44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_1880 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_1880  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 279 aa  576  1.0000000000000001e-163  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1976  alpha/beta fold family hydrolase  36.23 
 
 		 292 aa  186  3e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1743  alpha/beta hydrolase fold protein  39.93 
 
 		 318 aa  186  4e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.168912  hitchhiker  0.00128876 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2717  alpha/beta hydrolase fold  39.56 
 
 		 318 aa  185  7e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.572547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2353  alpha/beta hydrolase fold  36.96 
 
 		 278 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.111033  normal  0.169914 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2642  alpha/beta hydrolase fold  39.56 
 
 		 309 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2281  alpha/beta hydrolase fold  37.68 
 
 		 278 aa  180  2e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2471  alpha/beta fold family hydrolase  37.05 
 
 		 289 aa  179  4e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.351444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3018  alpha/beta hydrolase fold  38.85 
 
 		 262 aa  177  1e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2603  alpha/beta hydrolase fold  38.83 
 
 		 313 aa  177  1e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0775  alpha/beta hydrolase fold  36.26 
 
 		 264 aa  159  4e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0052  hydrolase or acyltransferase-like protein  31.29 
 
 		 263 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.357757  normal  0.185343 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2902  alpha/beta hydrolase fold  30.32 
 
 		 261 aa  102  8e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1284  alpha/beta hydrolase fold  29.47 
 
 		 272 aa  99.4  6e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.802903  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0369  alpha/beta fold family hydrolase  27.96 
 
 		 263 aa  98.2  1e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3296  alpha/beta fold family hydrolase  28.57 
 
 		 247 aa  94  3e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.26426 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0841  alpha/beta family hydrolase  29.78 
 
 		 266 aa  87.4  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0266055 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3438  alpha/beta hydrolase fold  27.11 
 
 		 246 aa  79  0.00000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.410588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4526  alpha/beta hydrolase fold  27.24 
 
 		 266 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.580548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4625  alpha/beta hydrolase fold protein  27.97 
 
 		 278 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.178751 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2186  hydrolase  28.19 
 
 		 200 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.549707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3537  alpha/beta fold family hydrolase  27.04 
 
 		 245 aa  72.4  0.000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4290  alpha/beta fold family hydrolase  25.37 
 
 		 250 aa  65.5  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  23.32 
 
 		 277 aa  58.9  0.00000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0693  alpha/beta hydrolase fold  20.85 
 
 		 258 aa  49.3  0.00008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2308  alpha/beta fold family hydrolase  24.44 
 
 		 283 aa  48.9  0.00009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0901  alpha/beta hydrolase fold  26.92 
 
 		 360 aa  47.8  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4122  alpha/beta hydrolase fold protein  24.32 
 
 		 287 aa  47  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3042  Alpha/beta hydrolase  29.59 
 
 		 380 aa  45.8  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.440112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4189  putative alpha/beta superfamily hydrolase  39.66 
 
 		 258 aa  45.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4731  alpha/beta hydrolase fold  24.9 
 
 		 287 aa  45.4  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.807147  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0273  alpha/beta fold family hydrolase  21.07 
 
 		 258 aa  45.1  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00000365907  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5112  alpha/beta hydrolase fold  24.29 
 
 		 300 aa  44.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29320  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  23.72 
 
 		 248 aa  44.3  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4521  alpha/beta hydrolase fold  33.67 
 
 		 270 aa  43.5  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.78404  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1863  hydrolase, alpha/beta fold family  33.33 
 
 		 286 aa  43.9  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.67904  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1528  alpha/beta hydrolase fold  22.74 
 
 		 278 aa  43.9  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.241032 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0446  3-oxoadipate enol-lactonase  24.18 
 
 		 264 aa  43.5  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1149  alpha/beta hydrolase fold protein  24.1 
 
 		 265 aa  43.1  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2216  alpha/beta fold family hydrolase  33.33 
 
 		 294 aa  42.7  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.111084  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  27.05 
 
 		 259 aa  42.4  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0105  alpha/beta hydrolase  26.3 
 
 		 328 aa  42.4  0.009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00875507  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2821  alpha/beta hydrolase fold  27.64 
 
 		 298 aa  42.4  0.009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.229775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0442  alpha/beta hydrolase fold protein  22.78 
 
 		 334 aa  42.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.544577  normal  0.471208 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>