122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3438 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_3438  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 246 aa  498  1e-140  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.410588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1284  alpha/beta hydrolase fold  59.85 
 
 		 272 aa  296  3e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.802903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0841  alpha/beta family hydrolase  54.33 
 
 		 266 aa  270  2e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0266055 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4526  alpha/beta hydrolase fold  55.12 
 
 		 266 aa  265  7e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.580548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4625  alpha/beta hydrolase fold protein  54.09 
 
 		 278 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.178751 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4189  putative alpha/beta superfamily hydrolase  51.43 
 
 		 258 aa  234  7e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4290  alpha/beta fold family hydrolase  49.79 
 
 		 250 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0052  hydrolase or acyltransferase-like protein  48.99 
 
 		 263 aa  203  2e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.357757  normal  0.185343 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0369  alpha/beta fold family hydrolase  41.7 
 
 		 263 aa  167  1e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2902  alpha/beta hydrolase fold  38.59 
 
 		 261 aa  158  6e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3537  alpha/beta fold family hydrolase  39.6 
 
 		 245 aa  143  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3296  alpha/beta fold family hydrolase  36.82 
 
 		 247 aa  129  5.0000000000000004e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.26426 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2471  alpha/beta fold family hydrolase  35.59 
 
 		 289 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.351444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2353  alpha/beta hydrolase fold  35.17 
 
 		 278 aa  124  1e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.111033  normal  0.169914 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2281  alpha/beta hydrolase fold  34.75 
 
 		 278 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1976  alpha/beta fold family hydrolase  33.06 
 
 		 292 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2186  hydrolase  31.5 
 
 		 200 aa  113  3e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.549707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3018  alpha/beta hydrolase fold  35.32 
 
 		 262 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2717  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 318 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.572547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1743  alpha/beta hydrolase fold protein  34.5 
 
 		 318 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.168912  hitchhiker  0.00128876 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2603  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 313 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2642  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 309 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0775  alpha/beta hydrolase fold  32.11 
 
 		 264 aa  87.8  1e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1880  alpha/beta hydrolase fold  27.47 
 
 		 279 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  28.63 
 
 		 272 aa  55.8  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.343862 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1255  alpha/beta hydrolase fold  28.65 
 
 		 334 aa  55.8  0.0000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000653812  decreased coverage  0.00236014 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5034  alpha/beta hydrolase fold  28.25 
 
 		 245 aa  53.1  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.246074  normal  0.671643 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0908  alpha/beta hydrolase fold protein  22.08 
 
 		 253 aa  51.2  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000766289  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1681  alpha/beta hydrolase fold  26.5 
 
 		 273 aa  52  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0641945  normal  0.147127 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1188  alpha/beta hydrolase fold  24.72 
 
 		 289 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.971563  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3776  alpha/beta hydrolase fold  33.61 
 
 		 361 aa  51.2  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.904669  decreased coverage  0.00241214 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2065  cyclic nucleotide-binding protein  35.62 
 
 		 462 aa  50.8  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0234  hypothetical protein  35.24 
 
 		 330 aa  50.1  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.833519 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1337  alpha/beta hydrolase fold  27.57 
 
 		 289 aa  50.1  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.432487  normal  0.100219 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  35.35 
 
 		 292 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  35.35 
 
 		 277 aa  48.9  0.00007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2537  alpha/beta hydrolase fold  26.61 
 
 		 273 aa  48.5  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1181  alpha/beta hydrolase fold  27.72 
 
 		 300 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1788  alpha/beta hydrolase fold protein  27.07 
 
 		 279 aa  47.8  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0842408  hitchhiker  0.00140329 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0693  alpha/beta hydrolase fold  25.49 
 
 		 258 aa  48.5  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2496  alpha/beta hydrolase fold  30.77 
 
 		 431 aa  48.5  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1044  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 335 aa  48.5  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1471  alpha/beta hydrolase fold  29.03 
 
 		 234 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2408  Alpha/beta hydrolase fold  32.76 
 
 		 282 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.734786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2792  hydrolase, alpha/beta fold family  26.19 
 
 		 287 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00232409  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1501  alpha/beta hydrolase fold  30.39 
 
 		 340 aa  47.4  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1078  alpha/beta hydrolase fold protein  24.02 
 
 		 253 aa  47  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3952  alpha/beta hydrolase fold  33.67 
 
 		 340 aa  47  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0226  alpha/beta hydrolase fold  35.94 
 
 		 271 aa  47  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12729  hydrolase  32.65 
 
 		 341 aa  47  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2263  alpha/beta hydrolase fold  26.91 
 
 		 277 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2258  alpha/beta hydrolase fold  34.34 
 
 		 277 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5633  alpha/beta hydrolase fold  26.96 
 
 		 274 aa  46.2  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2526  alpha/beta hydrolase fold  32.35 
 
 		 275 aa  46.2  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5998  alpha/beta hydrolase fold  26.96 
 
 		 274 aa  46.2  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.492767 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0084  alpha/beta hydrolase fold protein  25.31 
 
 		 246 aa  46.2  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3042  Alpha/beta hydrolase  29.57 
 
 		 380 aa  45.8  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.440112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  28.24 
 
 		 425 aa  45.8  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2432  alpha/beta hydrolase fold  28.7 
 
 		 277 aa  45.4  0.0008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1049  Alpha/beta hydrolase  25.94 
 
 		 285 aa  45.4  0.0008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  28.19 
 
 		 350 aa  45.4  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3961  alpha/beta hydrolase fold  39.73 
 
 		 260 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.611478 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4141  Alpha/beta hydrolase protein  25.67 
 
 		 233 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0961  alpha/beta hydrolase fold  28.8 
 
 		 233 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0172489 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3757  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  31.78 
 
 		 295 aa  45.1  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39469  predicted protein  33.7 
 
 		 306 aa  45.1  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.696258  normal  0.903169 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  25.91 
 
 		 315 aa  45.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3858  alpha/beta hydrolase fold  30.43 
 
 		 304 aa  44.7  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0396  alpha/beta hydrolase fold protein  26.56 
 
 		 255 aa  44.7  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.075233 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2804  alpha/beta fold family hydrolase  28.07 
 
 		 291 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.39146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0296  alpha/beta hydrolase fold protein  35.71 
 
 		 304 aa  44.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.339788  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1781  alpha/beta hydrolase fold protein  31.07 
 
 		 260 aa  44.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1914  alpha/beta fold family hydrolase  35.14 
 
 		 243 aa  43.9  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0891  alpha/beta hydrolase fold  33 
 
 		 274 aa  43.9  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0037  putative alpha/beta hydrolase  37.5 
 
 		 276 aa  44.3  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3023  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 		 294 aa  44.3  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000299925 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2445  alpha/beta hydrolase fold  32.65 
 
 		 340 aa  44.3  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.54824  normal  0.191947 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5882  alpha/beta hydrolase fold  33.65 
 
 		 273 aa  43.9  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3438  3-oxoadipate enol-lactonase  26.87 
 
 		 277 aa  44.3  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1931  alpha/beta hydrolase fold protein  26.99 
 
 		 258 aa  44.7  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5500  putative prolyl aminopeptidase  24.87 
 
 		 291 aa  44.3  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0980519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1254  alpha/beta hydrolase fold  26.09 
 
 		 319 aa  43.9  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000251211  normal  0.0110016 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6489  alpha/beta hydrolase fold  26.96 
 
 		 274 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.802107 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3232  3-oxoadipate enol-lactonase  32.14 
 
 		 277 aa  43.5  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7407  Alpha/beta hydrolase  29.87 
 
 		 274 aa  43.9  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.945303 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2109  alpha/beta hydrolase fold  31.03 
 
 		 294 aa  43.5  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.139583  normal  0.535795 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3756  alpha/beta hydrolase fold  30.84 
 
 		 504 aa  43.5  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.740741  normal  0.0321393 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1561  hydrolase protein  32.43 
 
 		 274 aa  43.1  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2551  alpha/beta fold family hydrolase  25.82 
 
 		 287 aa  43.1  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.27575  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2738  alpha/beta fold family hydrolase  25.82 
 
 		 287 aa  43.1  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.754882  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0147  alpha/beta hydrolase  25.23 
 
 		 282 aa  43.1  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1823  alpha/beta hydrolase fold protein  34.31 
 
 		 264 aa  43.1  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.754545  normal  0.278795 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2172  alpha/beta hydrolase fold  31.63 
 
 		 340 aa  43.1  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2314  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 270 aa  43.1  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.75454  normal  0.0695894 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2218  alpha/beta hydrolase fold  31.63 
 
 		 340 aa  43.1  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.158046  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_31848  predicted protein  30.77 
 
 		 549 aa  43.1  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2161  alpha/beta hydrolase fold  31.63 
 
 		 340 aa  43.1  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170083  hitchhiker  0.00519685 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2233  3-oxoadipate enol-lactonase  34.31 
 
 		 300 aa  43.1  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2809  alpha/beta hydrolase fold  33.73 
 
 		 271 aa  43.1  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1992  alpha/beta hydrolase fold  32.43 
 
 		 274 aa  43.1  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.45941  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>