167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_2281 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_2281  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 278 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2353  alpha/beta hydrolase fold  94.24 
 
 		 278 aa  545  1e-154  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.111033  normal  0.169914 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2471  alpha/beta fold family hydrolase  83.21 
 
 		 289 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.351444  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1976  alpha/beta fold family hydrolase  74.73 
 
 		 292 aa  429  1e-119  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1743  alpha/beta hydrolase fold protein  67.02 
 
 		 318 aa  390  1e-107  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.168912  hitchhiker  0.00128876 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2642  alpha/beta hydrolase fold  65.85 
 
 		 309 aa  382  1e-105  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2717  alpha/beta hydrolase fold  65.05 
 
 		 318 aa  384  1e-105  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.572547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2603  alpha/beta hydrolase fold  65.14 
 
 		 313 aa  378  1e-104  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3018  alpha/beta hydrolase fold  42.91 
 
 		 262 aa  194  1e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0775  alpha/beta hydrolase fold  42.34 
 
 		 264 aa  191  9e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1880  alpha/beta hydrolase fold  36.96 
 
 		 279 aa  177  2e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2902  alpha/beta hydrolase fold  34.29 
 
 		 261 aa  124  2e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0369  alpha/beta fold family hydrolase  37.02 
 
 		 263 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0052  hydrolase or acyltransferase-like protein  32.91 
 
 		 263 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.357757  normal  0.185343 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3438  alpha/beta hydrolase fold  34.32 
 
 		 246 aa  104  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.410588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1284  alpha/beta hydrolase fold  31.43 
 
 		 272 aa  103  3e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.802903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4290  alpha/beta fold family hydrolase  33.05 
 
 		 250 aa  96.7  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3537  alpha/beta fold family hydrolase  33.47 
 
 		 245 aa  92  9e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3296  alpha/beta fold family hydrolase  30.35 
 
 		 247 aa  89.4  6e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.26426 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4625  alpha/beta hydrolase fold protein  29.72 
 
 		 278 aa  85.5  8e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.178751 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0841  alpha/beta family hydrolase  29.67 
 
 		 266 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0266055 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4189  putative alpha/beta superfamily hydrolase  31.25 
 
 		 258 aa  79.7  0.00000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4526  alpha/beta hydrolase fold  28.98 
 
 		 266 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.580548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2186  hydrolase  29.27 
 
 		 200 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.549707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1701  4-carboxymuconolactone decarboxylase  26.69 
 
 		 393 aa  59.3  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0186237  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1729  4-carboxymuconolactone decarboxylase  26.69 
 
 		 393 aa  59.3  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1745  4-carboxymuconolactone decarboxylase  26.69 
 
 		 393 aa  59.3  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1679  4-carboxymuconolactone decarboxylase  26.69 
 
 		 393 aa  59.3  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.412767  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  28.28 
 
 		 308 aa  55.8  0.0000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1491  alpha/beta hydrolase fold  26.45 
 
 		 297 aa  55.1  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00412587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02551  hypothetical protein  28.18 
 
 		 239 aa  55.1  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1801  hypothetical protein  33 
 
 		 238 aa  53.9  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0314686 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3303  3-Oxoadipate enol-lactonase  23.92 
 
 		 300 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.664184  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3307  alpha/beta fold family hydrolase  23.53 
 
 		 300 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3011  alpha/beta hydrolase fold  23.53 
 
 		 300 aa  53.1  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.245192  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1929  3-Oxoadipate enol-lactonase  23.92 
 
 		 300 aa  53.1  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.878211  normal  0.500669 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3049  alpha/beta hydrolase fold  24.6 
 
 		 256 aa  53.1  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.652408  normal  0.351837 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4363  alpha/beta hydrolase fold protein  26.4 
 
 		 239 aa  52  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2995  3-oxoadipate enol-lactonase  23.14 
 
 		 300 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000386793  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5127  alpha/beta hydrolase fold  28.07 
 
 		 249 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3313  3-Oxoadipate enol-lactonase  23.53 
 
 		 300 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2383  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  26.92 
 
 		 294 aa  51.2  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.38703  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3084  3-oxoadipate enol-lactonase  22.75 
 
 		 300 aa  50.4  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0473381  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  25.59 
 
 		 425 aa  50.4  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2076  alpha/beta hydrolase fold  24.47 
 
 		 268 aa  50.8  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.484509 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3320  hydrolase, alpha/beta fold family  22.75 
 
 		 300 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2404  alpha/beta hydrolase fold  39.73 
 
 		 301 aa  50.1  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367269 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0531  alpha/beta hydrolase fold  24.05 
 
 		 264 aa  50.1  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0176995 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3961  alpha/beta hydrolase fold  34.65 
 
 		 260 aa  49.3  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.611478 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3042  Alpha/beta hydrolase  21.88 
 
 		 380 aa  49.3  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.440112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2104  alpha/beta hydrolase fold  23.92 
 
 		 300 aa  49.7  0.00006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000418183  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4016  3-oxoadipate enol-lactonase  25.45 
 
 		 392 aa  49.3  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00993372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0616  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  21.62 
 
 		 252 aa  49.3  0.00007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4206  3-oxoadipate enol-lactonase  23.24 
 
 		 268 aa  49.3  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1259  3-oxoadipate enol-lactonase  23 
 
 		 261 aa  48.9  0.00008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2316  hypothetical protein  25.27 
 
 		 227 aa  48.9  0.00009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  23.81 
 
 		 267 aa  48.9  0.00009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4521  alpha/beta hydrolase fold  32 
 
 		 270 aa  48.9  0.00009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.78404  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3098  alpha/beta fold family hydrolase  22.35 
 
 		 300 aa  48.5  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.833481  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3343  alpha/beta fold family hydrolase  22.35 
 
 		 300 aa  48.5  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  25.84 
 
 		 301 aa  48.1  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0943  hypothetical protein  26.26 
 
 		 238 aa  48.5  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00938293 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2691  3-oxoadipate enol-lactonase  20.33 
 
 		 266 aa  48.5  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000109702  normal  0.164043 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3321  alpha/beta hydrolase fold protein  23.14 
 
 		 254 aa  48.1  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3029  alpha/beta hydrolase fold protein  26.16 
 
 		 305 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3091  alpha/beta hydrolase fold protein  26.16 
 
 		 305 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3719  alpha/beta hydrolase fold  35.64 
 
 		 260 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.815141  hitchhiker  0.00169195 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3491  3-oxoadipate enol-lactonase  23.77 
 
 		 262 aa  48.1  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.323872  normal  0.346177 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0879  alpha/beta hydrolase fold protein  24.33 
 
 		 349 aa  47.4  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2192  alpha/beta hydrolase fold protein  32 
 
 		 248 aa  48.1  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000000941808  hitchhiker  0.00021747 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1681  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 273 aa  48.1  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0641945  normal  0.147127 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3725  3-oxoadipate enol-lactonase  24.08 
 
 		 263 aa  47.8  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  24.89 
 
 		 279 aa  48.1  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2740  alpha/beta hydrolase fold  23.05 
 
 		 294 aa  47.8  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1835  alpha/beta hydrolase fold  27.87 
 
 		 268 aa  47  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0596048 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5996  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)  23.53 
 
 		 260 aa  47.4  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1230  alpha/beta hydrolase fold  27.92 
 
 		 261 aa  47  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6602  alpha/beta hydrolase fold  27.92 
 
 		 261 aa  47  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.472817  normal  0.1504 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5020  3-oxoadipate enol-lactonase  28.24 
 
 		 256 aa  47.4  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.42347 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2065  cyclic nucleotide-binding protein  27.31 
 
 		 462 aa  47  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1760  alpha/beta hydrolase fold  28 
 
 		 235 aa  47.4  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000242559  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1677  alpha/beta hydrolase fold protein  23.6 
 
 		 270 aa  47.4  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.216999  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1149  alpha/beta hydrolase fold protein  24.29 
 
 		 265 aa  46.6  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12729  hydrolase  29 
 
 		 341 aa  47  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  21.99 
 
 		 562 aa  46.6  0.0004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0878  alpha/beta hydrolase fold  28.77 
 
 		 317 aa  46.6  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0136792  hitchhiker  0.00000592996 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2804  alpha/beta fold family hydrolase  26.42 
 
 		 291 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.39146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1273  Alpha/beta hydrolase fold  20.44 
 
 		 258 aa  46.2  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.879726  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2661  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 		 282 aa  46.6  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.370898  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  25.4 
 
 		 261 aa  46.2  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1902  EstC  29 
 
 		 235 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00691738  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1736  alpha/beta hydrolase fold  28.68 
 
 		 290 aa  46.6  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1435  alpha/beta hydrolase fold protein  34.55 
 
 		 256 aa  46.6  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.426403  normal  0.727578 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1540  putative hydrolase  28.57 
 
 		 264 aa  46.2  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.153847  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5281  alpha/beta hydrolase  26.72 
 
 		 272 aa  46.2  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2526  alpha/beta hydrolase fold  25.32 
 
 		 275 aa  45.8  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  25.94 
 
 		 265 aa  46.2  0.0007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3105  alpha/beta hydrolase fold  33.72 
 
 		 257 aa  45.8  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0635693  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5072  alpha/beta hydrolase fold protein  23.67 
 
 		 281 aa  45.8  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.157677 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0033  alpha/beta hydrolase fold  22.97 
 
 		 245 aa  45.8  0.0007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0204897  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>