50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4290 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4290  alpha/beta fold family hydrolase  100 
 
 		 250 aa  499  1e-140  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4189  putative alpha/beta superfamily hydrolase  63.41 
 
 		 258 aa  293  2e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1284  alpha/beta hydrolase fold  51.38 
 
 		 272 aa  235  6e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.802903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0841  alpha/beta family hydrolase  53.25 
 
 		 266 aa  232  5e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0266055 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4526  alpha/beta hydrolase fold  50.81 
 
 		 266 aa  217  1e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.580548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4625  alpha/beta hydrolase fold protein  52 
 
 		 278 aa  216  2e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.178751 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3438  alpha/beta hydrolase fold  49.79 
 
 		 246 aa  216  2e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.410588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0052  hydrolase or acyltransferase-like protein  50.2 
 
 		 263 aa  206  3e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.357757  normal  0.185343 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0369  alpha/beta fold family hydrolase  40.08 
 
 		 263 aa  152  4e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3537  alpha/beta fold family hydrolase  40.17 
 
 		 245 aa  144  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2186  hydrolase  32.68 
 
 		 200 aa  122  4e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.549707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2902  alpha/beta hydrolase fold  32.66 
 
 		 261 aa  122  4e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1976  alpha/beta fold family hydrolase  33.88 
 
 		 292 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2353  alpha/beta hydrolase fold  34.73 
 
 		 278 aa  120  3e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.111033  normal  0.169914 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2471  alpha/beta fold family hydrolase  34.73 
 
 		 289 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.351444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3296  alpha/beta fold family hydrolase  33.2 
 
 		 247 aa  114  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.26426 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2717  alpha/beta hydrolase fold  34 
 
 		 318 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.572547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2281  alpha/beta hydrolase fold  33.05 
 
 		 278 aa  108  1e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2642  alpha/beta hydrolase fold  33.2 
 
 		 309 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1743  alpha/beta hydrolase fold protein  34.26 
 
 		 318 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.168912  hitchhiker  0.00128876 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3018  alpha/beta hydrolase fold  32.53 
 
 		 262 aa  106  4e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2603  alpha/beta hydrolase fold  32.4 
 
 		 313 aa  102  8e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0775  alpha/beta hydrolase fold  30.68 
 
 		 264 aa  94.7  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1880  alpha/beta hydrolase fold  25.37 
 
 		 279 aa  76.3  0.0000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1078  alpha/beta hydrolase fold protein  24.54 
 
 		 253 aa  59.3  0.00000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3961  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 260 aa  52  0.000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.611478 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3719  alpha/beta hydrolase fold  33.59 
 
 		 260 aa  52  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.815141  hitchhiker  0.00169195 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1756  alpha/beta hydrolase fold  33.08 
 
 		 260 aa  49.7  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6060  esterase/lipase  27.22 
 
 		 265 aa  49.7  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3175  hypothetical protein  32.84 
 
 		 260 aa  49.3  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.567712  normal  0.0913717 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1468  alpha/beta hydrolase fold  30.61 
 
 		 340 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.890362 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3230  Alpha/beta hydrolase fold  24.82 
 
 		 289 aa  47.4  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.95582  normal  0.900687 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4562  alpha/beta hydrolase fold protein  42.47 
 
 		 260 aa  45.8  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3127  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 		 265 aa  44.7  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.715339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1133  alpha/beta hydrolase fold  35.64 
 
 		 271 aa  45.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.03617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5500  putative prolyl aminopeptidase  26.04 
 
 		 291 aa  43.9  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0980519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3829  alpha/beta hydrolase fold  29.9 
 
 		 331 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1561  hydrolase protein  31.3 
 
 		 274 aa  44.3  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1992  alpha/beta hydrolase fold  32.06 
 
 		 274 aa  44.3  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.45941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2691  3-oxoadipate enol-lactonase  27.9 
 
 		 266 aa  43.9  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000109702  normal  0.164043 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1662  alpha/beta hydrolase fold protein  32.56 
 
 		 274 aa  43.9  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.665083  normal  0.0127757 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0396  alpha/beta hydrolase fold protein  30.26 
 
 		 255 aa  44.3  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.075233 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0135  alpha/beta hydrolase fold  28.64 
 
 		 265 aa  43.9  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3884  alpha/beta hydrolase fold  31.58 
 
 		 341 aa  43.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.447806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27800  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  33.33 
 
 		 301 aa  43.1  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.245903  normal  0.787751 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1252  alpha/beta fold hydrolase  34.65 
 
 		 274 aa  42.7  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0828608  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1540  putative hydrolase  36.45 
 
 		 264 aa  42.7  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.153847  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1303  alpha/beta hydrolase fold protein  30.65 
 
 		 299 aa  42.4  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.427571  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2101  alpha/beta hydrolase fold  36.08 
 
 		 285 aa  42.4  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.715377  normal  0.912757 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1838  alpha/beta hydrolase fold  27.59 
 
 		 333 aa  42  0.009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.886983  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>