189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_1976 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1976  alpha/beta fold family hydrolase  100 
 
 		 292 aa  610  9.999999999999999e-175  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2471  alpha/beta fold family hydrolase  75 
 
 		 289 aa  461  1e-129  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.351444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2281  alpha/beta hydrolase fold  74.73 
 
 		 278 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2353  alpha/beta hydrolase fold  74.73 
 
 		 278 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.111033  normal  0.169914 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2717  alpha/beta hydrolase fold  65.52 
 
 		 318 aa  392  1e-108  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.572547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1743  alpha/beta hydrolase fold protein  66.67 
 
 		 318 aa  393  1e-108  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.168912  hitchhiker  0.00128876 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2642  alpha/beta hydrolase fold  65.62 
 
 		 309 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2603  alpha/beta hydrolase fold  64.58 
 
 		 313 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3018  alpha/beta hydrolase fold  44.18 
 
 		 262 aa  205  7e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0775  alpha/beta hydrolase fold  45.12 
 
 		 264 aa  195  9e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1880  alpha/beta hydrolase fold  36.23 
 
 		 279 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0369  alpha/beta fold family hydrolase  33.07 
 
 		 263 aa  122  7e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2902  alpha/beta hydrolase fold  34.55 
 
 		 261 aa  119  3.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0052  hydrolase or acyltransferase-like protein  32.77 
 
 		 263 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.357757  normal  0.185343 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4290  alpha/beta fold family hydrolase  33.88 
 
 		 250 aa  107  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1284  alpha/beta hydrolase fold  31.43 
 
 		 272 aa  107  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.802903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3438  alpha/beta hydrolase fold  32.24 
 
 		 246 aa  99.8  5e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.410588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3537  alpha/beta fold family hydrolase  31.58 
 
 		 245 aa  95.1  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3296  alpha/beta fold family hydrolase  28.46 
 
 		 247 aa  93.2  5e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.26426 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4625  alpha/beta hydrolase fold protein  29.69 
 
 		 278 aa  89  9e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.178751 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0841  alpha/beta family hydrolase  28.74 
 
 		 266 aa  87  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0266055 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2186  hydrolase  29.47 
 
 		 200 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.549707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4526  alpha/beta hydrolase fold  27.41 
 
 		 266 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.580548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4189  putative alpha/beta superfamily hydrolase  30.12 
 
 		 258 aa  81.6  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3798  alpha/beta hydrolase fold protein  26.47 
 
 		 258 aa  59.7  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13190  lysophospholipase  27.13 
 
 		 262 aa  59.7  0.00000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0607698  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3307  alpha/beta fold family hydrolase  24.16 
 
 		 300 aa  59.3  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3303  3-Oxoadipate enol-lactonase  25.1 
 
 		 300 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.664184  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1929  3-Oxoadipate enol-lactonase  25.1 
 
 		 300 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.878211  normal  0.500669 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3011  alpha/beta hydrolase fold  23.33 
 
 		 300 aa  58.2  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.245192  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1801  hypothetical protein  32 
 
 		 238 aa  57.4  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0314686 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3049  alpha/beta hydrolase fold  23.2 
 
 		 256 aa  57  0.0000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.652408  normal  0.351837 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4363  alpha/beta hydrolase fold protein  27.31 
 
 		 239 aa  56.6  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2995  3-oxoadipate enol-lactonase  23.7 
 
 		 300 aa  55.8  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000386793  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  24.14 
 
 		 267 aa  55.8  0.0000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  23.51 
 
 		 562 aa  55.8  0.0000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3084  3-oxoadipate enol-lactonase  23.33 
 
 		 300 aa  55.1  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0473381  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3320  hydrolase, alpha/beta fold family  23.33 
 
 		 300 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3313  3-Oxoadipate enol-lactonase  23.68 
 
 		 300 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  27.05 
 
 		 308 aa  54.7  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2740  alpha/beta hydrolase fold  22.78 
 
 		 294 aa  54.3  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2104  alpha/beta hydrolase fold  22.34 
 
 		 300 aa  54.7  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000418183  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3098  alpha/beta fold family hydrolase  22.96 
 
 		 300 aa  53.5  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.833481  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3343  alpha/beta fold family hydrolase  22.96 
 
 		 300 aa  53.5  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02551  hypothetical protein  25.36 
 
 		 239 aa  53.5  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0616  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  22.35 
 
 		 252 aa  53.1  0.000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  24.15 
 
 		 291 aa  53.1  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0879  alpha/beta hydrolase fold protein  26.19 
 
 		 349 aa  53.1  0.000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1149  alpha/beta hydrolase fold protein  32.71 
 
 		 265 aa  52.8  0.000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3961  alpha/beta hydrolase fold  24.28 
 
 		 260 aa  52.4  0.000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.611478 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  24.24 
 
 		 290 aa  52.4  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0033  alpha/beta hydrolase fold  24.07 
 
 		 245 aa  52  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0204897  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3321  alpha/beta hydrolase fold protein  32.43 
 
 		 254 aa  51.2  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1259  3-oxoadipate enol-lactonase  23.04 
 
 		 261 aa  51.2  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2383  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  24.89 
 
 		 294 aa  50.8  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.38703  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1988  alpha/beta hydrolase superfamily protein  23.59 
 
 		 321 aa  50.1  0.00004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.150126 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3779  cyclic nucleotide-binding protein  22.47 
 
 		 453 aa  50.4  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0440455  normal  0.0476196 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1087  alpha/beta hydrolase fold protein  22.89 
 
 		 245 aa  49.7  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0523898  normal  0.954451 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1760  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 		 235 aa  49.7  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000242559  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  24.58 
 
 		 265 aa  49.7  0.00006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4521  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 270 aa  49.3  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.78404  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0643  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase  23.92 
 
 		 267 aa  49.3  0.00008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1147  alpha/beta hydrolase fold  27.42 
 
 		 369 aa  48.9  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.255082  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1164  alpha/beta hydrolase fold  27.42 
 
 		 369 aa  48.9  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.428268 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0831  alpha/beta hydrolase fold protein  26.46 
 
 		 344 aa  48.9  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1174  alpha/beta hydrolase fold  27.42 
 
 		 369 aa  48.9  0.00009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.326598  normal  0.0488033 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12729  hydrolase  23.48 
 
 		 341 aa  48.9  0.00009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0560  alpha/beta hydrolase fold protein  25.62 
 
 		 390 aa  48.5  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.747431 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2743  alpha/beta hydrolase fold  27.69 
 
 		 331 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.529791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  23.64 
 
 		 301 aa  48.9  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  24.22 
 
 		 286 aa  48.9  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2404  alpha/beta hydrolase fold  38.36 
 
 		 301 aa  48.9  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367269 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34840  putative non-ribosomal peptide synthetase  26.63 
 
 		 2125 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4206  3-oxoadipate enol-lactonase  23.05 
 
 		 268 aa  48.9  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1900  putative hydrolase  32.32 
 
 		 275 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.118605  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5127  alpha/beta hydrolase fold  28.07 
 
 		 249 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22730  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  24.88 
 
 		 277 aa  48.5  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0878  alpha/beta hydrolase fold  28.23 
 
 		 317 aa  48.5  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0136792  hitchhiker  0.00000592996 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29320  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  25.2 
 
 		 248 aa  47.8  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3829  alpha/beta hydrolase fold  25.38 
 
 		 331 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1902  EstC  29 
 
 		 235 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00691738  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1857  3-oxoadipate enol-lactonase  33.64 
 
 		 260 aa  47.8  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.115671  normal  0.0686473 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2076  alpha/beta hydrolase fold  22.89 
 
 		 268 aa  48.1  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.484509 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1269  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  26.41 
 
 		 256 aa  47.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000468275 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22460  alpha/beta family hydrolase  32.32 
 
 		 275 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.241397  hitchhiker  0.0000000538784 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2691  3-oxoadipate enol-lactonase  20.97 
 
 		 266 aa  47.8  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000109702  normal  0.164043 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0531  alpha/beta hydrolase fold  22.78 
 
 		 264 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0176995 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2970  alpha/beta hydrolase fold protein  27.69 
 
 		 331 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5020  3-oxoadipate enol-lactonase  27.09 
 
 		 256 aa  47.8  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.42347 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4937  alpha/beta hydrolase fold protein  29.09 
 
 		 258 aa  47.4  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.451506  normal  0.754378 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1540  putative hydrolase  27.35 
 
 		 264 aa  47.4  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.153847  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5546  alpha/beta hydrolase fold protein  22.09 
 
 		 288 aa  47.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.532072 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0728  alpha/beta hydrolase fold  25.11 
 
 		 336 aa  47.4  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000117195  normal  0.409644 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1230  alpha/beta hydrolase fold  24.38 
 
 		 261 aa  46.6  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6602  alpha/beta hydrolase fold  24.38 
 
 		 261 aa  46.6  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.472817  normal  0.1504 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22090  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  33.72 
 
 		 285 aa  46.6  0.0005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00622193 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2661  alpha/beta hydrolase fold protein  33.07 
 
 		 282 aa  46.6  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.370898  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  25.41 
 
 		 273 aa  46.6  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6126  3-oxoadipate enol-lactonase  22.95 
 
 		 263 aa  45.8  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0174  cyclic nucleotide-binding protein  25 
 
 		 456 aa  46.2  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000271627  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>