47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4526 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4526  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 266 aa  532  1e-150  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.580548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0841  alpha/beta family hydrolase  92.11 
 
 		 266 aa  474  1e-133  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0266055 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4625  alpha/beta hydrolase fold protein  63.91 
 
 		 278 aa  295  6e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.178751 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1284  alpha/beta hydrolase fold  55.21 
 
 		 272 aa  264  1e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.802903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3438  alpha/beta hydrolase fold  55.51 
 
 		 246 aa  258  7e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.410588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4189  putative alpha/beta superfamily hydrolase  54.72 
 
 		 258 aa  247  1e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4290  alpha/beta fold family hydrolase  52.44 
 
 		 250 aa  219  5e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0052  hydrolase or acyltransferase-like protein  48.24 
 
 		 263 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.357757  normal  0.185343 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0369  alpha/beta fold family hydrolase  40 
 
 		 263 aa  163  3e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3537  alpha/beta fold family hydrolase  41.11 
 
 		 245 aa  153  2.9999999999999998e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2902  alpha/beta hydrolase fold  38.34 
 
 		 261 aa  144  1e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3296  alpha/beta fold family hydrolase  36.9 
 
 		 247 aa  127  1.0000000000000001e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.26426 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2186  hydrolase  31.84 
 
 		 200 aa  106  4e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.549707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2471  alpha/beta fold family hydrolase  31.47 
 
 		 289 aa  97.8  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.351444  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1976  alpha/beta fold family hydrolase  29.15 
 
 		 292 aa  95.9  7e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1743  alpha/beta hydrolase fold protein  31.05 
 
 		 318 aa  92.4  6e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.168912  hitchhiker  0.00128876 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2717  alpha/beta hydrolase fold  30.65 
 
 		 318 aa  91.7  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.572547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2353  alpha/beta hydrolase fold  29.08 
 
 		 278 aa  89.7  4e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.111033  normal  0.169914 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2642  alpha/beta hydrolase fold  30.65 
 
 		 309 aa  89.4  6e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3018  alpha/beta hydrolase fold  31.18 
 
 		 262 aa  88.2  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2603  alpha/beta hydrolase fold  30.24 
 
 		 313 aa  85.9  7e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1880  alpha/beta hydrolase fold  27.6 
 
 		 279 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2281  alpha/beta hydrolase fold  28.98 
 
 		 278 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0775  alpha/beta hydrolase fold  30.04 
 
 		 264 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1078  alpha/beta hydrolase fold protein  23.61 
 
 		 253 aa  57  0.0000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2691  3-oxoadipate enol-lactonase  25.57 
 
 		 266 aa  51.6  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000109702  normal  0.164043 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5034  alpha/beta hydrolase fold  27.67 
 
 		 245 aa  48.9  0.00008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.246074  normal  0.671643 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4363  alpha/beta hydrolase fold protein  28.36 
 
 		 239 aa  48.5  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5637  hydrolases or acyltransferases (alpha/beta hydrolase superfamily)  34.45 
 
 		 297 aa  47  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0678785  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4453  alpha/beta hydrolase fold  27.57 
 
 		 279 aa  45.8  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522171 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3014  alpha/beta hydrolase fold protein  28.16 
 
 		 340 aa  45.8  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0774  alpha/beta hydrolase fold  26.47 
 
 		 307 aa  45.1  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.921601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3361  alpha/beta hydrolase fold  28.36 
 
 		 340 aa  44.7  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.013073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3143  alpha/beta hydrolase fold protein  25 
 
 		 265 aa  45.4  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  29.29 
 
 		 287 aa  44.7  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3547  alpha/beta hydrolase fold protein  29.31 
 
 		 463 aa  44.3  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.121597  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4312  alpha/beta hydrolase fold  37.31 
 
 		 333 aa  43.9  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.312071  normal  0.695125 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20960  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  41.86 
 
 		 269 aa  43.9  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37050  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  27.38 
 
 		 285 aa  43.5  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.557179 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3884  alpha/beta hydrolase fold  32.05 
 
 		 341 aa  43.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.447806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5500  putative prolyl aminopeptidase  25.81 
 
 		 291 aa  42.7  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0980519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1097  homoserine O-acetyltransferase  37.84 
 
 		 403 aa  42.4  0.007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.076735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_31848  predicted protein  21.69 
 
 		 549 aa  42.4  0.008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0450  alpha/beta hydrolase fold protein  24.42 
 
 		 332 aa  42  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.591115  normal  0.448249 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4098  protein of unknown function UPF0227  56.25 
 
 		 222 aa  42.4  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0244211  normal  0.0242284 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4141  Alpha/beta hydrolase protein  23.44 
 
 		 233 aa  42  0.01  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5931  alpha/beta hydrolase fold  31.86 
 
 		 261 aa  42  0.01  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0123978 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>