More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1534 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_1534  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
263 aa  524  1e-148  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0444471 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4406  hydrolase  55.86 
 
 
271 aa  250  1e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.018151 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0821  alpha/beta hydrolase fold  30.04 
 
 
252 aa  109  5e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2065  alpha/beta hydrolase fold protein  28.76 
 
 
252 aa  105  5e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0179548  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0750  putative branched-chain amino acid transport protein  26.56 
 
 
256 aa  92.4  7e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2885  alpha/beta hydrolase fold protein  39.37 
 
 
275 aa  77.8  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00297178 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4196  alpha/beta hydrolase fold  34.09 
 
 
294 aa  77  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0769  hydrolase, alpha/beta fold family  33.33 
 
 
294 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000479635  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4468  hydrolase, alpha/beta fold family  33.33 
 
 
294 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000249417  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4430  alpha/beta fold family hydrolase  32.58 
 
 
287 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.12561  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4481  hydrolase, alpha/beta fold family  33.33 
 
 
294 aa  75.9  0.0000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0931  alpha/beta hydrolase fold family lipase  32.58 
 
 
291 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000302651  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4095  alpha/beta fold family hydrolase  33.61 
 
 
294 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000787751  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4246  alpha/beta fold family hydrolase  33.61 
 
 
294 aa  72.8  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000956714  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4084  alpha/beta fold family hydrolase  33.61 
 
 
294 aa  72.8  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000349067  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3071  alpha/beta hydrolase fold  32.54 
 
 
290 aa  72.8  0.000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.357729  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4429  hydrolase, alpha/beta fold family  33.61 
 
 
294 aa  72.8  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4577  alpha/beta fold family hydrolase  33.61 
 
 
287 aa  72.4  0.000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1100  hydrolase, alpha/beta fold family  32.82 
 
 
291 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.59036e-57 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0953  alpha/beta fold family hydrolase  32.06 
 
 
291 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0939  alpha/beta hydrolase fold family lipase  32.06 
 
 
291 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000150383  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1019  alpha/beta fold family hydrolase  32.06 
 
 
291 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00544898  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4241  hydrolase, alpha/beta fold family  32.06 
 
 
290 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0213697  hitchhiker  0.0000000245564 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0940  alpha/beta hydrolase fold  32.03 
 
 
290 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.178351  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4523  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  42.86 
 
 
271 aa  70.5  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104364  normal  0.231171 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1057  hydrolase, alpha/beta fold family  32.03 
 
 
290 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000161202  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1120  alpha/beta fold family hydrolase  32.03 
 
 
291 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00823936  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1186  hydrolase, alpha/beta fold family  31.3 
 
 
291 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000004858  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3338  alpha/beta hydrolase fold  40.95 
 
 
271 aa  69.3  0.00000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0955603 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1628  alpha/beta hydrolase fold protein  42.37 
 
 
229 aa  64.7  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.989142  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1778  alpha/beta hydrolase fold  40.34 
 
 
366 aa  63.9  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0401666  normal  0.253947 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3690  alpha/beta hydrolase fold  38.24 
 
 
276 aa  64.3  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2674  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  28.09 
 
 
282 aa  62.8  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1140  alpha/beta hydrolase fold  31.82 
 
 
320 aa  62.8  0.000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.64719  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2404  alpha/beta hydrolase fold  36.44 
 
 
301 aa  62.8  0.000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00367269 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1546  alpha/beta hydrolase fold  35.04 
 
 
285 aa  62.8  0.000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.834926  hitchhiker  0.0047604 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1827  alpha/beta hydrolase fold  37.14 
 
 
285 aa  62.4  0.000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5680  alpha/beta hydrolase fold protein  35.14 
 
 
324 aa  60.5  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1459  alpha/beta hydrolase fold  33.82 
 
 
276 aa  60.5  0.00000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03059  putative esterase protein  28.29 
 
 
246 aa  60.1  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.71029  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4111  alpha/beta hydrolase fold protein  41.18 
 
 
288 aa  60.1  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0346007  normal  0.0462514 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1166  alpha/beta hydrolase fold protein  28.46 
 
 
333 aa  59.7  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5011  putative alpha/beta hydrolase  36.3 
 
 
350 aa  59.3  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.418737  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1512  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 
311 aa  59.3  0.00000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1316  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
311 aa  59.3  0.00000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.541831  normal  0.727397 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6938  alpha/beta hydrolase fold protein  26.15 
 
 
279 aa  59.3  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.178748 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0778  alpha/beta hydrolase fold  32.14 
 
 
290 aa  58.9  0.00000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.588108  normal  0.620375 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  30.38 
 
 
275 aa  58.9  0.00000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5931  alpha/beta hydrolase fold  32.8 
 
 
261 aa  58.9  0.00000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0123978 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1637  alpha/beta hydrolase fold  31.16 
 
 
287 aa  58.5  0.00000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6469  haloalkane dehalogenase  32.85 
 
 
287 aa  58.9  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.805806  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2782  alpha/beta hydrolase fold protein  34.43 
 
 
325 aa  58.5  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1412  alpha/beta fold family hydrolase  43.42 
 
 
295 aa  58.2  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.405065 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1594  putative alpha/beta hydrolase  34.4 
 
 
320 aa  58.2  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.404575 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1509  alpha/beta hydrolase fold  29.91 
 
 
287 aa  57.8  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2147  alpha/beta hydrolase fold  31.75 
 
 
278 aa  57.4  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7902  alpha/beta hydrolase fold protein  35.48 
 
 
295 aa  58.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1287  alpha/beta hydrolase fold protein  36.52 
 
 
255 aa  57.4  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00130508  normal  0.0205637 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2136  alpha/beta hydrolase fold protein  28.08 
 
 
277 aa  57.8  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.137124  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0177  alpha/beta hydrolase fold protein  37.5 
 
 
329 aa  57.4  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0994  alpha/beta hydrolase fold  29.27 
 
 
281 aa  57.4  0.0000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.795664 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2627  alpha/beta hydrolase fold protein  32.89 
 
 
275 aa  57  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.546474 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2101  alpha/beta hydrolase fold  41.98 
 
 
285 aa  57  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.715377  normal  0.912757 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  39.62 
 
 
295 aa  57  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0552  alpha/beta hydrolase fold protein  28.47 
 
 
294 aa  57  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2513  Alpha/beta hydrolase fold  30.19 
 
 
276 aa  56.6  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1310  haloalkane dehalogenase  28.47 
 
 
302 aa  56.6  0.0000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000017212  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1370  haloalkane dehalogenase  28.47 
 
 
293 aa  56.6  0.0000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  6.59212e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12070  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  29.18 
 
 
276 aa  56.6  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1121  alpha/beta hydrolase fold protein  38.74 
 
 
322 aa  56.6  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2793  alpha/beta hydrolase fold protein  29.55 
 
 
281 aa  56.2  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.370056 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5919  alpha/beta hydrolase fold protein  36.46 
 
 
381 aa  56.2  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.539909 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1025  alpha/beta hydrolase fold protein  36.94 
 
 
301 aa  55.8  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1230  alpha/beta hydrolase fold  39.5 
 
 
261 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6602  alpha/beta hydrolase fold  39.5 
 
 
261 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.472817  normal  0.1504 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09891  Alpha/beta hydrolase fold  31.36 
 
 
299 aa  55.8  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1513  Alpha/beta hydrolase fold  31.91 
 
 
293 aa  55.8  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0675  alpha/beta hydrolase fold  31.68 
 
 
290 aa  55.8  0.0000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0467323 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1463  Alpha/beta hydrolase  34.34 
 
 
278 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.234917  normal  0.480235 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3577  alpha/beta hydrolase fold protein  34.86 
 
 
358 aa  55.8  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.351187  normal  0.127844 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3988  alpha/beta hydrolase fold protein  27.13 
 
 
263 aa  55.8  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10044  hydrolase  31.25 
 
 
298 aa  55.5  0.0000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  28.85 
 
 
286 aa  55.5  0.0000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0056  alpha/beta hydrolase fold  35.4 
 
 
332 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00660  Alpha/beta hydrolase fold protein  29.17 
 
 
280 aa  55.1  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00763  hydrolase, alpha/beta fold family protein  28.57 
 
 
278 aa  55.1  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0837  alpha/beta fold family hydrolase  27.83 
 
 
299 aa  55.1  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5046  alpha/beta hydrolase fold protein  39.22 
 
 
281 aa  54.7  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.186398  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0043  alpha/beta hydrolase fold protein  31.32 
 
 
299 aa  54.7  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0261008  normal  0.0287829 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1030  alpha/beta hydrolase fold  26.81 
 
 
280 aa  55.1  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.999949  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0105  alpha/beta hydrolase  36.75 
 
 
328 aa  55.5  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00875507  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0023  alpha/beta hydrolase fold  36.73 
 
 
315 aa  54.7  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00672386  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1095  alpha/beta hydrolase fold  25.43 
 
 
302 aa  55.1  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1491  alpha/beta hydrolase fold  24.3 
 
 
297 aa  54.7  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00412587  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2945  alpha/beta hydrolase fold protein  32.79 
 
 
330 aa  54.7  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2983  alpha/beta hydrolase fold protein  34.92 
 
 
303 aa  55.5  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.283426 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3174  alpha/beta hydrolase fold protein  31.21 
 
 
282 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7956  haloalkane dehalogenase  32.11 
 
 
292 aa  55.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1080  alpha/beta hydrolase fold  27.73 
 
 
296 aa  54.7  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0831  alpha/beta hydrolase fold protein  36.8 
 
 
344 aa  54.3  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>