274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_2471 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008577  Shewana3_2471  alpha/beta fold family hydrolase  100 
 
 
289 aa  600  1e-170  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.351444  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2353  alpha/beta hydrolase fold  86.86 
 
 
278 aa  494  1e-139  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.111033  normal  0.169914 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2281  alpha/beta hydrolase fold  83.21 
 
 
278 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1976  alpha/beta fold family hydrolase  75 
 
 
292 aa  450  1e-125  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1743  alpha/beta hydrolase fold protein  66.32 
 
 
318 aa  384  1e-106  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.168912  hitchhiker  0.00128876 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2642  alpha/beta hydrolase fold  64.91 
 
 
309 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2717  alpha/beta hydrolase fold  64.14 
 
 
318 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.572547  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2603  alpha/beta hydrolase fold  63.86 
 
 
313 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3018  alpha/beta hydrolase fold  44.9 
 
 
262 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0775  alpha/beta hydrolase fold  41.06 
 
 
264 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1880  alpha/beta hydrolase fold  36.69 
 
 
279 aa  178  8e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2902  alpha/beta hydrolase fold  33.47 
 
 
261 aa  121  9.999999999999999e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0052  hydrolase or acyltransferase-like protein  33.6 
 
 
263 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.357757  normal  0.185343 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0369  alpha/beta fold family hydrolase  36.13 
 
 
263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1284  alpha/beta hydrolase fold  32.24 
 
 
272 aa  112  7.000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.802903  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3438  alpha/beta hydrolase fold  35.17 
 
 
246 aa  106  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.410588  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4290  alpha/beta fold family hydrolase  34.73 
 
 
250 aa  104  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3537  alpha/beta fold family hydrolase  32.66 
 
 
245 aa  95.1  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4625  alpha/beta hydrolase fold protein  30.66 
 
 
278 aa  94  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.178751 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3296  alpha/beta fold family hydrolase  30.2 
 
 
247 aa  89  9e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.26426 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0841  alpha/beta family hydrolase  31.87 
 
 
266 aa  87.4  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0266055 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4526  alpha/beta hydrolase fold  31.47 
 
 
266 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.580548  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4189  putative alpha/beta superfamily hydrolase  29.1 
 
 
258 aa  75.9  0.0000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2186  hydrolase  27.37 
 
 
200 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.549707  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2104  alpha/beta hydrolase fold  23.53 
 
 
300 aa  62  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000418183  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1929  3-Oxoadipate enol-lactonase  23.53 
 
 
300 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.878211  normal  0.500669 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3303  3-Oxoadipate enol-lactonase  23.53 
 
 
300 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.664184  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3011  alpha/beta hydrolase fold  23.05 
 
 
300 aa  59.3  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.245192  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3307  alpha/beta fold family hydrolase  23.05 
 
 
300 aa  58.9  0.00000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1801  hypothetical protein  35 
 
 
238 aa  58.5  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0314686 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02551  hypothetical protein  29.12 
 
 
239 aa  58.5  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3042  Alpha/beta hydrolase  23.17 
 
 
380 aa  57.8  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.440112  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3049  alpha/beta hydrolase fold  25.49 
 
 
256 aa  57  0.0000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.652408  normal  0.351837 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  25.59 
 
 
425 aa  56.6  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1760  alpha/beta hydrolase fold  33 
 
 
235 aa  56.2  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000242559  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2526  alpha/beta hydrolase fold  26.81 
 
 
275 aa  55.8  0.0000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0531  alpha/beta hydrolase fold  25.32 
 
 
264 aa  55.8  0.0000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0176995 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3313  3-Oxoadipate enol-lactonase  22.75 
 
 
300 aa  55.5  0.0000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4363  alpha/beta hydrolase fold protein  27.38 
 
 
239 aa  55.5  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2995  3-oxoadipate enol-lactonase  22.27 
 
 
300 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000386793  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1230  alpha/beta hydrolase fold  27.08 
 
 
261 aa  53.9  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6602  alpha/beta hydrolase fold  27.08 
 
 
261 aa  53.9  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.472817  normal  0.1504 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3084  3-oxoadipate enol-lactonase  21.88 
 
 
300 aa  53.5  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0473381  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5996  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)  26.22 
 
 
260 aa  53.5  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  25.83 
 
 
562 aa  53.1  0.000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0616  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  23.02 
 
 
252 aa  53.1  0.000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1902  EstC  32 
 
 
235 aa  53.1  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00691738  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3320  hydrolase, alpha/beta fold family  21.88 
 
 
300 aa  53.1  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4521  alpha/beta hydrolase fold  33.94 
 
 
270 aa  53.1  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.78404  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2383  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  25.96 
 
 
294 aa  53.1  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.38703  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5020  3-oxoadipate enol-lactonase  30.83 
 
 
256 aa  52.8  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.42347 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5072  alpha/beta hydrolase fold protein  22.53 
 
 
281 aa  52.4  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.157677 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5546  alpha/beta hydrolase fold protein  27.35 
 
 
288 aa  52.4  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.532072 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  27.98 
 
 
308 aa  52.4  0.000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  26.72 
 
 
261 aa  52.4  0.000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2740  alpha/beta hydrolase fold  22.71 
 
 
294 aa  52  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5507  alpha/beta hydrolase fold  24.15 
 
 
269 aa  52  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00124996 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3098  alpha/beta fold family hydrolase  21.48 
 
 
300 aa  51.6  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.833481  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3343  alpha/beta fold family hydrolase  21.48 
 
 
300 aa  51.6  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0693  alpha/beta hydrolase fold  24.59 
 
 
258 aa  51.6  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3210  alpha/beta hydrolase fold protein  22.58 
 
 
271 aa  51.2  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.45774  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1149  alpha/beta hydrolase fold protein  23.79 
 
 
265 aa  50.8  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  23.4 
 
 
267 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  25.29 
 
 
301 aa  50.8  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3961  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 
260 aa  50.8  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.611478 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6107  alpha/beta hydrolase fold protein  23.79 
 
 
231 aa  50.4  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.519556  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2691  3-oxoadipate enol-lactonase  21.51 
 
 
266 aa  50.8  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000109702  normal  0.164043 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0879  alpha/beta hydrolase fold protein  25.84 
 
 
349 aa  50.8  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  26.53 
 
 
273 aa  50.4  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1677  alpha/beta hydrolase fold protein  23.39 
 
 
270 aa  50.4  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.216999  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1681  alpha/beta hydrolase fold  24.6 
 
 
273 aa  50.4  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0641945  normal  0.147127 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4016  3-oxoadipate enol-lactonase  23.26 
 
 
392 aa  50.4  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00993372  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3461  alpha/beta fold family hydrolase  26.14 
 
 
277 aa  50.1  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  24.07 
 
 
265 aa  49.7  0.00005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2316  hypothetical protein  25 
 
 
227 aa  49.7  0.00005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1330  alpha/beta hydrolase fold  25.41 
 
 
260 aa  50.1  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.515623  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3321  alpha/beta hydrolase fold protein  29.91 
 
 
254 aa  49.7  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2510  alpha/beta hydrolase fold protein  30.51 
 
 
267 aa  50.1  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00182924  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1087  alpha/beta hydrolase fold protein  22.58 
 
 
245 aa  50.1  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0523898  normal  0.954451 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4111  alpha/beta hydrolase fold protein  22.43 
 
 
288 aa  49.7  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0346007  normal  0.0462514 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0733  alpha/beta hydrolase fold  24.18 
 
 
280 aa  49.7  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.204474  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7140  alpha/beta hydrolase fold protein  25.33 
 
 
425 aa  49.3  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5127  alpha/beta hydrolase fold  26.32 
 
 
249 aa  49.3  0.00008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1435  alpha/beta hydrolase fold protein  32.11 
 
 
256 aa  49.3  0.00008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.426403  normal  0.727578 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1857  3-oxoadipate enol-lactonase  32.71 
 
 
260 aa  48.9  0.00009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.115671  normal  0.0686473 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0210  alpha/beta hydrolase fold  23.48 
 
 
279 aa  48.9  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3489  alpha/beta hydrolase fold  33.75 
 
 
284 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0941  alpha/beta hydrolase  25.39 
 
 
284 aa  48.9  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3829  alpha/beta hydrolase fold  28.89 
 
 
331 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8386  hydrolase, alpha  24.26 
 
 
304 aa  48.5  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.139718  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0084  alpha/beta hydrolase fold protein  28.71 
 
 
246 aa  48.1  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0317  carboxylesterase  24.34 
 
 
292 aa  48.5  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5049  hypothetical protein  22.64 
 
 
247 aa  48.5  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.82888  normal  0.0566576 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3105  alpha/beta hydrolase fold  31.4 
 
 
257 aa  48.5  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0635693  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12729  hydrolase  29.41 
 
 
341 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  24.51 
 
 
279 aa  48.9  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1542  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  33.7 
 
 
189 aa  48.5  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0225  alpha/beta hydrolase fold  28.89 
 
 
272 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.701432  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0986  prolyl aminopeptidase  21.85 
 
 
285 aa  47.4  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.298096  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6150  putative hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)(McbF)  28.47 
 
 
313 aa  48.1  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.681838 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>