41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0841 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0841  alpha/beta family hydrolase  100 
 
 		 266 aa  535  1e-151  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0266055 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4526  alpha/beta hydrolase fold  92.11 
 
 		 266 aa  462  1e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.580548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4625  alpha/beta hydrolase fold protein  62.92 
 
 		 278 aa  292  5e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.178751 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1284  alpha/beta hydrolase fold  54.05 
 
 		 272 aa  262  4e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.802903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3438  alpha/beta hydrolase fold  54.33 
 
 		 246 aa  258  7e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.410588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4189  putative alpha/beta superfamily hydrolase  54.14 
 
 		 258 aa  245  6.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4290  alpha/beta fold family hydrolase  53.25 
 
 		 250 aa  221  7e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0052  hydrolase or acyltransferase-like protein  47.41 
 
 		 263 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.357757  normal  0.185343 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0369  alpha/beta fold family hydrolase  39.45 
 
 		 263 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3537  alpha/beta fold family hydrolase  41.11 
 
 		 245 aa  154  2e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2902  alpha/beta hydrolase fold  39.13 
 
 		 261 aa  146  3e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3296  alpha/beta fold family hydrolase  37.15 
 
 		 247 aa  129  4.0000000000000003e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.26426 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2186  hydrolase  32 
 
 		 200 aa  105  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.549707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2471  alpha/beta fold family hydrolase  31.87 
 
 		 289 aa  97.8  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.351444  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1976  alpha/beta fold family hydrolase  29.44 
 
 		 292 aa  95.1  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1743  alpha/beta hydrolase fold protein  30.92 
 
 		 318 aa  92  9e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.168912  hitchhiker  0.00128876 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2353  alpha/beta hydrolase fold  30.4 
 
 		 278 aa  90.9  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.111033  normal  0.169914 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2717  alpha/beta hydrolase fold  30.52 
 
 		 318 aa  91.3  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.572547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1880  alpha/beta hydrolase fold  29.41 
 
 		 279 aa  89  7e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2642  alpha/beta hydrolase fold  30.52 
 
 		 309 aa  89  8e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3018  alpha/beta hydrolase fold  32.02 
 
 		 262 aa  88.6  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2281  alpha/beta hydrolase fold  29.67 
 
 		 278 aa  87.4  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2603  alpha/beta hydrolase fold  30.12 
 
 		 313 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0775  alpha/beta hydrolase fold  30.23 
 
 		 264 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1078  alpha/beta hydrolase fold protein  23.61 
 
 		 253 aa  54.3  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2691  3-oxoadipate enol-lactonase  25.56 
 
 		 266 aa  48.9  0.00009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000109702  normal  0.164043 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5034  alpha/beta hydrolase fold  27.67 
 
 		 245 aa  48.5  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.246074  normal  0.671643 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4312  alpha/beta hydrolase fold  36.49 
 
 		 333 aa  47  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.312071  normal  0.695125 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3014  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 		 340 aa  46.2  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2404  alpha/beta hydrolase fold  30.39 
 
 		 277 aa  45.8  0.0007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3361  alpha/beta hydrolase fold  28.04 
 
 		 340 aa  44.3  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.013073  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4363  alpha/beta hydrolase fold protein  26.9 
 
 		 239 aa  44.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3547  alpha/beta hydrolase fold protein  28.7 
 
 		 463 aa  44.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.121597  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4098  protein of unknown function UPF0227  42.86 
 
 		 222 aa  43.9  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0244211  normal  0.0242284 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20960  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  41.86 
 
 		 269 aa  43.1  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4453  alpha/beta hydrolase fold  27.43 
 
 		 279 aa  43.1  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522171 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1303  alpha/beta hydrolase fold protein  28.42 
 
 		 299 aa  42.7  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.427571  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2270  alpha/beta hydrolase fold  29.27 
 
 		 298 aa  42.4  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1097  homoserine O-acetyltransferase  40.32 
 
 		 403 aa  42.4  0.008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.076735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3630  bioH protein  26.05 
 
 		 259 aa  42  0.009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2443  alpha/beta hydrolase fold  29.61 
 
 		 275 aa  42.4  0.009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.752916  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>