58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0369 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA0369  alpha/beta fold family hydrolase  100 
 
 
263 aa  518  1e-146  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3537  alpha/beta fold family hydrolase  43.9 
 
 
245 aa  179  4e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0052  hydrolase or acyltransferase-like protein  45.68 
 
 
263 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.357757  normal  0.185343 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1284  alpha/beta hydrolase fold  39.55 
 
 
272 aa  162  7e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.802903  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0841  alpha/beta family hydrolase  39.45 
 
 
266 aa  154  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0266055 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4625  alpha/beta hydrolase fold protein  40.45 
 
 
278 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.178751 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4526  alpha/beta hydrolase fold  39.61 
 
 
266 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.580548  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3438  alpha/beta hydrolase fold  41.7 
 
 
246 aa  148  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.410588  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2902  alpha/beta hydrolase fold  34.63 
 
 
261 aa  143  3e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4290  alpha/beta fold family hydrolase  40.08 
 
 
250 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3296  alpha/beta fold family hydrolase  34.84 
 
 
247 aa  138  8.999999999999999e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.26426 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4189  putative alpha/beta superfamily hydrolase  38.55 
 
 
258 aa  138  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1976  alpha/beta fold family hydrolase  33.07 
 
 
292 aa  122  6e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2353  alpha/beta hydrolase fold  36.97 
 
 
278 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.111033  normal  0.169914 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2281  alpha/beta hydrolase fold  37.02 
 
 
278 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2186  hydrolase  36.5 
 
 
200 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.549707  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2471  alpha/beta fold family hydrolase  36.13 
 
 
289 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.351444  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1743  alpha/beta hydrolase fold protein  35.14 
 
 
318 aa  112  6e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.168912  hitchhiker  0.00128876 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2717  alpha/beta hydrolase fold  35.14 
 
 
318 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.572547  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2642  alpha/beta hydrolase fold  35.14 
 
 
309 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2603  alpha/beta hydrolase fold  35.34 
 
 
313 aa  105  8e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3018  alpha/beta hydrolase fold  35.04 
 
 
262 aa  103  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1880  alpha/beta hydrolase fold  28.32 
 
 
279 aa  95.1  9e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0775  alpha/beta hydrolase fold  30.89 
 
 
264 aa  90.1  3e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3860  prolyl aminopeptidase  25.94 
 
 
286 aa  52.8  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.4706  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2809  alpha/beta hydrolase fold  21.72 
 
 
271 aa  50.8  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27800  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  36.3 
 
 
301 aa  49.3  0.00007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.245903  normal  0.787751 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5466  alpha/beta hydrolase fold  26.95 
 
 
298 aa  49.3  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0306241 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5377  alpha/beta hydrolase fold  26.95 
 
 
298 aa  49.3  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5753  alpha/beta hydrolase fold  26.95 
 
 
298 aa  48.9  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.766272  normal  0.921974 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2367  alpha/beta hydrolase fold protein  26.6 
 
 
286 aa  48.5  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.368093  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1551  putative esterase/lipase  29.67 
 
 
262 aa  47.4  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.38652  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5049  hypothetical protein  26.78 
 
 
247 aa  47  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.82888  normal  0.0566576 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2404  alpha/beta hydrolase fold  28.26 
 
 
277 aa  46.2  0.0006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0263  Alpha/beta hydrolase fold  26.07 
 
 
266 aa  45.8  0.0008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.191481  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4484  alpha/beta hydrolase fold protein  25.2 
 
 
283 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2691  3-oxoadipate enol-lactonase  24.91 
 
 
266 aa  44.7  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000109702  normal  0.164043 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1842  alpha/beta hydrolase fold  24.55 
 
 
267 aa  45.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.384608 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3469  alpha/beta hydrolase fold protein  28.71 
 
 
304 aa  44.7  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.210979  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3961  alpha/beta hydrolase fold  32.06 
 
 
260 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.611478 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1259  alpha/beta hydrolase fold  26.36 
 
 
284 aa  45.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5717  alpha/beta hydrolase fold  27.65 
 
 
270 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6081  alpha/beta hydrolase fold  27.65 
 
 
270 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3719  alpha/beta hydrolase fold  38.16 
 
 
260 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.815141  hitchhiker  0.00169195 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4455  Alpha/beta hydrolase fold  24.51 
 
 
281 aa  44.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1252  alpha/beta fold hydrolase  26.58 
 
 
274 aa  44.3  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0828608  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1463  Alpha/beta hydrolase  26.29 
 
 
278 aa  43.5  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.234917  normal  0.480235 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2759  alpha/beta hydrolase fold  26.92 
 
 
272 aa  43.1  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0191279  normal  0.157036 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4363  alpha/beta hydrolase fold protein  27.01 
 
 
239 aa  43.5  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  28 
 
 
264 aa  43.1  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1756  alpha/beta hydrolase fold  34 
 
 
260 aa  43.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29430  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  32.63 
 
 
246 aa  43.1  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0217971  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0128  alpha/beta hydrolase fold  27.71 
 
 
262 aa  42.7  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1673  alpha/beta hydrolase fold protein  30.81 
 
 
267 aa  42.4  0.008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.114563 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0531  alpha/beta hydrolase fold  30.12 
 
 
264 aa  42.4  0.009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0176995 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1655  alpha/beta hydrolase fold  26.44 
 
 
273 aa  42  0.01  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.831884  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1025  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 
301 aa  42  0.01  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1828  acylglycerol lipase  32.35 
 
 
272 aa  42  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206898  normal  0.18483 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>