More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0750 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0750  putative branched-chain amino acid transport protein  100 
 
 
256 aa  526  1e-148  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2065  alpha/beta hydrolase fold protein  34.14 
 
 
252 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0179548  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0821  alpha/beta hydrolase fold  31.25 
 
 
252 aa  127  1.0000000000000001e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4406  hydrolase  26.69 
 
 
271 aa  92.4  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.018151 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1534  alpha/beta hydrolase fold protein  26.56 
 
 
263 aa  92.4  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0444471 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0809  alpha/beta hydrolase fold  30.95 
 
 
283 aa  65.9  0.0000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4430  alpha/beta fold family hydrolase  31.86 
 
 
287 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.12561  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4095  alpha/beta fold family hydrolase  31.86 
 
 
294 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000787751  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0769  hydrolase, alpha/beta fold family  31.86 
 
 
294 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000479635  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4481  hydrolase, alpha/beta fold family  31.86 
 
 
294 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4468  hydrolase, alpha/beta fold family  31.86 
 
 
294 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000249417  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5011  putative alpha/beta hydrolase  37.01 
 
 
350 aa  63.9  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.418737  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4246  alpha/beta fold family hydrolase  31.86 
 
 
294 aa  63.9  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000956714  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4084  alpha/beta fold family hydrolase  31.86 
 
 
294 aa  63.9  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000349067  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3071  alpha/beta hydrolase fold  30.97 
 
 
290 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.357729  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4577  alpha/beta fold family hydrolase  31.86 
 
 
287 aa  63.5  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4429  hydrolase, alpha/beta fold family  31.86 
 
 
294 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1827  alpha/beta hydrolase fold  27.52 
 
 
285 aa  63.9  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1463  Alpha/beta hydrolase  29.56 
 
 
278 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.234917  normal  0.480235 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1905  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
354 aa  63.2  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4196  alpha/beta hydrolase fold  31.86 
 
 
294 aa  62.8  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1217  alpha/beta hydrolase fold protein  24.72 
 
 
335 aa  60.8  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2989  alpha/beta hydrolase fold  30.25 
 
 
339 aa  60.5  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.720192 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0056  alpha/beta hydrolase fold  32.38 
 
 
332 aa  59.7  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0665  alpha/beta hydrolase fold  30.83 
 
 
405 aa  58.9  0.00000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.910637  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1057  hydrolase, alpha/beta fold family  30.09 
 
 
290 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000161202  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0487  alpha/beta hydrolase fold  30.43 
 
 
240 aa  58.2  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1120  alpha/beta fold family hydrolase  32.35 
 
 
291 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00823936  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2720  alpha/beta hydrolase fold protein  28.1 
 
 
342 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0940  alpha/beta hydrolase fold  29.2 
 
 
290 aa  57.8  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.178351  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1140  alpha/beta hydrolase fold  29.63 
 
 
320 aa  57.4  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.64719  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  36.79 
 
 
272 aa  57.8  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.343862 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1100  hydrolase, alpha/beta fold family  32.35 
 
 
291 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.59036e-57 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1186  hydrolase, alpha/beta fold family  32.35 
 
 
291 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000004858  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0953  alpha/beta fold family hydrolase  30.09 
 
 
291 aa  57  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0939  alpha/beta hydrolase fold family lipase  32.35 
 
 
291 aa  57  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000150383  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0931  alpha/beta hydrolase fold family lipase  30.09 
 
 
291 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000302651  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1019  alpha/beta fold family hydrolase  30.09 
 
 
291 aa  57  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00544898  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8725  alpha/beta hydrolase fold protein  32.67 
 
 
332 aa  57  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5680  alpha/beta hydrolase fold protein  27.95 
 
 
324 aa  57  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0608  alpha/beta hydrolase fold  30.69 
 
 
311 aa  57  0.0000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000717376  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6057  alpha/beta hydrolase fold  32.67 
 
 
332 aa  56.6  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00402067  normal  0.493992 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0102  alpha/beta hydrolase fold  31.68 
 
 
332 aa  56.6  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2404  alpha/beta hydrolase fold  36.89 
 
 
301 aa  56.6  0.0000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00367269 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4241  hydrolase, alpha/beta fold family  30.09 
 
 
290 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0213697  hitchhiker  0.0000000245564 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0087  alpha/beta hydrolase fold protein  31.43 
 
 
332 aa  56.6  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5377  alpha/beta hydrolase fold protein  30.48 
 
 
332 aa  56.2  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.306055  normal  0.839367 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2174  alpha/beta hydrolase fold protein  24.15 
 
 
277 aa  56.2  0.0000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.633996  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1121  hypothetical protein  27.12 
 
 
260 aa  55.8  0.0000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.848062  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09348  probable hydrolytic enzyme  29.59 
 
 
331 aa  55.8  0.0000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0100804  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3338  alpha/beta hydrolase fold  27.23 
 
 
271 aa  55.5  0.0000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0955603 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2945  alpha/beta hydrolase fold protein  30.58 
 
 
330 aa  55.5  0.0000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3489  alpha/beta hydrolase fold  29.23 
 
 
284 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2218  hydrolase, alpha/beta fold family  26.42 
 
 
284 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.364835  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8386  hydrolase, alpha  33.05 
 
 
304 aa  54.7  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.139718  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1703  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 
284 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.198775  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4164  alpha/beta fold family hydrolase  30 
 
 
284 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0099  alpha/beta fold family hydrolase  33.63 
 
 
324 aa  54.3  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1513  Alpha/beta hydrolase fold  29.29 
 
 
293 aa  53.9  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3736  alpha/beta hydrolase fold  26.8 
 
 
284 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1076  hypothetical protein  33.63 
 
 
324 aa  54.3  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.773392  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0434  alpha/beta hydrolase fold  31.2 
 
 
318 aa  54.7  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.332302  hitchhiker  0.0000000111123 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1260  alpha/beta fold family hydrolase  33.63 
 
 
327 aa  54.3  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.809  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2822  alpha/beta fold family hydrolase  33.63 
 
 
324 aa  54.3  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2675  alpha/beta fold family hydrolase  24.62 
 
 
324 aa  54.7  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.457884  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9504  alpha/beta hydrolase protein  27.42 
 
 
272 aa  53.9  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.932687  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0741  hypothetical protein  31.9 
 
 
292 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0064  alpha/beta hydrolase fold  27.74 
 
 
330 aa  53.5  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2696  alpha/beta hydrolase fold protein  33.1 
 
 
268 aa  53.5  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.094894  normal  0.233594 
 
 
-
 
NC_003296  RS03173  hypothetical protein  24.59 
 
 
272 aa  53.1  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.188182 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2334  alpha/beta hydrolase fold  31.68 
 
 
258 aa  53.1  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000909068  hitchhiker  0.0000846948 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8642  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  26.92 
 
 
321 aa  52.8  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0446  alpha/beta hydrolase fold protein  30.4 
 
 
318 aa  52.8  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.2537  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2136  alpha/beta hydrolase fold protein  28.32 
 
 
277 aa  52.8  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.137124  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4202  epoxide hydrolase  27.37 
 
 
284 aa  52.4  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.531569 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1681  alpha/beta hydrolase fold  28.28 
 
 
273 aa  52.4  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0641945  normal  0.147127 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3466  alpha/beta hydrolase fold protein  30.19 
 
 
390 aa  52.4  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0402  alpha/beta fold family hydrolase  32.74 
 
 
324 aa  52.4  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6643  putative triacylglycerol lipase  27.78 
 
 
275 aa  52.4  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192902  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3642  alpha/beta hydrolase fold  29.91 
 
 
379 aa  52.4  0.000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20936  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3121  hypothetical protein  26.67 
 
 
259 aa  52.4  0.000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000331929  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3935  alpha/beta hydrolase fold protein  28.97 
 
 
371 aa  52  0.000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_15323  predicted protein  28.57 
 
 
272 aa  51.2  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00155902  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0829  alpha/beta hydrolase fold  31.73 
 
 
290 aa  51.6  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.41609  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11862  haloalkane dehalogenase  35.71 
 
 
286 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.608613 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0537  dihydrolipoamide acetyltransferase, putative  32.04 
 
 
292 aa  52  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.169084  normal  0.40861 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7101  alpha/beta hydrolase fold protein  28.3 
 
 
289 aa  51.2  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.974573 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2317  alpha/beta hydrolase fold  33.01 
 
 
270 aa  51.2  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0148017 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1917  alpha/beta hydrolase fold protein  28.02 
 
 
278 aa  50.8  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00303  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  25.52 
 
 
293 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0321266  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00307  hypothetical protein  25.52 
 
 
293 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0415585  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0380  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  25.52 
 
 
288 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.615144  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3276  alpha/beta hydrolase fold  25.52 
 
 
288 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.15708  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3690  alpha/beta hydrolase fold  26.83 
 
 
276 aa  50.4  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0373  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  25.52 
 
 
293 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.170384  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0413  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  25.52 
 
 
293 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0424  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  25.52 
 
 
288 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2534  alpha/beta hydrolase fold  30.39 
 
 
330 aa  51.2  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2782  alpha/beta hydrolase fold protein  29.37 
 
 
325 aa  51.2  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2986  hypothetical protein  27.12 
 
 
255 aa  50.8  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.33197  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>