydrolase fold  29.7 
 
 		 306 aa  70.9  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.030304  hitchhiker  0.0000369585 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4189  putative alpha/beta superfamily hydrolase  27.91 
 
 		 258 aa  70.1  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3798  alpha/beta hydrolase fold protein  24.23 
 
 		 258 aa  65.9  0.0000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4363  alpha/beta hydrolase fold protein  26.09 
 
 		 239 aa  62.8  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4521  alpha/beta hydrolase fold  28.46 
 
 		 270 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.78404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0693  alpha/beta hydrolase fold  33.02 
 
 		 258 aa  60.5  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0560  alpha/beta hydrolase fold protein  25.39 
 
 		 390 aa  58.2  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.747431 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3044  alpha/beta hydrolase fold protein  32.67 
 
 		 278 aa  57.4  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3496  alpha/beta hydrolase fold  27.17 
 
 		 289 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.340747  normal  0.70145 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2964  alpha/beta hydrolase fold  23.94 
 
 		 282 aa  57.4  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2549  alpha/beta hydrolase fold  27.66 
 
 		 263 aa  57.4  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1348  3-oxoadipate enol-lactonase  28.38 
 
 		 256 aa  57  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.786206 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3049  alpha/beta hydrolase fold  25.86 
 
 		 256 aa  57  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.652408  normal  0.351837 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2343  alpha/beta hydrolase fold  27.06 
 
 		 279 aa  57  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.302019  decreased coverage  0.000831021 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06710  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  26.62 
 
 		 296 aa  56.6  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1760  alpha/beta hydrolase fold  31.07 
 
 		 235 aa  55.8  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000242559  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1801  hypothetical protein  33.98 
 
 		 238 aa  55.5  0.0000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0314686 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2308  alpha/beta fold family hydrolase  22.83 
 
 		 283 aa  55.5  0.0000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  26.34 
 
 		 273 aa  55.5  0.0000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2983  alpha/beta hydrolase fold protein  26.87 
 
 		 303 aa  55.1  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.283426 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0822  alpha/beta hydrolase fold protein  27.38 
 
 		 278 aa  55.5  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000139933  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  25.56 
 
 		 264 aa  55.1  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0619  alpha/beta hydrolase fold  26.17 
 
 		 291 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  27.24 
 
 		 308 aa  53.9  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3756  alpha/beta hydrolase fold  24.43 
 
 		 504 aa  53.9  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.740741  normal  0.0321393 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1902  EstC  30.1 
 
 		 235 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00691738  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0572  alpha/beta hydrolase fold  28.4 
 
 		 266 aa  54.3  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02551  hypothetical protein  25.93 
 
 		 239 aa  54.3  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2426  alpha/beta hydrolase fold protein  27.08 
 
 		 267 aa  53.5  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.423437  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13040  3-oxoadipate enol-lactonase  34.78 
 
 		 261 aa  53.5  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2691  3-oxoadipate enol-lactonase  27.2 
 
 		 266 aa  53.9  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000109702  normal  0.164043 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1778  alpha/beta hydrolase fold  26.69 
 
 		 366 aa  53.5  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0401666  normal  0.253947 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1553  alpha/beta hydrolase fold protein  35.85 
 
 		 286 aa  53.5  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000230075  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0037  putative alpha/beta hydrolase  24.91 
 
 		 276 aa  53.1  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0646  3-oxoadipate enol-lactonase (pcaD)  29.8 
 
 		 263 aa  53.5  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.063322 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1078  alpha/beta hydrolase fold protein  33.06 
 
 		 314 aa  53.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.143754 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1128  alpha/beta hydrolase fold  35.35 
 
 		 256 aa  53.1  0.000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7077  3-oxoadipate enol-lactonase  25.29 
 
 		 269 aa  53.1  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.335255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1152  alpha/beta hydrolase fold protein  40 
 
 		 239 aa  52.8  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0351  putative hydrolase/acyltransferase  25.97 
 
 		 259 aa  52.8  0.000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1900  alpha/beta hydrolase fold  25.64 
 
 		 271 aa  52.8  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_13371  predicted protein  24.63 
 
 		 323 aa  52.8  0.000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.014385  normal  0.0363767 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5034  alpha/beta hydrolase fold  28.17 
 
 		 245 aa  52.4  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.246074  normal  0.671643 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0135  alpha/beta hydrolase fold  26.44 
 
 		 265 aa  52.4  0.000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2446  alpha/beta hydrolase fold protein  25.09 
 
 		 309 aa  52.4  0.000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.969901  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0396  alpha/beta hydrolase fold protein  27.63 
 
 		 255 aa  52  0.000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.075233 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2684  alpha/beta hydrolase fold protein  22.5 
 
 		 310 aa  52  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000788491  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1662  alpha/beta hydrolase fold protein  36.54 
 
 		 274 aa  51.6  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.665083  normal  0.0127757 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3387  alpha/beta hydrolase fold  27.5 
 
 		 306 aa  52  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1992  alpha/beta hydrolase fold  37.86 
 
 		 274 aa  51.6  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.45941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  27.24 
 
 		 425 aa  51.6  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3321  alpha/beta hydrolase fold protein  56.25 
 
 		 254 aa  51.2  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  34.31 
 
 		 292 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5939  3-oxoadipate enol-lactonase  24.02 
 
 		 275 aa  50.8  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.178478 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1764  alpha/beta hydrolase fold protein  32.19 
 
 		 265 aa  51.2  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0171248  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4165  3-oxoadipate enol-lactonase  26.67 
 
 		 256 aa  51.2  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6666  alpha/beta hydrolase fold  24.02 
 
 		 294 aa  50.8  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.203299  normal  0.734858 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0871  alpha/beta fold family hydrolase  29.29 
 
 		 285 aa  50.8  0.00002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0195486  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2065  cyclic nucleotide-binding protein  28.94 
 
 		 462 aa  50.8  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5507  alpha/beta hydrolase fold  27.98 
 
 		 269 aa  51.2  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124996 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6150  putative hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)(McbF)  32.41 
 
 		 313 aa  50.8  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.681838 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0309  alpha/beta hydrolase fold  31.63 
 
 		 262 aa  51.2  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2526  alpha/beta hydrolase fold  26.29 
 
 		 275 aa  50.8  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4315  3-oxoadipate enol-lactonase  28.79 
 
 		 263 aa  50.8  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.781035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  34.31 
 
 		 277 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3781  alpha/beta hydrolase fold  26.74 
 
 		 279 aa  51.2  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.812813 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2258  alpha/beta hydrolase fold  34.31 
 
 		 277 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8386  hydrolase, alpha  27.44 
 
 		 304 aa  50.4  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.139718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1230  alpha/beta hydrolase fold  26.64 
 
 		 261 aa  50.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4321  alpha/beta hydrolase fold  25.6 
 
 		 280 aa  50.4  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0798376 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6602  alpha/beta hydrolase fold  26.64 
 
 		 261 aa  50.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.472817  normal  0.1504 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7140  alpha/beta hydrolase fold protein  30.56 
 
 		 425 aa  50.1  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6938  alpha/beta hydrolase fold protein  35.24 
 
 		 279 aa  50.1  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.178748 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11921  Alpha/beta hydrolase fold  24.61 
 
 		 310 aa  50.1  0.00003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3293  alpha/beta hydrolase fold  31.36 
 
 		 323 aa  50.1  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.104393  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2334  alpha/beta hydrolase fold  26.1 
 
 		 258 aa  50.1  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000909068  hitchhiker  0.0000846948 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2998  alpha/beta hydrolase fold  26.05 
 
 		 269 aa  50.1  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.186878 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>