58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3296 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3296  alpha/beta fold family hydrolase  100 
 
 		 247 aa  504  9.999999999999999e-143  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.26426 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3537  alpha/beta fold family hydrolase  39.09 
 
 		 245 aa  166  2.9999999999999998e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0052  hydrolase or acyltransferase-like protein  37.39 
 
 		 263 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.357757  normal  0.185343 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0369  alpha/beta fold family hydrolase  34.84 
 
 		 263 aa  138  7.999999999999999e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2902  alpha/beta hydrolase fold  37.1 
 
 		 261 aa  132  3.9999999999999996e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3438  alpha/beta hydrolase fold  36.82 
 
 		 246 aa  126  4.0000000000000003e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.410588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0841  alpha/beta family hydrolase  37.15 
 
 		 266 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0266055 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1284  alpha/beta hydrolase fold  34.52 
 
 		 272 aa  115  6.9999999999999995e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.802903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4526  alpha/beta hydrolase fold  36.9 
 
 		 266 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.580548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3018  alpha/beta hydrolase fold  30.92 
 
 		 262 aa  105  7e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2353  alpha/beta hydrolase fold  31.66 
 
 		 278 aa  97.8  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.111033  normal  0.169914 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4290  alpha/beta fold family hydrolase  33.2 
 
 		 250 aa  97.1  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2186  hydrolase  31.09 
 
 		 200 aa  94.7  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.549707  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1976  alpha/beta fold family hydrolase  28.46 
 
 		 292 aa  93.2  4e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4625  alpha/beta hydrolase fold protein  30.83 
 
 		 278 aa  92.8  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.178751 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4189  putative alpha/beta superfamily hydrolase  32.8 
 
 		 258 aa  92.4  7e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1743  alpha/beta hydrolase fold protein  31.45 
 
 		 318 aa  91.3  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.168912  hitchhiker  0.00128876 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2281  alpha/beta hydrolase fold  30.35 
 
 		 278 aa  89.4  5e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2471  alpha/beta fold family hydrolase  30.2 
 
 		 289 aa  89  7e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.351444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2717  alpha/beta hydrolase fold  30.92 
 
 		 318 aa  88.6  9e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.572547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2603  alpha/beta hydrolase fold  30.92 
 
 		 313 aa  88.6  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1880  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 279 aa  86.7  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2642  alpha/beta hydrolase fold  30.52 
 
 		 309 aa  86.3  5e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0775  alpha/beta hydrolase fold  27.84 
 
 		 264 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1778  alpha/beta hydrolase fold  26.84 
 
 		 366 aa  58.2  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0401666  normal  0.253947 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2308  alpha/beta fold family hydrolase  26.56 
 
 		 283 aa  51.6  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5049  hypothetical protein  29.15 
 
 		 247 aa  51.2  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.82888  normal  0.0566576 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  29.33 
 
 		 425 aa  47.8  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0147  alpha/beta hydrolase  29.13 
 
 		 282 aa  47.4  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1010  alpha/beta hydrolase fold protein  33.03 
 
 		 257 aa  46.6  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3642  alpha/beta fold family hydrolase  32.1 
 
 		 262 aa  46.2  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2945  alpha/beta hydrolase fold  32.71 
 
 		 290 aa  46.2  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4750  alpha/beta hydrolase fold protein  22.04 
 
 		 268 aa  44.7  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2868  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 		 265 aa  45.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0147271  normal  0.0470272 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001876  biotin synthesis protein BioH  29.17 
 
 		 261 aa  43.9  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1674  alpha/beta hydrolase fold  31.47 
 
 		 302 aa  44.3  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0685799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2065  cyclic nucleotide-binding protein  26.86 
 
 		 462 aa  43.9  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0374  rhamnosyltransferase 1, subunit A  25.71 
 
 		 299 aa  43.5  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000541309  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2094  rhamnosyltransferase 1, subunit A  25.71 
 
 		 299 aa  43.5  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00000000939579  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0723  rhamnosyltransferase I, subunit A  25.71 
 
 		 299 aa  43.5  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.197739  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1834  rhamnosyltransferase I, subunit A  25.71 
 
 		 299 aa  43.5  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0965522  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0184  rhamnosyltransferase I, subunit A  25.71 
 
 		 299 aa  43.1  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.252928  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1021  rhamnosyltransferase I, subunit A  25.71 
 
 		 299 aa  43.1  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000000149515  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0810  rhamnosyltransferase I, subunit A  25.71 
 
 		 299 aa  43.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000408122  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1921  rhamnosyltransferase 1 subunit A  25.71 
 
 		 299 aa  43.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000117778  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0459  rhamnosyltransferase I, subunit A  25.71 
 
 		 299 aa  43.1  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.0000126343  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0919  rhamnosyltransferase 1, subunit A  25.71 
 
 		 299 aa  43.1  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0298051  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1881  rhamnosyltransferase 1, subunit A  25.24 
 
 		 299 aa  42.7  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00000000281436  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1423  rhamnosyltransferase I, subunit A  25.71 
 
 		 278 aa  42.7  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.025995  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1995  rhamnosyltransferase I, subunit A  25.71 
 
 		 278 aa  42.7  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000145905  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3630  bioH protein  28.67 
 
 		 259 aa  43.1  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1075  rhamnosyltransferase 1, subunit A  25.24 
 
 		 299 aa  42.7  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00000547934  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0724  rhamnosyltransferase I, subunit A  25.71 
 
 		 278 aa  42.7  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000152501  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0463  rhamnosyltransferase I, subunit A  25.71 
 
 		 278 aa  42.7  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0646  alpha/beta hydrolase fold protein  22.94 
 
 		 265 aa  42.4  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3496  alpha/beta hydrolase fold protein  27.1 
 
 		 267 aa  42.4  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.094698 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00616  biotin biosynthesis protein BioH  28.47 
 
 		 254 aa  42  0.009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 		 299 aa  42  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>