38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2186 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_2186  hydrolase  100 
 
 		 200 aa  414  9.999999999999999e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.549707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0052  hydrolase or acyltransferase-like protein  32.04 
 
 		 263 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.357757  normal  0.185343 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1284  alpha/beta hydrolase fold  32.2 
 
 		 272 aa  122  4e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.802903  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0369  alpha/beta fold family hydrolase  36.5 
 
 		 263 aa  118  7e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2902  alpha/beta hydrolase fold  33.92 
 
 		 261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4290  alpha/beta fold family hydrolase  32.68 
 
 		 250 aa  105  6e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4189  putative alpha/beta superfamily hydrolase  31 
 
 		 258 aa  103  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4625  alpha/beta hydrolase fold protein  31.66 
 
 		 278 aa  104  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.178751 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3438  alpha/beta hydrolase fold  31 
 
 		 246 aa  102  5e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.410588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4526  alpha/beta hydrolase fold  30.85 
 
 		 266 aa  96.7  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.580548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0841  alpha/beta family hydrolase  31 
 
 		 266 aa  95.5  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0266055 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3296  alpha/beta fold family hydrolase  31.09 
 
 		 247 aa  94.7  8e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.26426 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3537  alpha/beta fold family hydrolase  30.65 
 
 		 245 aa  94.7  9e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2717  alpha/beta hydrolase fold  29.47 
 
 		 318 aa  84  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.572547  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1976  alpha/beta fold family hydrolase  29.47 
 
 		 292 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1743  alpha/beta hydrolase fold protein  30 
 
 		 318 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.168912  hitchhiker  0.00128876 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2642  alpha/beta hydrolase fold  29.47 
 
 		 309 aa  81.6  0.000000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2603  alpha/beta hydrolase fold  28.95 
 
 		 313 aa  78.2  0.00000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1880  alpha/beta hydrolase fold  29.63 
 
 		 279 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2353  alpha/beta hydrolase fold  27.08 
 
 		 278 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.111033  normal  0.169914 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3018  alpha/beta hydrolase fold  28.99 
 
 		 262 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2471  alpha/beta fold family hydrolase  27.37 
 
 		 289 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.351444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2281  alpha/beta hydrolase fold  29.27 
 
 		 278 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2368  alpha/beta hydrolase fold  23.15 
 
 		 219 aa  50.8  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.870626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1465  alpha/beta hydrolase fold protein  22.86 
 
 		 289 aa  47.4  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.647363  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  23.78 
 
 		 265 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0431  alpha/beta hydrolase fold  23.5 
 
 		 325 aa  45.8  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0538885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2732  alpha/beta hydrolase fold  22.17 
 
 		 271 aa  45.4  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1303  alpha/beta hydrolase fold protein  22.35 
 
 		 299 aa  44.3  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.427571  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1797  alpha/beta hydrolase fold protein  30 
 
 		 280 aa  43.1  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.287372  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1427  homoserine O-acetyltransferase  35.09 
 
 		 403 aa  42.7  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.916733  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1511  alpha/beta hydrolase fold  38.3 
 
 		 295 aa  42.4  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1080  alpha/beta hydrolase fold  24.39 
 
 		 296 aa  42  0.006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0172  homoserine O-acetyltransferase  41.07 
 
 		 492 aa  42  0.006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0775  alpha/beta hydrolase fold  26.02 
 
 		 264 aa  42  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2496  alpha/beta hydrolase fold  34.88 
 
 		 431 aa  41.2  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2163  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  29.63 
 
 		 464 aa  41.2  0.009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.734471  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3005  homoserine O-acetyltransferase  34.92 
 
 		 378 aa  41.2  0.01  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>