43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4189 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4189  putative alpha/beta superfamily hydrolase  100 
 
 		 258 aa  511  1e-144  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4290  alpha/beta fold family hydrolase  63.41 
 
 		 250 aa  286  2e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0841  alpha/beta family hydrolase  54.14 
 
 		 266 aa  242  5e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0266055 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4625  alpha/beta hydrolase fold protein  54.81 
 
 		 278 aa  237  2e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.178751 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1284  alpha/beta hydrolase fold  48.86 
 
 		 272 aa  234  9e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.802903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4526  alpha/beta hydrolase fold  53.58 
 
 		 266 aa  232  5e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.580548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3438  alpha/beta hydrolase fold  51.43 
 
 		 246 aa  221  7e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.410588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0052  hydrolase or acyltransferase-like protein  46.75 
 
 		 263 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.357757  normal  0.185343 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0369  alpha/beta fold family hydrolase  38.55 
 
 		 263 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3537  alpha/beta fold family hydrolase  37.25 
 
 		 245 aa  137  2e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2902  alpha/beta hydrolase fold  34.65 
 
 		 261 aa  121  9.999999999999999e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2186  hydrolase  31 
 
 		 200 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.549707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3296  alpha/beta fold family hydrolase  32.8 
 
 		 247 aa  101  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.26426 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1976  alpha/beta fold family hydrolase  30.12 
 
 		 292 aa  90.1  3e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2281  alpha/beta hydrolase fold  31.25 
 
 		 278 aa  86.7  3e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1743  alpha/beta hydrolase fold protein  30.04 
 
 		 318 aa  85.5  8e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.168912  hitchhiker  0.00128876 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2717  alpha/beta hydrolase fold  30.42 
 
 		 318 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.572547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2642  alpha/beta hydrolase fold  30.8 
 
 		 309 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2353  alpha/beta hydrolase fold  29.1 
 
 		 278 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.111033  normal  0.169914 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2603  alpha/beta hydrolase fold  30.8 
 
 		 313 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2471  alpha/beta fold family hydrolase  29.1 
 
 		 289 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.351444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3018  alpha/beta hydrolase fold  27.34 
 
 		 262 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0775  alpha/beta hydrolase fold  26.56 
 
 		 264 aa  65.5  0.0000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1880  alpha/beta hydrolase fold  22.15 
 
 		 279 aa  52.8  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3143  alpha/beta hydrolase fold protein  27.66 
 
 		 265 aa  50.8  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0431  alpha/beta hydrolase fold  22.54 
 
 		 325 aa  49.7  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0538885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6060  esterase/lipase  26.82 
 
 		 265 aa  48.5  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3829  alpha/beta hydrolase fold  27.69 
 
 		 331 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1255  alpha/beta hydrolase fold  25.55 
 
 		 334 aa  47.4  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000653812  decreased coverage  0.00236014 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5500  putative prolyl aminopeptidase  24.29 
 
 		 291 aa  47  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0980519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2367  alpha/beta hydrolase fold protein  28.95 
 
 		 286 aa  46.6  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.368093  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1945  alpha/beta hydrolase fold  28.64 
 
 		 346 aa  45.8  0.0007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1838  alpha/beta hydrolase fold  29.74 
 
 		 333 aa  45.4  0.0008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.886983  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0296  alpha/beta hydrolase fold protein  32.84 
 
 		 304 aa  45.4  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.339788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1108  alpha/beta hydrolase fold  22.93 
 
 		 232 aa  45.4  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3884  alpha/beta hydrolase fold  35.53 
 
 		 341 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.447806  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1561  hydrolase protein  25.87 
 
 		 274 aa  45.4  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3157  alpha/beta hydrolase fold  29.45 
 
 		 262 aa  44.3  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343409 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1303  alpha/beta hydrolase fold protein  29.02 
 
 		 299 aa  44.3  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.427571  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1463  Alpha/beta hydrolase  32.86 
 
 		 278 aa  43.1  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.234917  normal  0.480235 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0396  alpha/beta hydrolase fold protein  28.84 
 
 		 255 aa  42.7  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.075233 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1534  alpha/beta hydrolase fold protein  26.92 
 
 		 263 aa  42.7  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0444471 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2684  alpha/beta hydrolase fold protein  25.71 
 
 		 310 aa  42.4  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000788491  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>